RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592515.1

UBXN6-209, Transcript of UBX domain protein 6, humanhuman

TSL 5

Gene UBXN6, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6-209ENST00000592515 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa8.56□□□□□ -1.04
UBXN6-209ENST00000592515 RAB19A4D1S5 217 aa8.56□□□□□ -1.04
UBXN6-209ENST00000592515 LINC00862A6NCI5 91 aa8.56□□□□□ -1.04
UBXN6-209ENST00000592515 GAGE12JA6NER3 117 aa8.56□□□□□ -1.04
UBXN6-209ENST00000592515 M0R381 172 aa8.56□□□□□ -1.04
UBXN6-209ENST00000592515 RHODO00212 210 aa8.56□□□□□ -1.04
UBXN6-209ENST00000592515 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
UBXN6-209ENST00000592515 CRYGDP07320 174 aa8.56□□□□□ -1.04
UBXN6-209ENST00000592515 LINC00694P0DN24 101 aa8.56□□□□□ -1.04
UBXN6-209ENST00000592515 RPL35P42766 123 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
UBXN6-209ENST00000592515 GAGE1Q13065 139 aa8.56□□□□□ -1.04
UBXN6-209ENST00000592515 GAGE4Q13068 117 aa8.56□□□□□ -1.04
UBXN6-209ENST00000592515 GAGE5Q13069 117 aa8.56□□□□□ -1.04
UBXN6-209ENST00000592515 GAGE13Q4V321 117 aa8.56□□□□□ -1.04
UBXN6-209ENST00000592515 NFE4Q86UQ8 179 aa8.56□□□□□ -1.04
UBXN6-209ENST00000592515 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
UBXN6-209ENST00000592515 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa8.56□□□□□ -1.04
UBXN6-209ENST00000592515 C11orf52Q96A22 123 aa8.56□□□□□ -1.04
UBXN6-209ENST00000592515 SFRP2Q96HF1 295 aa8.56□□□□□ -1.04
UBXN6-209ENST00000592515 DERL1Q9BUN8 251 aa8.56□□□□□ -1.04
UBXN6-209ENST00000592515 GTSF1LQ9H1H1 148 aa8.56□□□□□ -1.04
UBXN6-209ENST00000592515 MSRB1Q9NZV6 116 aa8.56□□□□□ -1.04
UBXN6-209ENST00000592515 HSPG2P98160 4391 aa8.56□□□□□ -1.04
UBXN6-209ENST00000592515 APOBP04114 4563 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
UBXN6-209ENST00000592515 A0A087WWL8 130 aa8.55□□□□□ -1.04
UBXN6-209ENST00000592515 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa8.55□□□□□ -1.04
UBXN6-209ENST00000592515 IFNA1P01562 189 aa8.55□□□□□ -1.04
UBXN6-209ENST00000592515 LINC01556Q5JQF7 62 aa8.55□□□□□ -1.04
UBXN6-209ENST00000592515 OR10J3Q5JRS4 329 aa8.55□□□□□ -1.04
UBXN6-209ENST00000592515 LELP1Q5T871 98 aa8.55□□□□□ -1.04
UBXN6-209ENST00000592515 FAM74A4Q5TZK3 123 aa8.55□□□□□ -1.04
UBXN6-209ENST00000592515 PRR27Q6MZM9 219 aa8.55□□□□□ -1.04
UBXN6-209ENST00000592515 ZFP82Q8N141 532 aa8.55□□□□□ -1.04
UBXN6-209ENST00000592515 C10orf126Q8N4M7 172 aa8.55□□□□□ -1.04
UBXN6-209ENST00000592515 PCLOQ9Y6V0 5065 aa8.54□□□□□ -1.04
UBXN6-209ENST00000592515 CXCL1P09341 107 aa8.54□□□□□ -1.04
UBXN6-209ENST00000592515 ERVFC1-1P60608 527 aa8.53□□□□□ -1.04
UBXN6-209ENST00000592515 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
UBXN6-209ENST00000592515 CENPWQ5EE01 88 aa8.53□□□□□ -1.04
UBXN6-209ENST00000592515 OR10AG1Q8NH19 301 aa8.53□□□□□ -1.04
UBXN6-209ENST00000592515 SNAI2O43623 268 aa8.52□□□□□ -1.05
UBXN6-209ENST00000592515 IGLV2-8P01709 118 aa8.52□□□□□ -1.05
UBXN6-209ENST00000592515 IGHV3-30P01768 117 aa8.52□□□□□ -1.05
UBXN6-209ENST00000592515 IGHV3-33P01772 117 aa8.52□□□□□ -1.05
UBXN6-209ENST00000592515 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa8.52□□□□□ -1.05
UBXN6-209ENST00000592515 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa8.52□□□□□ -1.05
UBXN6-209ENST00000592515 BCL2P10415 239 aa8.52□□□□□ -1.05
UBXN6-209ENST00000592515 PEA15Q15121 130 aa8.52□□□□□ -1.05
UBXN6-209ENST00000592515 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
UBXN6-209ENST00000592515 A0A087WTM6 91 aa8.51□□□□□ -1.05
UBXN6-209ENST00000592515 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa8.51□□□□□ -1.05
UBXN6-209ENST00000592515 MUC21A0A140T8X8 626 aa8.51□□□□□ -1.05
UBXN6-209ENST00000592515 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa8.51□□□□□ -1.05
UBXN6-209ENST00000592515 PDE6DO43924 150 aa8.51□□□□□ -1.05
UBXN6-209ENST00000592515 CDK2AP2O75956 126 aa8.51□□□□□ -1.05
UBXN6-209ENST00000592515 OR5AL1P0C617 328 aa8.51□□□□□ -1.05
UBXN6-209ENST00000592515 LYPD6BQ8NI32 183 aa8.51□□□□□ -1.05
UBXN6-209ENST00000592515 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa8.51□□□□□ -1.05
UBXN6-209ENST00000592515 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa8.5□□□□□ -1.05
UBXN6-209ENST00000592515 EREGO14944 169 aa8.5□□□□□ -1.05
UBXN6-209ENST00000592515 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP8.5□□□□□ -1.05
UBXN6-209ENST00000592515 GNG4P50150 75 aa8.5□□□□□ -1.05
UBXN6-209ENST00000592515 Q8N3U1 123 aa8.5□□□□□ -1.05
UBXN6-209ENST00000592515 VAX2Q9UIW0 290 aa8.5□□□□□ -1.05
UBXN6-209ENST00000592515 ABCA13Q86UQ4 5058 aa8.49□□□□□ -1.05
UBXN6-209ENST00000592515 A0A087WWC5 75 aa8.49□□□□□ -1.05
UBXN6-209ENST00000592515 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa8.49□□□□□ -1.05
UBXN6-209ENST00000592515 C19orf71A6NCJ1 209 aa8.49□□□□□ -1.05
UBXN6-209ENST00000592515 SPANXN1Q5VSR9 72 aa8.49□□□□□ -1.05
UBXN6-209ENST00000592515 SMIM12Q96EX1 92 aa8.49□□□□□ -1.05
UBXN6-209ENST00000592515 Q9HAA7 133 aa8.49□□□□□ -1.05
UBXN6-209ENST00000592515 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa8.49□□□□□ -1.05
UBXN6-209ENST00000592515 GZMBP10144 247 aa8.48□□□□□ -1.05
UBXN6-209ENST00000592515 RAB4BP61018 213 aa8.48□□□□□ -1.05
UBXN6-209ENST00000592515 UBE2D3P61077 147 aa8.48□□□□□ -1.05
UBXN6-209ENST00000592515 SSTP61278 116 aa8.48□□□□□ -1.05
UBXN6-209ENST00000592515 UBE2D2P62837 147 aa8.48□□□□□ -1.05
UBXN6-209ENST00000592515 OR2D3Q8NGH3 330 aa8.48□□□□□ -1.05
UBXN6-209ENST00000592515 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
UBXN6-209ENST00000592515 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa8.47□□□□□ -1.05
UBXN6-209ENST00000592515 RBFOX3A6NFN3 312 aa8.47□□□□□ -1.05
UBXN6-209ENST00000592515 IGLC6P0CF74 106 aa8.47□□□□□ -1.05
UBXN6-209ENST00000592515 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
UBXN6-209ENST00000592515 LAGE3Q14657 143 aa8.47□□□□□ -1.05
UBXN6-209ENST00000592515 ZNF56Q15929 161 aa8.47□□□□□ -1.05
UBXN6-209ENST00000592515 COMMD7Q86VX2 200 aa8.47□□□□□ -1.05
UBXN6-209ENST00000592515 OR10G8Q8NGN5 311 aa8.47□□□□□ -1.05
UBXN6-209ENST00000592515 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
UBXN6-209ENST00000592515 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa8.47□□□□□ -1.05
UBXN6-209ENST00000592515 LRCOL1A6NCL2 159 aa8.46□□□□□ -1.06
UBXN6-209ENST00000592515 PSCAO43653 123 aa8.46□□□□□ -1.06
UBXN6-209ENST00000592515 RPS20P60866 119 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
UBXN6-209ENST00000592515 CDPF1Q6NVV7 123 aa8.46□□□□□ -1.06
UBXN6-209ENST00000592515 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
UBXN6-209ENST00000592515 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa8.46□□□□□ -1.06
UBXN6-209ENST00000592515 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa8.46□□□□□ -1.06
UBXN6-209ENST00000592515 FAM210AQ96ND0 272 aa8.46□□□□□ -1.06
UBXN6-209ENST00000592515 TPPP3Q9BW30 176 aa8.46□□□□□ -1.06
UBXN6-209ENST00000592515 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa8.46□□□□□ -1.06
UBXN6-209ENST00000592515 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63 ms