RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411092.1

RNU6-55P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 55, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-55P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZFAND6Q6FIF0 208 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 AMTNQ6UX39 209 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZFP2Q6ZN57 461 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 SMIM29Q86T20 159 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 GPHB5Q86YW7 130 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 ARL17AQ8IVW1 177 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP2.61□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 COPS9Q8WXC6 57 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP2.61□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP2.61□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 ABCA4P78363 2273 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 A0A0J9YXY3 114 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 TMEM223A0PJW6 202 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 TMEM89A2RUT3 159 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 H3BT86 120 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 K7ENP7 123 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 SLC25A20O43772 301 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 TIMM17BO60830 172 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 SNCGO76070 127 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 TCL1BO95988 128 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 IGHV3-33P01772 117 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 CRYGDP07320 174 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 COX6CP09669 75 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 CFC1BP0CG36 223 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 CFC1P0CG37 223 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 XGP55808 180 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 LINC00315P59091 139 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 PRR9Q5T870 116 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 FAM159AQ6UWV7 190 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 ANKRD29Q8N6D5 301 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 TEX29Q8N6K0 151 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 LINC01560Q8TB33 94 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 C9orf85Q96MD7 179 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 AMELXQ99217 191 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 CITED1Q99966 193 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 PPDPFQ9H3Y8 114 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 YAE1D1Q9NRH1 226 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 USP34Q70CQ2 3546 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 G3V318 75 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 I3L3M4 83 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 M0QY20 66 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 CCL21O00585 134 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 TSHBP01222 138 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 IGHG2P01859 326 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 MT-ATP8P03928 68 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 IFITM1P13164 125 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 INSL3P51460 131 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 GAGE2BQ13066 116 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 GAGE5Q13069 117 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 GAGE6Q13070 117 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 GAGE2EQ4V326 116 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 TMEM170BQ5T4T1 132 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 PTH2Q96A98 100 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 ANAPC13Q9BS18 74 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 UBTD1Q9HAC8 227 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 SPANXCQ9NY87 97 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 GAGE2DQ9UEU5 116 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 SELENOKQ9Y6D0 94 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-55P-201ENST00000411092 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -2
RNU6-55P-201ENST00000411092 SPTA1P02549 2419 aa2.59□□□□□ -2
RNU6-55P-201ENST00000411092 MYO15AQ9UKN7 3530 aa2.59□□□□□ -2
RNU6-55P-201ENST00000411092 MUC4Q99102 2169 aa2.59□□□□□ -2
RNU6-55P-201ENST00000411092 DSPP15924 2871 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-55P-201ENST00000411092 TTC28Q96AY4 2481 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-55P-201ENST00000411092 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-55P-201ENST00000411092 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-55P-201ENST00000411092 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-55P-201ENST00000411092 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-55P-201ENST00000411092 A4D1N5 150 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-55P-201ENST00000411092 C9JAW5 83 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-55P-201ENST00000411092 H3BMM0 161 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-55P-201ENST00000411092 ACYP1P07311 99 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-55P-201ENST00000411092 NBL1P41271 181 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-55P-201ENST00000411092 TSPEAR-AS2P59090 65 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-55P-201ENST00000411092 LMO4P61968 165 aa2.58□□□□□ -2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84.6 ms