RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384717.1

RNU6-520P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 520, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-520P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-520P-201ENST00000384717 HS3ST6Q96QI5 342 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-520P-201ENST00000384717 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-520P-201ENST00000384717 PRR29P0C7W0 189 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-520P-201ENST00000384717 MS4A3Q96HJ5 214 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-520P-201ENST00000384717 MYT1LQ9UL68 1186 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-520P-201ENST00000384717 FAM205CA6NFA0 338 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-520P-201ENST00000384717 SPDYE2BA6NHP3 402 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-520P-201ENST00000384717 SPDYE6P0CI01 402 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-520P-201ENST00000384717 EMP3P54852 163 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-520P-201ENST00000384717 SPDYE2Q495Y8 402 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-520P-201ENST00000384717 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-520P-201ENST00000384717 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
RNU6-520P-201ENST00000384717 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
RNU6-520P-201ENST00000384717 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-520P-201ENST00000384717 LCE2BO14633 110 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-520P-201ENST00000384717 SSUH2Q9Y2M2 353 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-520P-201ENST00000384717 TRPC6Q9Y210 931 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-520P-201ENST00000384717 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
RNU6-520P-201ENST00000384717 SNPHO15079 494 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-520P-201ENST00000384717 SEC24BO95487 1268 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-520P-201ENST00000384717 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
RNU6-520P-201ENST00000384717 Q6ZNB5 142 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-520P-201ENST00000384717 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-520P-201ENST00000384717 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-520P-201ENST00000384717 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-520P-201ENST00000384717 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-520P-201ENST00000384717 CREBZFQ9NS37 354 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-520P-201ENST00000384717 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-520P-201ENST00000384717 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-520P-201ENST00000384717 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-520P-201ENST00000384717 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP3.1□□□□□ -1.91
RNU6-520P-201ENST00000384717 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-520P-201ENST00000384717 RGS20O76081 388 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-520P-201ENST00000384717 TTLL13PA6NNM8 815 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-520P-201ENST00000384717 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
RNU6-520P-201ENST00000384717 PTGER2P43116 358 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-520P-201ENST00000384717 TIE1P35590 1138 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-520P-201ENST00000384717 IER5LQ5T953 404 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-520P-201ENST00000384717 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-520P-201ENST00000384717 TRAF7Q6Q0C0 670 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-520P-201ENST00000384717 ERBB3P21860 1342 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-520P-201ENST00000384717 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-520P-201ENST00000384717 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-520P-201ENST00000384717 HCSTQ9UBK5 93 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-520P-201ENST00000384717 TRIM35Q9UPQ4 493 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-520P-201ENST00000384717 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-520P-201ENST00000384717 KIF12Q96FN5 646 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-520P-201ENST00000384717 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-520P-201ENST00000384717 ZNF787Q6DD87 383 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-520P-201ENST00000384717 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-520P-201ENST00000384717 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-520P-201ENST00000384717 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-520P-201ENST00000384717 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-520P-201ENST00000384717 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-520P-201ENST00000384717 ZNF687Q8N1G0 1237 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-520P-201ENST00000384717 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-520P-201ENST00000384717 PLCG2P16885 1265 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-520P-201ENST00000384717 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-520P-201ENST00000384717 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-520P-201ENST00000384717 CCDC61Q9Y6R9 512 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-520P-201ENST00000384717 A0A0G2JS52 829 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-520P-201ENST00000384717 FBLN2P98095 1184 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-520P-201ENST00000384717 MAP3K13O43283 966 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-520P-201ENST00000384717 XP32Q5T750 250 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-520P-201ENST00000384717 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
RNU6-520P-201ENST00000384717 STK17AQ9UEE5 414 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-520P-201ENST00000384717 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP2.91□□□□□ -1.94
RNU6-520P-201ENST00000384717 IFFO2Q5TF58 517 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-520P-201ENST00000384717 LCE3BQ5TA77 95 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-520P-201ENST00000384717 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-520P-201ENST00000384717 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-520P-201ENST00000384717 POTEEQ6S8J3 1075 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-520P-201ENST00000384717 TREML4Q6UXN2 200 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-520P-201ENST00000384717 OCEL1Q9H607 264 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-520P-201ENST00000384717 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-520P-201ENST00000384717 GFRA3O60609 400 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-520P-201ENST00000384717 POTECB2RU33 542 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-520P-201ENST00000384717 LAPTM4AQ15012 233 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-520P-201ENST00000384717 C3orf67Q6ZVT6 689 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-520P-201ENST00000384717 ZNF710Q8N1W2 664 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-520P-201ENST00000384717 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-520P-201ENST00000384717 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-520P-201ENST00000384717 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
RNU6-520P-201ENST00000384717 TMEM106CQ9BVX2 250 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-520P-201ENST00000384717 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-520P-201ENST00000384717 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
RNU6-520P-201ENST00000384717 AXIN2Q9Y2T1 843 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-520P-201ENST00000384717 GPR153Q6NV75 609 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-520P-201ENST00000384717 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-520P-201ENST00000384717 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-520P-201ENST00000384717 DOK7Q18PE1 504 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-520P-201ENST00000384717 LCE2CQ5TA81 110 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-520P-201ENST00000384717 WIPF1O43516 503 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-520P-201ENST00000384717 PTPN5P54829 565 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-520P-201ENST00000384717 IFNL1Q8IU54 200 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-520P-201ENST00000384717 ADGRD1Q6QNK2 874 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-520P-201ENST00000384717 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-520P-201ENST00000384717 BTBD11A6QL63 1104 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-520P-201ENST00000384717 HRO43593 1189 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-520P-201ENST00000384717 LORP23490 312 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms