RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487939.1

PTEN-204, Transcript of phosphatase and tensin homolog, humanhuman

TSL 3

Gene PTEN, Length 477 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTEN-204ENST00000487939 STAB2Q8WWQ8 2551 aa-0.46□□□□□ -2.48
PTEN-204ENST00000487939 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa-0.47□□□□□ -2.48
PTEN-204ENST00000487939 CSPG4Q6UVK1 2322 aa-0.47□□□□□ -2.48
PTEN-204ENST00000487939 M0R2Z0 102 aa-0.47□□□□□ -2.48
PTEN-204ENST00000487939 ARPC5O15511 151 aa-0.47□□□□□ -2.48
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PTEN-204ENST00000487939 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP-0.47□□□□□ -2.48
PTEN-204ENST00000487939 SPAG11BQ08648 103 aa-0.47□□□□□ -2.48
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PTEN-204ENST00000487939 C10orf71Q711Q0 1435 aa-0.53□□□□□ -2.49
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PTEN-204ENST00000487939 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa-0.53□□□□□ -2.49
PTEN-204ENST00000487939 COL6A3P12111 3177 aa-0.53□□□□□ -2.49
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PTEN-204ENST00000487939 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa-0.54□□□□□ -2.5
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PTEN-204ENST00000487939 COPZ1P61923 177 aa-0.54□□□□□ -2.5
PTEN-204ENST00000487939 R4GMQ9 66 aa-0.54□□□□□ -2.5
PTEN-204ENST00000487939 SBF2Q86WG5 1849 aa-0.54□□□□□ -2.5
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PTEN-204ENST00000487939 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa-0.55□□□□□ -2.5
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PTEN-204ENST00000487939 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa-0.56□□□□□ -2.5
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PTEN-204ENST00000487939 ALX1Q15699 326 aa-0.57□□□□□ -2.5
PTEN-204ENST00000487939 SMIM4Q8WVI0 70 aa-0.57□□□□□ -2.5
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PTEN-204ENST00000487939 V9GYH0 126 aa-0.57□□□□□ -2.5
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