RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395038.6

SOS1-201, Transcript of SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene SOS1, Length 4,123 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOS1-201ENST00000395038 F8W1H4 67 aa4.63□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 WFDC2Q14508 124 aa4.63□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa4.63□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 Q6YL49 198 aa4.63□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 EDA2RQ9HAV5 297 aa4.63□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 F5H697 171 aa4.62□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 H3BMG7 143 aa4.62□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 ELANEP08246 267 aa4.62□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 RHOHQ15669 191 aa4.62□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 FAM74A4Q5TZK3 123 aa4.62□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 UBE2E2Q96LR5 201 aa4.62□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 SYT8Q8NBV8 401 aa4.62□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 DUX5Q96PT3 197 aa4.62□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 SPG11Q96JI7 2443 aa4.62□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa4.62□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 CSPG4Q6UVK1 2322 aa4.62□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa4.61□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 IGHV3-30P01768 117 aa4.61□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa4.61□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 COTL1Q14019 142 aa4.61□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 ZNF56Q15929 161 aa4.61□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 C18orf65Q6ZTR6 163 aa4.61□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 C20orf203Q8NBC4 194 aa4.61□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 NACAE9PAV3 2078 aa4.61□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 TSPAN13O95857 204 aa4.61□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 SLC25A29Q8N8R3 303 aa4.61□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 TMEM223A0PJW6 202 aa4.61□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 TGFAP01135 160 aa4.61□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 UBE2D3P61077 147 aa4.61□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 UBE2D2P62837 147 aa4.61□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 Q8N2B8 174 aa4.61□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa4.61□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 VWFP04275 2813 aa4.61□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 IGHV4-31P0DP07 118 aa4.61□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 HERVK_113P61574 105 aa4.61□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 CMYA5Q8N3K9 4069 aa4.61□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa4.6□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa4.6□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 SCGB1D4Q6XE38 83 aa4.6□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 NDUFA11Q86Y39 141 aa4.6□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 TRGV11A0A075B6L2 103 aa4.6□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 KNCNA6PVL3 124 aa4.6□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 I3L3M4 83 aa4.6□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 SLURP1P55000 103 aa4.6□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 RPL24P83731 157 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 SH2D6Q7Z4S9 175 aa4.6□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa4.6□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 A6NJY4 79 aa4.6□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 J3QQQ9 107 aa4.6□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 CFC1BP0CG36 223 aa4.6□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 CFC1P0CG37 223 aa4.6□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 PROK1P58294 105 aa4.6□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 GAGE13Q4V321 117 aa4.6□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 TMEM170BQ5T4T1 132 aa4.6□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 CFAP126Q5VTH2 177 aa4.6□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 H3BMM0 161 aa4.59□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 LEPROTO15243 131 aa4.59□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 Q5PR19 223 aa4.59□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 MTURNQ8N3F0 131 aa4.59□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 ITPR3Q14573 2671 aa4.59□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP4.59□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 SCGB2A2Q13296 93 aa4.59□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 DEFB136Q30KP8 78 aa4.59□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa4.59□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 ETDBQ3ZM63 59 aa4.59□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 Q9UF83 564 aa4.59□□□□□ -1.67
SOS1-201ENST00000395038 TENM1Q9UKZ4 2725 aa4.59□□□□□ -1.68
SOS1-201ENST00000395038 TRAV2A0A0B4J234 112 aa4.59□□□□□ -1.68
SOS1-201ENST00000395038 RHODO00212 210 aa4.59□□□□□ -1.68
SOS1-201ENST00000395038 PRM2P04554 102 aa4.59□□□□□ -1.68
SOS1-201ENST00000395038 Q6ZSN1 163 aa4.59□□□□□ -1.68
SOS1-201ENST00000395038 PTH2Q96A98 100 aa4.59□□□□□ -1.68
SOS1-201ENST00000395038 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa4.59□□□□□ -1.68
SOS1-201ENST00000395038 HECTD1Q9ULT8 2610 aa4.58□□□□□ -1.68
SOS1-201ENST00000395038 INSL3P51460 131 aa4.58□□□□□ -1.68
SOS1-201ENST00000395038 KRTAP10-9P60411 292 aa4.58□□□□□ -1.68
SOS1-201ENST00000395038 PTPN13Q12923 2485 aa4.58□□□□□ -1.68
SOS1-201ENST00000395038 A0A0J9YXV3 536 aa4.58□□□□□ -1.68
SOS1-201ENST00000395038 DEFB131AP59861 70 aa4.58□□□□□ -1.68
SOS1-201ENST00000395038 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa4.58□□□□□ -1.68
SOS1-201ENST00000395038 SPATA25Q9BR10 227 aa4.58□□□□□ -1.68
SOS1-201ENST00000395038 UNC79Q9P2D8 2635 aa4.58□□□□□ -1.68
SOS1-201ENST00000395038 C10orf126Q8N4M7 172 aa4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.6 ms