RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517083.1

RNU6-548P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 548, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-548P, Length 115 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-548P-201ENST00000517083 A0A0B4J2A0 478 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-548P-201ENST00000517083 PRSS46E5RG02 174 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-548P-201ENST00000517083 BCL2L11O43521 198 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-548P-201ENST00000517083 SSX5O60225 188 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-548P-201ENST00000517083 TSC22D2O75157 780 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-548P-201ENST00000517083 TCRAP04437 139 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-548P-201ENST00000517083 HSMCR30P0CW71 290 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-548P-201ENST00000517083 ESDP10768 282 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-548P-201ENST00000517083 CAV2P51636 162 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-548P-201ENST00000517083 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP0.92□□□□□ -2.26
RNU6-548P-201ENST00000517083 SELENOTP62341 195 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF56Q15929 161 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-548P-201ENST00000517083 C2orf76Q3KRA6 126 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-548P-201ENST00000517083 CDNFQ49AH0 187 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-548P-201ENST00000517083 Q5VV11 94 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-548P-201ENST00000517083 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-548P-201ENST00000517083 XAF1Q6GPH4 301 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-548P-201ENST00000517083 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP0.92□□□□□ -2.26
RNU6-548P-201ENST00000517083 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-548P-201ENST00000517083 CROCCP2Q86T23 111 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-548P-201ENST00000517083 MTURNQ8N3F0 131 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-548P-201ENST00000517083 RHOXF1Q8NHV9 184 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-548P-201ENST00000517083 MITD1Q8WV92 249 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-548P-201ENST00000517083 CANT1Q8WVQ1 401 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP0.92□□□□□ -2.26
RNU6-548P-201ENST00000517083 LIMD2Q9BT23 127 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM243Q9BU79 118 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-548P-201ENST00000517083 ATG5Q9H1Y0 275 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-548P-201ENST00000517083 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP0.92□□□□□ -2.26
RNU6-548P-201ENST00000517083 IL36BQ9NZH7 164 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-548P-201ENST00000517083 NDUFA13Q9P0J0 144 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP0.92□□□□□ -2.26
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-548P-201ENST00000517083 FNDC10F2Z333 226 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-548P-201ENST00000517083 GOSR2O14653 212 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-548P-201ENST00000517083 AGPAT2O15120 278 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-548P-201ENST00000517083 NDUFA1O15239 70 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-548P-201ENST00000517083 CCL25O15444 150 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-548P-201ENST00000517083 SCGNO76038 276 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-548P-201ENST00000517083 NDUFB4O95168 129 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-548P-201ENST00000517083 NPSP0C0P6 89 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-548P-201ENST00000517083 IGLC2P0DOY2 106 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-548P-201ENST00000517083 RAB6AP20340 208 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-548P-201ENST00000517083 DAPP51397 102 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-548P-201ENST00000517083 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP0.91□□□□□ -2.26
RNU6-548P-201ENST00000517083 PPP1R1AQ13522 171 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-548P-201ENST00000517083 IQCJQ1A5X6 159 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-548P-201ENST00000517083 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM231DQ6ZW35 169 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-548P-201ENST00000517083 LINC01551Q86U37 167 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-548P-201ENST00000517083 CBLN2Q8IUK8 224 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-548P-201ENST00000517083 NRACQ8N912 160 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR11H4Q8NGC9 324 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR5AP2Q8NGF4 316 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR10G8Q8NGN5 311 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-548P-201ENST00000517083 TERB2Q8NHR7 220 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-548P-201ENST00000517083 PTH2Q96A98 100 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-548P-201ENST00000517083 PHYHIPLQ96FC7 376 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-548P-201ENST00000517083 DIRAS2Q96HU8 199 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-548P-201ENST00000517083 BCL7BQ9BQE9 202 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-548P-201ENST00000517083 NDFIP1Q9BT67 221 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-548P-201ENST00000517083 GNB1LQ9BYB4 327 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP0.91□□□□□ -2.26
RNU6-548P-201ENST00000517083 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP0.91□□□□□ -2.26
RNU6-548P-201ENST00000517083 SAR1AQ9NR31 198 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-548P-201ENST00000517083 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP0.91□□□□□ -2.26
RNU6-548P-201ENST00000517083 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP0.91□□□□□ -2.26
RNU6-548P-201ENST00000517083 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP0.91□□□□□ -2.26
RNU6-548P-201ENST00000517083 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP0.91□□□□□ -2.26
RNU6-548P-201ENST00000517083 C22orf24Q9Y442 160 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-548P-201ENST00000517083 LENEPQ9Y5L5 61 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-548P-201ENST00000517083 ORC6Q9Y5N6 252 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-548P-201ENST00000517083 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRAV34A0A0B4J273 112 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 IRGMA1A4Y4 181 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 RPL37AP8A6NKH3 93 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 F6UZH7 168 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 H3BQ15 152 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 COX7A2LO14548 114 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 MYL12BO14950 172 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 GYG2O15488 501 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 CIB2O75838 187 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 ARL6IP5O75915 188 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 AKR1C4P17516 323 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 NTF3P20783 257 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 PRDX6P30041 224 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 CTRLP40313 264 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 TAS2R46P59540 309 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 TAS2R19P59542 299 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 PLP1P60201 277 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 SPAG11BQ08648 103 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 PDE6HQ13956 83 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM241Q24JQ0 296 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 C10orf113Q5VZT2 155 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 Q6ZRG5 221 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP0.9□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45 ms