RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000337004.8

PTDSS1-201, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTDSS1, Length 2,366 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-201ENST00000337004 DNAJC30Q96LL9 226 aa15.64■□□□□ 0.09
PTDSS1-201ENST00000337004 CARD19Q96LW7 228 aa15.64■□□□□ 0.09
PTDSS1-201ENST00000337004 LINC00467Q9BRT7 94 aa15.64■□□□□ 0.09
PTDSS1-201ENST00000337004 MAP6D1Q9H9H5 199 aa15.64■□□□□ 0.09
PTDSS1-201ENST00000337004 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa15.63■□□□□ 0.09
PTDSS1-201ENST00000337004 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa15.63■□□□□ 0.09
PTDSS1-201ENST00000337004 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
PTDSS1-201ENST00000337004 Q9UF83 564 aa15.63■□□□□ 0.09
PTDSS1-201ENST00000337004 Q1RN00 199 aa15.63■□□□□ 0.09
PTDSS1-201ENST00000337004 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa15.62■□□□□ 0.09
PTDSS1-201ENST00000337004 CDIP1Q9H305 208 aa15.62■□□□□ 0.09
PTDSS1-201ENST00000337004 NDUFA12Q9UI09 145 aa15.62■□□□□ 0.09
PTDSS1-201ENST00000337004 IGHV3-53P01767 116 aa15.62■□□□□ 0.09
PTDSS1-201ENST00000337004 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa15.62■□□□□ 0.09
PTDSS1-201ENST00000337004 C11orf72Q8NBR9 251 aa15.62■□□□□ 0.09
PTDSS1-201ENST00000337004 SLC25A20O43772 301 aa15.61■□□□□ 0.09
PTDSS1-201ENST00000337004 INSP01308 110 aa15.61■□□□□ 0.09
PTDSS1-201ENST00000337004 PRSS2P07478 247 aa15.61■□□□□ 0.09
PTDSS1-201ENST00000337004 VSIG2Q96IQ7 327 aa15.61■□□□□ 0.09
PTDSS1-201ENST00000337004 LITAFQ99732 161 aa15.61■□□□□ 0.09
PTDSS1-201ENST00000337004 CELSR2Q9HCU4 2923 aa15.61■□□□□ 0.09
PTDSS1-201ENST00000337004 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
PTDSS1-201ENST00000337004 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
PTDSS1-201ENST00000337004 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
PTDSS1-201ENST00000337004 M0QXV9 152 aa15.6■□□□□ 0.09
PTDSS1-201ENST00000337004 BEAN1Q3B7T3 259 aa15.6■□□□□ 0.09
PTDSS1-201ENST00000337004 ANKRD29Q8N6D5 301 aa15.6■□□□□ 0.09
PTDSS1-201ENST00000337004 CFAP46Q8IYW2 2715 aa15.6■□□□□ 0.09
PTDSS1-201ENST00000337004 C9JAW5 83 aa15.6■□□□□ 0.09
PTDSS1-201ENST00000337004 DEFB114Q30KQ6 69 aa15.6■□□□□ 0.09
PTDSS1-201ENST00000337004 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
PTDSS1-201ENST00000337004 ATXN8Q156A1 80 aa15.58■□□□□ 0.09
PTDSS1-201ENST00000337004 SPANXDQ9BXN6 97 aa15.58■□□□□ 0.09
PTDSS1-201ENST00000337004 SPANXCQ9NY87 97 aa15.58■□□□□ 0.09
PTDSS1-201ENST00000337004 SORL1Q92673 2214 aa15.58■□□□□ 0.08
PTDSS1-201ENST00000337004 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa15.57■□□□□ 0.08
PTDSS1-201ENST00000337004 RS1O15537 224 aa15.57■□□□□ 0.08
PTDSS1-201ENST00000337004 Q6ZUT4 128 aa15.57■□□□□ 0.08
PTDSS1-201ENST00000337004 SPINK8P0C7L1 97 aa15.57■□□□□ 0.08
PTDSS1-201ENST00000337004 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
PTDSS1-201ENST00000337004 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa15.56■□□□□ 0.08
PTDSS1-201ENST00000337004 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa15.56■□□□□ 0.08
PTDSS1-201ENST00000337004 A0A1B0GV72 72 aa15.56■□□□□ 0.08
PTDSS1-201ENST00000337004 FHL3Q13643 280 aa15.56■□□□□ 0.08
PTDSS1-201ENST00000337004 MIAQ16674 131 aa15.55■□□□□ 0.08
PTDSS1-201ENST00000337004 ZFAND6Q6FIF0 208 aa15.55■□□□□ 0.08
PTDSS1-201ENST00000337004 CIDEAO60543 219 aa15.54■□□□□ 0.08
PTDSS1-201ENST00000337004 DEFB113Q30KQ7 82 aa15.54■□□□□ 0.08
PTDSS1-201ENST00000337004 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa15.54■□□□□ 0.08
PTDSS1-201ENST00000337004 CLUHP3Q96NS8 147 aa15.54■□□□□ 0.08
PTDSS1-201ENST00000337004 YAE1D1Q9NRH1 226 aa15.54■□□□□ 0.08
PTDSS1-201ENST00000337004 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa15.53■□□□□ 0.08
PTDSS1-201ENST00000337004 A8MZ25 164 aa15.53■□□□□ 0.08
PTDSS1-201ENST00000337004 TMEM262E9PQX1 116 aa15.53■□□□□ 0.08
PTDSS1-201ENST00000337004 TIRAPP58753 221 aa15.53■□□□□ 0.08
PTDSS1-201ENST00000337004 FLNCQ14315 2725 aa15.53■□□□□ 0.08
PTDSS1-201ENST00000337004 LINC01620Q4KN68 170 aa15.53■□□□□ 0.08
PTDSS1-201ENST00000337004 CREBBPQ92793 2442 aa15.52■□□□□ 0.08
PTDSS1-201ENST00000337004 TRIAP1O43715 76 aa15.52■□□□□ 0.08
PTDSS1-201ENST00000337004 RNF183Q96D59 192 aa15.52■□□□□ 0.08
PTDSS1-201ENST00000337004 XCL2Q9UBD3 114 aa15.52■□□□□ 0.08
PTDSS1-201ENST00000337004 KRTAP10-9P60411 292 aa15.51■□□□□ 0.07
PTDSS1-201ENST00000337004 CSMD2Q7Z408 3487 aa15.51■□□□□ 0.07
PTDSS1-201ENST00000337004 TIMM17BO60830 172 aa15.51■□□□□ 0.07
PTDSS1-201ENST00000337004 MT-ATP8P03928 68 aa15.51■□□□□ 0.07
PTDSS1-201ENST00000337004 XGP55808 180 aa15.51■□□□□ 0.07
PTDSS1-201ENST00000337004 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa15.51■□□□□ 0.07
PTDSS1-201ENST00000337004 PRB1P04280 392 aa15.5■□□□□ 0.07
PTDSS1-201ENST00000337004 STHQ8IWL8 128 aa15.5■□□□□ 0.07
PTDSS1-201ENST00000337004 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa15.5■□□□□ 0.07
PTDSS1-201ENST00000337004 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa15.5■□□□□ 0.07
PTDSS1-201ENST00000337004 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
PTDSS1-201ENST00000337004 COX6CP09669 75 aa15.49■□□□□ 0.07
PTDSS1-201ENST00000337004 IFITM1P13164 125 aa15.49■□□□□ 0.07
PTDSS1-201ENST00000337004 ICOSQ9Y6W8 199 aa15.49■□□□□ 0.07
PTDSS1-201ENST00000337004 TRAV25A0A0B4J276 109 aa15.49■□□□□ 0.07
PTDSS1-201ENST00000337004 CKS1BP61024 79 aa15.49■□□□□ 0.07
PTDSS1-201ENST00000337004 Q96MF0 132 aa15.49■□□□□ 0.07
PTDSS1-201ENST00000337004 PIEZO1Q92508 2521 aa15.49■□□□□ 0.07
PTDSS1-201ENST00000337004 NPC2P61916 151 aa15.48■□□□□ 0.07
PTDSS1-201ENST00000337004 ODF3L2Q3SX64 289 aa15.48■□□□□ 0.07
PTDSS1-201ENST00000337004 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa15.48■□□□□ 0.07
PTDSS1-201ENST00000337004 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa15.48■□□□□ 0.07
PTDSS1-201ENST00000337004 LINC01600Q96MT4 127 aa15.48■□□□□ 0.07
PTDSS1-201ENST00000337004 NDUFA1O15239 70 aa15.47■□□□□ 0.07
PTDSS1-201ENST00000337004 TMEM101Q96IK0 257 aa15.47■□□□□ 0.07
PTDSS1-201ENST00000337004 IGSF10Q6WRI0 2623 aa15.47■□□□□ 0.07
PTDSS1-201ENST00000337004 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa15.47■□□□□ 0.07
PTDSS1-201ENST00000337004 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
PTDSS1-201ENST00000337004 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa15.47■□□□□ 0.07
PTDSS1-201ENST00000337004 TMEM86BQ8N661 226 aa15.47■□□□□ 0.07
PTDSS1-201ENST00000337004 HERVK_113P63121 156 aa15.46■□□□□ 0.07
PTDSS1-201ENST00000337004 C1orf158Q8N1D5 194 aa15.46■□□□□ 0.07
PTDSS1-201ENST00000337004 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.06
PTDSS1-201ENST00000337004 Q6ZSV7 163 aa15.45■□□□□ 0.06
PTDSS1-201ENST00000337004 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
PTDSS1-201ENST00000337004 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
PTDSS1-201ENST00000337004 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
PTDSS1-201ENST00000337004 IL17DQ8TAD2 202 aa15.44■□□□□ 0.06
PTDSS1-201ENST00000337004 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 94 ms