RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611415.4

TNS1-220, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TNS1, Length 6,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-220ENST00000611415 DKK4Q9UBT3 224 aa9.21□□□□□ -0.94
TNS1-220ENST00000611415 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa9.2□□□□□ -0.94
TNS1-220ENST00000611415 WT1P19544 449 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
TNS1-220ENST00000611415 C19orf71A6NCJ1 209 aa9.2□□□□□ -0.94
TNS1-220ENST00000611415 TIRAPP58753 221 aa9.2□□□□□ -0.94
TNS1-220ENST00000611415 K7EMT4 169 aa9.2□□□□□ -0.94
TNS1-220ENST00000611415 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa9.19□□□□□ -0.94
TNS1-220ENST00000611415 DOCK9Q9BZ29 2069 aa9.19□□□□□ -0.94
TNS1-220ENST00000611415 E7EUB6 86 aa9.19□□□□□ -0.94
TNS1-220ENST00000611415 ATP5G1P05496 136 aa9.19□□□□□ -0.94
TNS1-220ENST00000611415 PIFOQ8TCI5 191 aa9.19□□□□□ -0.94
TNS1-220ENST00000611415 SPART-AS1P0CW21 52 aa9.19□□□□□ -0.94
TNS1-220ENST00000611415 NREPQ16612 68 aa9.19□□□□□ -0.94
TNS1-220ENST00000611415 WFDC9Q8NEX5 89 aa9.19□□□□□ -0.94
TNS1-220ENST00000611415 C2orf70A6NJV1 201 aa9.19□□□□□ -0.94
TNS1-220ENST00000611415 J3KT08 172 aa9.19□□□□□ -0.94
TNS1-220ENST00000611415 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa9.18□□□□□ -0.94
TNS1-220ENST00000611415 OBSL1O75147 1896 aa9.18□□□□□ -0.94
TNS1-220ENST00000611415 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa9.18□□□□□ -0.94
TNS1-220ENST00000611415 J3QKU1 62 aa9.18□□□□□ -0.94
TNS1-220ENST00000611415 NDUFC2O95298 119 aa9.18□□□□□ -0.94
TNS1-220ENST00000611415 DEFB113Q30KQ7 82 aa9.18□□□□□ -0.94
TNS1-220ENST00000611415 H3BT86 120 aa9.18□□□□□ -0.94
TNS1-220ENST00000611415 LECT2O14960 151 aa9.17□□□□□ -0.94
TNS1-220ENST00000611415 HHLA3Q9XRX5 114 aa9.17□□□□□ -0.94
TNS1-220ENST00000611415 MP68P56378 58 aa9.17□□□□□ -0.94
TNS1-220ENST00000611415 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa9.17□□□□□ -0.94
TNS1-220ENST00000611415 NFE4Q86UQ8 179 aa9.17□□□□□ -0.94
TNS1-220ENST00000611415 Q8N7P7 452 aa9.17□□□□□ -0.94
TNS1-220ENST00000611415 CACNA1EQ15878 2313 aa9.17□□□□□ -0.94
TNS1-220ENST00000611415 NDUFA1O15239 70 aa9.16□□□□□ -0.94
TNS1-220ENST00000611415 CXCL5P42830 114 aa9.16□□□□□ -0.94
TNS1-220ENST00000611415 GPHB5Q86YW7 130 aa9.16□□□□□ -0.94
TNS1-220ENST00000611415 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
TNS1-220ENST00000611415 IGLV1-47P01700 117 aa9.16□□□□□ -0.94
TNS1-220ENST00000611415 NDUFA11Q86Y39 141 aa9.16□□□□□ -0.94
TNS1-220ENST00000611415 C10orf105Q8TEF2 133 aa9.15□□□□□ -0.94
TNS1-220ENST00000611415 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
TNS1-220ENST00000611415 NDUFB1O75438 58 aa9.15□□□□□ -0.94
TNS1-220ENST00000611415 A0A1B0GXF2 115 aa9.15□□□□□ -0.94
TNS1-220ENST00000611415 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.95
TNS1-220ENST00000611415 CRYGBP07316 175 aa9.15□□□□□ -0.95
TNS1-220ENST00000611415 IGF2-ASQ6U949 168 aa9.15□□□□□ -0.95
TNS1-220ENST00000611415 C4orf3Q8WVX3 66 aa9.15□□□□□ -0.95
TNS1-220ENST00000611415 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
TNS1-220ENST00000611415 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa9.14□□□□□ -0.95
TNS1-220ENST00000611415 DEFB1P60022 68 aa9.14□□□□□ -0.95
TNS1-220ENST00000611415 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa9.14□□□□□ -0.95
TNS1-220ENST00000611415 CEP250Q9BV73 2442 aa9.14□□□□□ -0.95
TNS1-220ENST00000611415 CEP290O15078 2479 aa9.14□□□□□ -0.95
TNS1-220ENST00000611415 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa9.14□□□□□ -0.95
TNS1-220ENST00000611415 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa9.14□□□□□ -0.95
TNS1-220ENST00000611415 DIRC1Q969H9 104 aa9.14□□□□□ -0.95
TNS1-220ENST00000611415 ZNF407Q9C0G0 2248 aa9.14□□□□□ -0.95
TNS1-220ENST00000611415 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa9.14□□□□□ -0.95
TNS1-220ENST00000611415 TMEM89A2RUT3 159 aa9.14□□□□□ -0.95
TNS1-220ENST00000611415 SPATA12Q7Z6I5 190 aa9.14□□□□□ -0.95
TNS1-220ENST00000611415 MDFICQ9P1T7 246 aa9.14□□□□□ -0.95
TNS1-220ENST00000611415 ESM1Q9NQ30 184 aa9.14□□□□□ -0.95
TNS1-220ENST00000611415 TCL1BO95988 128 aa9.14□□□□□ -0.95
TNS1-220ENST00000611415 CCL18P55774 89 aa9.14□□□□□ -0.95
TNS1-220ENST00000611415 MIAQ16674 131 aa9.13□□□□□ -0.95
TNS1-220ENST00000611415 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
TNS1-220ENST00000611415 C20orf203Q8NBC4 194 aa9.13□□□□□ -0.95
TNS1-220ENST00000611415 LTBP2Q14767 1821 aa9.13□□□□□ -0.95
TNS1-220ENST00000611415 CLPSL1A2RUU4 121 aa9.13□□□□□ -0.95
TNS1-220ENST00000611415 ADORA2A-AS1P86434 159 aa9.13□□□□□ -0.95
TNS1-220ENST00000611415 IGLV2-8P01709 118 aa9.13□□□□□ -0.95
TNS1-220ENST00000611415 P0C879 139 aa9.13□□□□□ -0.95
TNS1-220ENST00000611415 PTH2Q96A98 100 aa9.13□□□□□ -0.95
TNS1-220ENST00000611415 COL4A3Q01955 1670 aa9.13□□□□□ -0.95
TNS1-220ENST00000611415 SEM1Q6ZVN7 128 aa9.12□□□□□ -0.95
TNS1-220ENST00000611415 F8W735 103 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
TNS1-220ENST00000611415 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa9.12□□□□□ -0.95
TNS1-220ENST00000611415 HIGD2BQ4VC39 106 aa9.12□□□□□ -0.95
TNS1-220ENST00000611415 SIRPDQ9H106 197 aa9.12□□□□□ -0.95
TNS1-220ENST00000611415 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa9.12□□□□□ -0.95
TNS1-220ENST00000611415 SPAG11BQ08648 103 aa9.12□□□□□ -0.95
TNS1-220ENST00000611415 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
TNS1-220ENST00000611415 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa9.11□□□□□ -0.95
TNS1-220ENST00000611415 FANCD2OSQ96PS1 177 aa9.11□□□□□ -0.95
TNS1-220ENST00000611415 TRBV12-3P01733 135 aa9.11□□□□□ -0.95
TNS1-220ENST00000611415 DENND4AQ7Z401 1863 aa9.11□□□□□ -0.95
TNS1-220ENST00000611415 NOTCH4Q99466 2003 aa9.11□□□□□ -0.95
TNS1-220ENST00000611415 GDF5OSQ5U4N7 250 aa9.11□□□□□ -0.95
TNS1-220ENST00000611415 A0A0J9YX75 114 aa9.11□□□□□ -0.95
TNS1-220ENST00000611415 UBE2AP49459 152 aa9.11□□□□□ -0.95
TNS1-220ENST00000611415 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
TNS1-220ENST00000611415 Q6ZUT4 128 aa9.11□□□□□ -0.95
TNS1-220ENST00000611415 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
TNS1-220ENST00000611415 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
TNS1-220ENST00000611415 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
TNS1-220ENST00000611415 SPTA1P02549 2419 aa9.1□□□□□ -0.95
TNS1-220ENST00000611415 C14orf132Q9NPU4 83 aa9.1□□□□□ -0.95
TNS1-220ENST00000611415 A0A0J9YXY3 114 aa9.09□□□□□ -0.95
TNS1-220ENST00000611415 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
TNS1-220ENST00000611415 LINC00643Q86TS7 51 aa9.09□□□□□ -0.95
TNS1-220ENST00000611415 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa9.09□□□□□ -0.95
TNS1-220ENST00000611415 MYCNOSP40205 109 aa9.09□□□□□ -0.95
TNS1-220ENST00000611415 A6NDX4 124 aa9.08□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.2 ms