RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602319.1

HCG18-242, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

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Gene HCG18, Length 3,342 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-242ENST00000602319 NCOR1O75376 2440 aa7.17□□□□□ -1.26
HCG18-242ENST00000602319 IGHV3-11P01762 117 aa7.17□□□□□ -1.26
HCG18-242ENST00000602319 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
HCG18-242ENST00000602319 RBMY1CP0DJD4 496 aa7.17□□□□□ -1.26
HCG18-242ENST00000602319 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
HCG18-242ENST00000602319 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa7.17□□□□□ -1.26
HCG18-242ENST00000602319 LINC00467Q9BRT7 94 aa7.17□□□□□ -1.26
HCG18-242ENST00000602319 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa7.16□□□□□ -1.26
HCG18-242ENST00000602319 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
HCG18-242ENST00000602319 MGAQ8IWI9 3026 aa7.16□□□□□ -1.26
HCG18-242ENST00000602319 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa7.16□□□□□ -1.26
HCG18-242ENST00000602319 LINC00694P0DN24 101 aa7.16□□□□□ -1.26
HCG18-242ENST00000602319 PF4V1P10720 104 aa7.16□□□□□ -1.26
HCG18-242ENST00000602319 COX7CP15954 63 aa7.16□□□□□ -1.26
HCG18-242ENST00000602319 RPS28P62857 69 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
HCG18-242ENST00000602319 ZNF415Q09FC8 603 aa7.16□□□□□ -1.26
HCG18-242ENST00000602319 COPS9Q8WXC6 57 aa7.16□□□□□ -1.26
HCG18-242ENST00000602319 ZNF318Q5VUA4 2279 aa7.16□□□□□ -1.26
HCG18-242ENST00000602319 POLEQ07864 2286 aa7.16□□□□□ -1.26
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HCG18-242ENST00000602319 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa7.16□□□□□ -1.26
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HCG18-242ENST00000602319 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
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HCG18-242ENST00000602319 K7ENP7 123 aa7.15□□□□□ -1.26
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HCG18-242ENST00000602319 NPC2P61916 151 aa7.15□□□□□ -1.26
HCG18-242ENST00000602319 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
HCG18-242ENST00000602319 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa7.15□□□□□ -1.27
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HCG18-242ENST00000602319 C9orf153Q5TBE3 101 aa7.15□□□□□ -1.27
HCG18-242ENST00000602319 BPESC1Q9GZL8 116 aa7.15□□□□□ -1.27
HCG18-242ENST00000602319 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa7.15□□□□□ -1.27
HCG18-242ENST00000602319 AKAP13Q12802 2813 aa7.15□□□□□ -1.27
HCG18-242ENST00000602319 TMEM89A2RUT3 159 aa7.14□□□□□ -1.27
HCG18-242ENST00000602319 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
HCG18-242ENST00000602319 Q8N2B8 174 aa7.14□□□□□ -1.27
HCG18-242ENST00000602319 PROK1P58294 105 aa7.14□□□□□ -1.27
HCG18-242ENST00000602319 HERVK_113P63121 156 aa7.14□□□□□ -1.27
HCG18-242ENST00000602319 SPINK13Q1W4C9 94 aa7.14□□□□□ -1.27
HCG18-242ENST00000602319 Q6ZSN1 163 aa7.14□□□□□ -1.27
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HCG18-242ENST00000602319 FAM218AQ96MZ4 157 aa7.13□□□□□ -1.27
HCG18-242ENST00000602319 INAFM2P0DMQ5 153 aa7.13□□□□□ -1.27
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HCG18-242ENST00000602319 SMIM1B2RUZ4 78 aa7.12□□□□□ -1.27
HCG18-242ENST00000602319 IGHV3-53P01767 116 aa7.12□□□□□ -1.27
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HCG18-242ENST00000602319 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
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HCG18-242ENST00000602319 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
HCG18-242ENST00000602319 F5H768 121 aa7.12□□□□□ -1.27
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HCG18-242ENST00000602319 BAALC-AS2P0C853 105 aa7.12□□□□□ -1.27
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HCG18-242ENST00000602319 C3orf56Q8N813 242 aa7.12□□□□□ -1.27
HCG18-242ENST00000602319 ATOX1O00244 68 aa7.11□□□□□ -1.27
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HCG18-242ENST00000602319 Q9H8V8 135 aa7.11□□□□□ -1.27
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HCG18-242ENST00000602319 RS1O15537 224 aa7.11□□□□□ -1.27
HCG18-242ENST00000602319 BLCAPP62952 87 aa7.11□□□□□ -1.27
HCG18-242ENST00000602319 C11orf72Q8NBR9 251 aa7.11□□□□□ -1.27
HCG18-242ENST00000602319 SPTBN2O15020 2390 aa7.1□□□□□ -1.27
HCG18-242ENST00000602319 Q6JHZ5 121 aa7.1□□□□□ -1.27
HCG18-242ENST00000602319 H3BUX3 64 aa7.1□□□□□ -1.27
HCG18-242ENST00000602319 C5orf47Q569G3 176 aa7.1□□□□□ -1.27
HCG18-242ENST00000602319 BRD3OSQ6XYD6 125 aa7.1□□□□□ -1.27
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HCG18-242ENST00000602319 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa7.09□□□□□ -1.27
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HCG18-242ENST00000602319 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-242ENST00000602319 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-242ENST00000602319 IL17DQ8TAD2 202 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-242ENST00000602319 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa7.09□□□□□ -1.28
HCG18-242ENST00000602319 WIPF1O43516 503 aa7.09□□□□□ -1.28
HCG18-242ENST00000602319 IGKV3-20P01619 116 aa7.09□□□□□ -1.28
HCG18-242ENST00000602319 RELNP78509 3460 aa7.09□□□□□ -1.28
HCG18-242ENST00000602319 PCNX1Q96RV3 2341 aa7.08□□□□□ -1.28
HCG18-242ENST00000602319 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
HCG18-242ENST00000602319 LY6EQ16553 131 aa7.08□□□□□ -1.28
HCG18-242ENST00000602319 OXLD1Q5BKU9 147 aa7.08□□□□□ -1.28
HCG18-242ENST00000602319 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
HCG18-242ENST00000602319 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa7.07□□□□□ -1.28
HCG18-242ENST00000602319 PRIMA1Q86XR5 153 aa7.07□□□□□ -1.28
HCG18-242ENST00000602319 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa7.07□□□□□ -1.28
HCG18-242ENST00000602319 SMIM9A6NGZ8 99 aa7.07□□□□□ -1.28
HCG18-242ENST00000602319 UBTD1Q9HAC8 227 aa7.07□□□□□ -1.28
HCG18-242ENST00000602319 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
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