RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362861.1

RNU6-1079P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1079, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-1079P, Length 110 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MYT1LQ9UL68 1186 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SNPHO15079 494 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-1079P-201ENST00000362861 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
RNU6-1079P-201ENST00000362861 POTEFA5A3E0 1075 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-1079P-201ENST00000362861 EMP3P54852 163 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-1079P-201ENST00000362861 HS3ST6Q96QI5 342 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NPM3O75607 178 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PHF12Q96QT6 1004 aa3.98□□□□□ -1.77
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RNU6-1079P-201ENST00000362861 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
RNU6-1079P-201ENST00000362861 POTEBQ6S5H4 581 aa3.95□□□□□ -1.78
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RNU6-1079P-201ENST00000362861 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SEC24BO95487 1268 aa3.91□□□□□ -1.78
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RNU6-1079P-201ENST00000362861 RGS20O76081 388 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MS4A3Q96HJ5 214 aa3.9□□□□□ -1.79
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RNU6-1079P-201ENST00000362861 SSUH2Q9Y2M2 353 aa3.85□□□□□ -1.79
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
RNU6-1079P-201ENST00000362861 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
RNU6-1079P-201ENST00000362861 IER5LQ5T953 404 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-1079P-201ENST00000362861 HCSTQ9UBK5 93 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TIE1P35590 1138 aa3.73□□□□□ -1.81
RNU6-1079P-201ENST00000362861 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FBLN2P98095 1184 aa3.71□□□□□ -1.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP3.71□□□□□ -1.82
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RNU6-1079P-201ENST00000362861 ERBB3P21860 1342 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TRAF7Q6Q0C0 670 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CREBZFQ9NS37 354 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PLCG2P16885 1265 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 STK17AQ9UEE5 414 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TTLL13PA6NNM8 815 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LCE2BO14633 110 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LAPTM4AQ15012 233 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZNF787Q6DD87 383 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP3.63□□□□□ -1.83
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa3.63□□□□□ -1.83
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RNU6-1079P-201ENST00000362861 TRPC6Q9Y210 931 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
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RNU6-1079P-201ENST00000362861 IFFO2Q5TF58 517 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZNF687Q8N1G0 1237 aa3.61□□□□□ -1.83
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RNU6-1079P-201ENST00000362861 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KIF12Q96FN5 646 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
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RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZNF710Q8N1W2 664 aa3.53□□□□□ -1.84
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RNU6-1079P-201ENST00000362861 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa3.42□□□□□ -1.86
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RNU6-1079P-201ENST00000362861 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
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RNU6-1079P-201ENST00000362861 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TMEM106CQ9BVX2 250 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FAM181BA6NEQ2 426 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1079P-201ENST00000362861 WIPF1O43516 503 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SGIP1Q9BQI5 828 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PBX2P40425 430 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa3.36□□□□□ -1.87
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RNU6-1079P-201ENST00000362861 ADGRD1Q6QNK2 874 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PTPN5P54829 565 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GPR153Q6NV75 609 aa3.28□□□□□ -1.88
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