RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428584.5

TTC28-AS1-207, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC28-AS1, Length 5,859 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-207ENST00000428584 BECN1Q14457 450 aa19.74■□□□□ 0.75
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TTC28-AS1-207ENST00000428584 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GOLGA3Q08378 1498 aa19.7■□□□□ 0.74
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ANP32EQ9BTT0 268 aa19.68■□□□□ 0.74
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa19.66■□□□□ 0.74
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PLPPR3Q6T4P5 718 aa19.66■□□□□ 0.74
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP19.66■□□□□ 0.74
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TTC28-AS1-207ENST00000428584 CEP162Q5TB80 1403 aa19.63■□□□□ 0.73
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TTC28-AS1-207ENST00000428584 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP19.61■□□□□ 0.73
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TTC28-AS1-207ENST00000428584 MYO15BQ96JP2 1530 aa19.55■□□□□ 0.72
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CDCA8Q53HL2 280 aa19.55■□□□□ 0.72
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CFAP53Q96M91 514 aa19.53■□□□□ 0.72
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TTC28-AS1-207ENST00000428584 KIF27Q86VH2 1401 aa19.45■□□□□ 0.7
TTC28-AS1-207ENST00000428584 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP19.45■□□□□ 0.7
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TNIKQ9UKE5 1360 aa19.45■□□□□ 0.7
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CEP164Q9UPV0 1460 aa19.44■□□□□ 0.7
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PPP4R2Q9NY27 417 aa19.44■□□□□ 0.7
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP19.44■□□□□ 0.7
TTC28-AS1-207ENST00000428584 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP19.43■□□□□ 0.7
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TTC28-AS1-207ENST00000428584 KCNH8Q96L42 1107 aa19.42■□□□□ 0.7
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CARD11Q9BXL7 1154 aa19.42■□□□□ 0.7
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TTC28-AS1-207ENST00000428584 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP19.4■□□□□ 0.7
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TTC28-AS1-207ENST00000428584 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa19.35■□□□□ 0.69
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP19.33■□□□□ 0.68
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TTC28-AS1-207ENST00000428584 NUDCQ9Y266 331 aa19.32■□□□□ 0.68
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TTC28-AS1-207ENST00000428584 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP19.29■□□□□ 0.68
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa19.28■□□□□ 0.68
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TTC28-AS1-207ENST00000428584 FHAD1B1AJZ9 1412 aa19.25■□□□□ 0.67
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP19.24■□□□□ 0.67
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TTC28-AS1-207ENST00000428584 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa19.22■□□□□ 0.67
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TTC28-AS1-207ENST00000428584 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP19.2■□□□□ 0.66
TTC28-AS1-207ENST00000428584 POGKQ9P215 609 aa19.2■□□□□ 0.66
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CCER2I3L3R5 266 aa19.19■□□□□ 0.66
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa19.19■□□□□ 0.66
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ERCC6Q03468 1493 aa19.18■□□□□ 0.66
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KANK1Q14678 1352 aa19.18■□□□□ 0.66
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TMF1P82094 1093 aa19.17■□□□□ 0.66
TTC28-AS1-207ENST00000428584 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa19.17■□□□□ 0.66
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TTC28-AS1-207ENST00000428584 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
TTC28-AS1-207ENST00000428584 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PLCB2Q00722 1185 aa19.12■□□□□ 0.65
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TTC28-AS1-207ENST00000428584 NRDCO43847 1150 aa19.1■□□□□ 0.65
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CFAP44Q96MT7 982 aa19.1■□□□□ 0.65
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SETD5Q9C0A6 1442 aa19.08■□□□□ 0.65
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FGD1P98174 961 aa19.08■□□□□ 0.64
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MCCP23508 829 aa19.07■□□□□ 0.64
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KCNJ4P48050 445 aa19.07■□□□□ 0.64
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DCAF11Q8TEB1 546 aa19.07■□□□□ 0.64
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa19.05■□□□□ 0.64
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP19.05■□□□□ 0.64
TTC28-AS1-207ENST00000428584 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa19.05■□□□□ 0.64
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MSNP26038 577 aaKnown RBP19.03■□□□□ 0.64
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP19.03■□□□□ 0.64
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa19.03■□□□□ 0.64
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DEKP35659 375 aaKnown RBP19.03■□□□□ 0.64
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.64
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CUX2O14529 1486 aa19.01■□□□□ 0.63
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