RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391208.1

RNU6-972P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 972, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-972P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-972P-201ENST00000391208 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP-3.32□□□□□ -2.94
RNU6-972P-201ENST00000391208 MYOM3Q5VTT5 1437 aa-3.32□□□□□ -2.94
RNU6-972P-201ENST00000391208 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa-3.32□□□□□ -2.94
RNU6-972P-201ENST00000391208 AIPO00170 330 aa-3.32□□□□□ -2.94
RNU6-972P-201ENST00000391208 APOA2P02652 100 aa-3.32□□□□□ -2.94
RNU6-972P-201ENST00000391208 CSN2P05814 226 aa-3.32□□□□□ -2.94
RNU6-972P-201ENST00000391208 UBE2D3P61077 147 aa-3.32□□□□□ -2.94
RNU6-972P-201ENST00000391208 UBE2D2P62837 147 aa-3.32□□□□□ -2.94
RNU6-972P-201ENST00000391208 C10orf82Q8WW14 230 aa-3.32□□□□□ -2.94
RNU6-972P-201ENST00000391208 PHB2Q99623 299 aa-3.32□□□□□ -2.94
RNU6-972P-201ENST00000391208 PRNDQ9UKY0 176 aa-3.32□□□□□ -2.94
RNU6-972P-201ENST00000391208 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP-3.33□□□□□ -2.94
RNU6-972P-201ENST00000391208 KNDC1Q76NI1 1749 aa-3.33□□□□□ -2.94
RNU6-972P-201ENST00000391208 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa-3.33□□□□□ -2.94
RNU6-972P-201ENST00000391208 GABARAPH6UMI1 98 aa-3.33□□□□□ -2.94
RNU6-972P-201ENST00000391208 SDC2P34741 201 aa-3.33□□□□□ -2.94
RNU6-972P-201ENST00000391208 TMED2Q15363 201 aa-3.33□□□□□ -2.94
RNU6-972P-201ENST00000391208 HSD17B12Q53GQ0 312 aa-3.33□□□□□ -2.94
RNU6-972P-201ENST00000391208 TMEM170BQ5T4T1 132 aa-3.33□□□□□ -2.94
RNU6-972P-201ENST00000391208 LINC00305Q7Z4B0 112 aa-3.33□□□□□ -2.94
RNU6-972P-201ENST00000391208 USMG5Q96IX5 58 aa-3.33□□□□□ -2.94
RNU6-972P-201ENST00000391208 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP-3.33□□□□□ -2.94
RNU6-972P-201ENST00000391208 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP-3.33□□□□□ -2.94
RNU6-972P-201ENST00000391208 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP-3.33□□□□□ -2.94
RNU6-972P-201ENST00000391208 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP-3.33□□□□□ -2.94
RNU6-972P-201ENST00000391208 MED23Q9ULK4 1368 aa-3.34□□□□□ -2.94
RNU6-972P-201ENST00000391208 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa-3.34□□□□□ -2.94
RNU6-972P-201ENST00000391208 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa-3.34□□□□□ -2.94
RNU6-972P-201ENST00000391208 H3BMG7 143 aa-3.34□□□□□ -2.94
RNU6-972P-201ENST00000391208 CCDC179H3BU77 68 aa-3.34□□□□□ -2.94
RNU6-972P-201ENST00000391208 H7C1C5 153 aa-3.34□□□□□ -2.94
RNU6-972P-201ENST00000391208 PIRTP0C851 137 aa-3.34□□□□□ -2.94
RNU6-972P-201ENST00000391208 LCN6P62502 163 aa-3.34□□□□□ -2.94
RNU6-972P-201ENST00000391208 CNPY4Q8N129 248 aa-3.34□□□□□ -2.94
RNU6-972P-201ENST00000391208 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP-3.34□□□□□ -2.94
RNU6-972P-201ENST00000391208 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP-3.34□□□□□ -2.94
RNU6-972P-201ENST00000391208 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP-3.34□□□□□ -2.94
RNU6-972P-201ENST00000391208 ERICH2A1L162 156 aa-3.35□□□□□ -2.95
RNU6-972P-201ENST00000391208 PIPP12273 146 aaPredicted RBP-3.35□□□□□ -2.95
RNU6-972P-201ENST00000391208 LSM3P62310 102 aaKnown RBP-3.35□□□□□ -2.95
RNU6-972P-201ENST00000391208 COTL1Q14019 142 aa-3.35□□□□□ -2.95
RNU6-972P-201ENST00000391208 HRCT1Q6UXD1 115 aa-3.35□□□□□ -2.95
RNU6-972P-201ENST00000391208 SNX29P2Q8IUI4 249 aa-3.35□□□□□ -2.95
RNU6-972P-201ENST00000391208 UFC1Q9Y3C8 167 aa-3.35□□□□□ -2.95
RNU6-972P-201ENST00000391208 ZFYVE9O95405 1425 aa-3.36□□□□□ -2.95
RNU6-972P-201ENST00000391208 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa-3.36□□□□□ -2.95
RNU6-972P-201ENST00000391208 F8VRH5 84 aa-3.36□□□□□ -2.95
RNU6-972P-201ENST00000391208 G3V2T6 193 aa-3.36□□□□□ -2.95
RNU6-972P-201ENST00000391208 SRP9P49458 86 aaKnown RBP-3.36□□□□□ -2.95
RNU6-972P-201ENST00000391208 LTC4SQ16873 150 aa-3.36□□□□□ -2.95
RNU6-972P-201ENST00000391208 VSTM2AQ8TAG5 236 aa-3.36□□□□□ -2.95
RNU6-972P-201ENST00000391208 ALX1Q15699 326 aa-3.37□□□□□ -2.95
RNU6-972P-201ENST00000391208 LIN52Q52LA3 116 aa-3.37□□□□□ -2.95
RNU6-972P-201ENST00000391208 BTF3L4Q96K17 158 aa-3.37□□□□□ -2.95
RNU6-972P-201ENST00000391208 SLC35B3Q9H1N7 401 aa-3.37□□□□□ -2.95
RNU6-972P-201ENST00000391208 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-972P-201ENST00000391208 MYH3P11055 1940 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-972P-201ENST00000391208 M0QZK8 103 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-972P-201ENST00000391208 CETN3O15182 167 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-972P-201ENST00000391208 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-972P-201ENST00000391208 COX17Q14061 63 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-972P-201ENST00000391208 LELP1Q5T871 98 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-972P-201ENST00000391208 CROCCP2Q86T23 111 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-972P-201ENST00000391208 SSR3Q9UNL2 185 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-972P-201ENST00000391208 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-972P-201ENST00000391208 S4R3F8 94 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-972P-201ENST00000391208 ATMQ13315 3056 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-972P-201ENST00000391208 MAP3K1Q13233 1512 aa-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-972P-201ENST00000391208 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-972P-201ENST00000391208 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-972P-201ENST00000391208 UQCRQO14949 82 aa-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-972P-201ENST00000391208 PPP1R2P41236 205 aa-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-972P-201ENST00000391208 DEFB110Q30KQ9 67 aa-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-972P-201ENST00000391208 CBLN4Q9NTU7 201 aa-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-972P-201ENST00000391208 CRIPTQ9P021 101 aa-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-972P-201ENST00000391208 NDUFA12Q9UI09 145 aa-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-972P-201ENST00000391208 R4GMQ9 66 aa-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-972P-201ENST00000391208 KDM5CP41229 1560 aa-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-972P-201ENST00000391208 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-972P-201ENST00000391208 HSBP1L1C9JCN9 74 aa-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-972P-201ENST00000391208 ARPC5O15511 151 aa-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-972P-201ENST00000391208 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-972P-201ENST00000391208 PPP1R17O96001 155 aa-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-972P-201ENST00000391208 S100A6P06703 90 aa-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-972P-201ENST00000391208 LSM6P62312 80 aaKnown RBP-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-972P-201ENST00000391208 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-972P-201ENST00000391208 Q6AWC8 147 aa-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-972P-201ENST00000391208 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-972P-201ENST00000391208 C9orf16Q9BUW7 83 aa-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-972P-201ENST00000391208 SH3BGRL3Q9H299 93 aa-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-972P-201ENST00000391208 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-972P-201ENST00000391208 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-972P-201ENST00000391208 PXDNQ92626 1479 aa-3.41□□□□□ -2.95
RNU6-972P-201ENST00000391208 SSSCA1O60232 199 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-972P-201ENST00000391208 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-972P-201ENST00000391208 CCDC42Q96M95 316 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-972P-201ENST00000391208 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-972P-201ENST00000391208 STOML2Q9UJZ1 356 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-972P-201ENST00000391208 MT1EP04732 61 aa-3.42□□□□□ -2.96
RNU6-972P-201ENST00000391208 TPM2P07951 284 aa-3.42□□□□□ -2.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 178.5 ms