RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480416.1

TNS1-215, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 2

Gene TNS1, Length 335 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-215ENST00000480416 CHADLQ6NUI6 762 aa6.89□□□□□ -1.31
TNS1-215ENST00000480416 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa6.89□□□□□ -1.31
TNS1-215ENST00000480416 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa6.89□□□□□ -1.31
TNS1-215ENST00000480416 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa6.89□□□□□ -1.31
TNS1-215ENST00000480416 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
TNS1-215ENST00000480416 C19orf67A6NJJ6 358 aa6.87□□□□□ -1.31
TNS1-215ENST00000480416 CYB5RLQ6IPT4 315 aa6.87□□□□□ -1.31
TNS1-215ENST00000480416 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
TNS1-215ENST00000480416 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
TNS1-215ENST00000480416 CLCN6P51797 869 aa6.83□□□□□ -1.32
TNS1-215ENST00000480416 PDS5BQ9NTI5 1447 aa6.82□□□□□ -1.32
TNS1-215ENST00000480416 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa6.82□□□□□ -1.32
TNS1-215ENST00000480416 PLEKHG5O94827 1062 aa6.81□□□□□ -1.32
TNS1-215ENST00000480416 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP6.81□□□□□ -1.32
TNS1-215ENST00000480416 CD44P16070 742 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
TNS1-215ENST00000480416 ARHGEF11O15085 1522 aa6.81□□□□□ -1.32
TNS1-215ENST00000480416 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
TNS1-215ENST00000480416 CREBZFQ9NS37 354 aa6.8□□□□□ -1.32
TNS1-215ENST00000480416 HMGXB3Q12766 1538 aa6.8□□□□□ -1.32
TNS1-215ENST00000480416 PROM2Q8N271 834 aa6.79□□□□□ -1.32
TNS1-215ENST00000480416 MRC2Q9UBG0 1479 aa6.79□□□□□ -1.32
TNS1-215ENST00000480416 EVX2Q03828 476 aa6.78□□□□□ -1.32
TNS1-215ENST00000480416 WDR62O43379 1518 aa6.77□□□□□ -1.33
TNS1-215ENST00000480416 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
TNS1-215ENST00000480416 SMARCA4P51532 1647 aa6.75□□□□□ -1.33
TNS1-215ENST00000480416 CADPSQ9ULU8 1353 aa6.74□□□□□ -1.33
TNS1-215ENST00000480416 GABBR2O75899 941 aa6.74□□□□□ -1.33
TNS1-215ENST00000480416 ZRANB1Q9UGI0 708 aa6.73□□□□□ -1.33
TNS1-215ENST00000480416 ARAP1Q96P48 1450 aa6.73□□□□□ -1.33
TNS1-215ENST00000480416 FKBP8Q14318 412 aa6.72□□□□□ -1.33
TNS1-215ENST00000480416 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
TNS1-215ENST00000480416 MIER1Q8N108 512 aa6.7□□□□□ -1.34
TNS1-215ENST00000480416 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
TNS1-215ENST00000480416 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
TNS1-215ENST00000480416 PLCD3Q8N3E9 789 aa6.68□□□□□ -1.34
TNS1-215ENST00000480416 FBXO3Q9UK99 471 aa6.67□□□□□ -1.34
TNS1-215ENST00000480416 CEP164Q9UPV0 1460 aa6.66□□□□□ -1.34
TNS1-215ENST00000480416 DCBLD2Q96PD2 775 aa6.66□□□□□ -1.34
TNS1-215ENST00000480416 FANCD2Q9BXW9 1451 aa6.66□□□□□ -1.34
TNS1-215ENST00000480416 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
TNS1-215ENST00000480416 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
TNS1-215ENST00000480416 MROH2BQ7Z745 1585 aa6.64□□□□□ -1.35
TNS1-215ENST00000480416 PEG3Q9GZU2 1588 aa6.64□□□□□ -1.35
TNS1-215ENST00000480416 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa6.61□□□□□ -1.35
TNS1-215ENST00000480416 CHD1O14646 1710 aa6.59□□□□□ -1.35
TNS1-215ENST00000480416 PHF12Q96QT6 1004 aa6.59□□□□□ -1.35
TNS1-215ENST00000480416 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
TNS1-215ENST00000480416 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP6.58□□□□□ -1.363e-9■■■■■ 36.3
TNS1-215ENST00000480416 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
TNS1-215ENST00000480416 CFTRP13569 1480 aa6.55□□□□□ -1.36
TNS1-215ENST00000480416 IFT140Q96RY7 1462 aa6.55□□□□□ -1.36
TNS1-215ENST00000480416 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
TNS1-215ENST00000480416 FAM212AQ96EL1 285 aa6.55□□□□□ -1.36
TNS1-215ENST00000480416 WIZO95785 1651 aa6.55□□□□□ -1.36
TNS1-215ENST00000480416 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
TNS1-215ENST00000480416 LHX8Q68G74 356 aa6.54□□□□□ -1.36
TNS1-215ENST00000480416 CCDC61Q9Y6R9 512 aa6.53□□□□□ -1.36
TNS1-215ENST00000480416 POTEIP0CG38 1075 aa6.52□□□□□ -1.37
TNS1-215ENST00000480416 RASEFQ8IZ41 740 aa6.52□□□□□ -1.37
TNS1-215ENST00000480416 KLHL34Q8N239 644 aa6.51□□□□□ -1.37
TNS1-215ENST00000480416 MS4A3Q96HJ5 214 aa6.51□□□□□ -1.37
TNS1-215ENST00000480416 VASPP50552 380 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
TNS1-215ENST00000480416 KIF12Q96FN5 646 aa6.5□□□□□ -1.37
TNS1-215ENST00000480416 SGIP1Q9BQI5 828 aa6.5□□□□□ -1.37
TNS1-215ENST00000480416 CLASP1Q7Z460 1538 aa6.49□□□□□ -1.37
TNS1-215ENST00000480416 TOPBP1Q92547 1522 aa6.49□□□□□ -1.37
TNS1-215ENST00000480416 NUBP1P53384 320 aa6.48□□□□□ -1.37
TNS1-215ENST00000480416 GAPVD1Q14C86 1478 aa6.47□□□□□ -1.37
TNS1-215ENST00000480416 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
TNS1-215ENST00000480416 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
TNS1-215ENST00000480416 SLC39A7Q92504 469 aa6.47□□□□□ -1.37
TNS1-215ENST00000480416 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.37
TNS1-215ENST00000480416 MAP3K13O43283 966 aa6.46□□□□□ -1.38
TNS1-215ENST00000480416 C7P10643 843 aa6.46□□□□□ -1.38
TNS1-215ENST00000480416 DCAF8Q5TAQ9 597 aa6.46□□□□□ -1.38
TNS1-215ENST00000480416 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
TNS1-215ENST00000480416 KIF13AQ9H1H9 1805 aa6.46□□□□□ -1.38
TNS1-215ENST00000480416 ERCC6L2Q5T890 1561 aa6.45□□□□□ -1.38
TNS1-215ENST00000480416 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
TNS1-215ENST00000480416 TIE1P35590 1138 aa6.45□□□□□ -1.38
TNS1-215ENST00000480416 GSE1Q14687 1217 aa6.45□□□□□ -1.38
TNS1-215ENST00000480416 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa6.45□□□□□ -1.38
TNS1-215ENST00000480416 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa6.45□□□□□ -1.38
TNS1-215ENST00000480416 ILDR2Q71H61 639 aa6.44□□□□□ -1.38
TNS1-215ENST00000480416 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa6.44□□□□□ -1.38
TNS1-215ENST00000480416 FAM69CQ0P6D2 419 aa6.43□□□□□ -1.38
TNS1-215ENST00000480416 FBXO41Q8TF61 875 aa6.43□□□□□ -1.38
TNS1-215ENST00000480416 METRNQ9UJH8 293 aa6.42□□□□□ -1.38
TNS1-215ENST00000480416 SYNJ1O43426 1573 aa6.41□□□□□ -1.38
TNS1-215ENST00000480416 MAMSTRQ6ZN01 415 aa6.41□□□□□ -1.38
TNS1-215ENST00000480416 HECW2Q9P2P5 1572 aa6.4□□□□□ -1.38
TNS1-215ENST00000480416 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
TNS1-215ENST00000480416 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
TNS1-215ENST00000480416 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
TNS1-215ENST00000480416 SPOCK2Q92563 424 aa6.39□□□□□ -1.39
TNS1-215ENST00000480416 SEC24BO95487 1268 aa6.38□□□□□ -1.39
TNS1-215ENST00000480416 IER5LQ5T953 404 aa6.38□□□□□ -1.39
TNS1-215ENST00000480416 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
TNS1-215ENST00000480416 SOGA1O94964 1423 aa6.38□□□□□ -1.39
TNS1-215ENST00000480416 LMTK3Q96Q04 1460 aa6.38□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms