RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580814.1

TSG101-211, Transcript of tumor susceptibility 101, humanhuman

TSL 2

Gene TSG101, Length 441 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSG101-211ENST00000580814 TCHHQ07283 1943 aa3.26□□□□□ -1.89
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TSG101-211ENST00000580814 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
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TSG101-211ENST00000580814 UBE2D1P51668 147 aa3.2□□□□□ -1.9
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TSG101-211ENST00000580814 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
TSG101-211ENST00000580814 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa3.18□□□□□ -1.9
TSG101-211ENST00000580814 KDM3BQ7LBC6 1761 aa3.17□□□□□ -1.9
TSG101-211ENST00000580814 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa3.17□□□□□ -1.9
TSG101-211ENST00000580814 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa3.17□□□□□ -1.9
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TSG101-211ENST00000580814 PDE6HQ13956 83 aa3.17□□□□□ -1.9
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