RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546891.5

CS-205, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 911 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-205ENST00000546891 IL17DQ8TAD2 202 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-205ENST00000546891 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CS-205ENST00000546891 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-205ENST00000546891 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa7.1□□□□□ -1.27
CS-205ENST00000546891 A0A0B4J2C4 111 aa7.1□□□□□ -1.27
CS-205ENST00000546891 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa7.1□□□□□ -1.27
CS-205ENST00000546891 A0A0J9YXV3 536 aa7.1□□□□□ -1.27
CS-205ENST00000546891 PCP4P48539 62 aa7.1□□□□□ -1.27
CS-205ENST00000546891 TSPEAR-AS2P59090 65 aa7.1□□□□□ -1.27
CS-205ENST00000546891 NDUFA11Q86Y39 141 aa7.1□□□□□ -1.27
CS-205ENST00000546891 C10orf126Q8N4M7 172 aa7.1□□□□□ -1.27
CS-205ENST00000546891 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
CS-205ENST00000546891 CHCHD7Q9BUK0 85 aa7.1□□□□□ -1.27
CS-205ENST00000546891 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa7.1□□□□□ -1.27
CS-205ENST00000546891 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa7.1□□□□□ -1.27
CS-205ENST00000546891 CSMD1Q96PZ7 3565 aa7.1□□□□□ -1.27
CS-205ENST00000546891 CELSR2Q9HCU4 2923 aa7.1□□□□□ -1.27
CS-205ENST00000546891 TRAV4A0A0B4J268 109 aa7.09□□□□□ -1.27
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CS-205ENST00000546891 TSPAN13O95857 204 aa7.09□□□□□ -1.27
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CS-205ENST00000546891 TIRAPP58753 221 aa7.09□□□□□ -1.27
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CS-205ENST00000546891 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
CS-205ENST00000546891 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa7.09□□□□□ -1.27
CS-205ENST00000546891 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
CS-205ENST00000546891 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
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CS-205ENST00000546891 K7EQD1 137 aa7.08□□□□□ -1.28
CS-205ENST00000546891 NDUFA7O95182 113 aa7.08□□□□□ -1.28
CS-205ENST00000546891 APOMO95445 188 aa7.08□□□□□ -1.28
CS-205ENST00000546891 PROK1P58294 105 aa7.08□□□□□ -1.28
CS-205ENST00000546891 UBE2D3P61077 147 aa7.08□□□□□ -1.28
CS-205ENST00000546891 UBE2D2P62837 147 aa7.08□□□□□ -1.28
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CS-205ENST00000546891 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
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CS-205ENST00000546891 NAV2Q8IVL1 2488 aa7.07□□□□□ -1.28
CS-205ENST00000546891 SPG11Q96JI7 2443 aa7.07□□□□□ -1.28
CS-205ENST00000546891 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa7.07□□□□□ -1.28
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CS-205ENST00000546891 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa7.07□□□□□ -1.28
CS-205ENST00000546891 LINC01006Q8NI28 216 aa7.07□□□□□ -1.28
CS-205ENST00000546891 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa7.07□□□□□ -1.28
CS-205ENST00000546891 COPS9Q8WXC6 57 aa7.07□□□□□ -1.28
CS-205ENST00000546891 RNF183Q96D59 192 aa7.07□□□□□ -1.28
CS-205ENST00000546891 SPANXDQ9BXN6 97 aa7.07□□□□□ -1.28
CS-205ENST00000546891 ESM1Q9NQ30 184 aa7.07□□□□□ -1.28
CS-205ENST00000546891 SPANXCQ9NY87 97 aa7.07□□□□□ -1.28
CS-205ENST00000546891 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
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CS-205ENST00000546891 FBN2P35556 2912 aa7.06□□□□□ -1.28
CS-205ENST00000546891 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa7.06□□□□□ -1.28
CS-205ENST00000546891 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.06□□□□□ -1.28
CS-205ENST00000546891 A0A0J9YXY3 114 aa7.06□□□□□ -1.28
CS-205ENST00000546891 A0A1W2PRX2 142 aa7.06□□□□□ -1.28
CS-205ENST00000546891 CFC1BP0CG36 223 aa7.06□□□□□ -1.28
CS-205ENST00000546891 CFC1P0CG37 223 aa7.06□□□□□ -1.28
CS-205ENST00000546891 HERVK_113P63121 156 aa7.06□□□□□ -1.28
CS-205ENST00000546891 Q6ZSN1 163 aa7.06□□□□□ -1.28
CS-205ENST00000546891 Q6ZUT4 128 aa7.06□□□□□ -1.28
CS-205ENST00000546891 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.06□□□□□ -1.28
CS-205ENST00000546891 VSIG2Q96IQ7 327 aa7.06□□□□□ -1.28
CS-205ENST00000546891 NDUFA12Q9UI09 145 aa7.06□□□□□ -1.28
CS-205ENST00000546891 PRO0461Q9UI25 63 aa7.06□□□□□ -1.28
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CS-205ENST00000546891 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
CS-205ENST00000546891 A4D1N5 150 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-205ENST00000546891 H7C423 109 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-205ENST00000546891 M0QXV9 152 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-205ENST00000546891 IGLV1-51P01701 117 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-205ENST00000546891 IFITM1P13164 125 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-205ENST00000546891 HILS1P60008 231 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-205ENST00000546891 KRTAP1-1Q07627 177 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-205ENST00000546891 ZFAND6Q6FIF0 208 aa7.05□□□□□ -1.28
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CS-205ENST00000546891 ERG28Q9UKR5 140 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-205ENST00000546891 CSMD2Q7Z408 3487 aa7.05□□□□□ -1.28
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CS-205ENST00000546891 TEX15Q9BXT5 2789 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-205ENST00000546891 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-205ENST00000546891 SCGB1C2P0DMR2 95 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-205ENST00000546891 PSMB2P49721 201 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-205ENST00000546891 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
CS-205ENST00000546891 WFDC2Q14508 124 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-205ENST00000546891 FAM104AQ969W3 186 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-205ENST00000546891 GTSF1LQ9H1H1 148 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-205ENST00000546891 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-205ENST00000546891 NDUFA1O15239 70 aa7.03□□□□□ -1.28
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