RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490081.5

HDAC1-210, Transcript of histone deacetylase 1, humanhuman

TSL 3

Gene HDAC1, Length 1,047 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1-210ENST00000490081 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa8.76□□□□□ -1.01
HDAC1-210ENST00000490081 NUP35Q8NFH5 326 aa8.76□□□□□ -1.01
HDAC1-210ENST00000490081 ZNF479Q96JC4 524 aa8.76□□□□□ -1.01
HDAC1-210ENST00000490081 HHLA3Q9XRX5 114 aa8.76□□□□□ -1.01
HDAC1-210ENST00000490081 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa8.76□□□□□ -1.01
HDAC1-210ENST00000490081 A0A1B0GW15 77 aa8.75□□□□□ -1.01
HDAC1-210ENST00000490081 F5H768 121 aa8.75□□□□□ -1.01
HDAC1-210ENST00000490081 TRGC1P0CF51 173 aa8.75□□□□□ -1.01
HDAC1-210ENST00000490081 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
HDAC1-210ENST00000490081 SVBPQ8N300 66 aa8.75□□□□□ -1.01
HDAC1-210ENST00000490081 C15orf53Q8NAA6 179 aa8.75□□□□□ -1.01
HDAC1-210ENST00000490081 CLRN3Q8NCR9 226 aa8.75□□□□□ -1.01
HDAC1-210ENST00000490081 FRZBQ92765 325 aa8.75□□□□□ -1.01
HDAC1-210ENST00000490081 BORCS7Q96B45 105 aa8.75□□□□□ -1.01
HDAC1-210ENST00000490081 TENM2Q9NT68 2774 aa8.75□□□□□ -1.01
HDAC1-210ENST00000490081 STARD9Q9P2P6 4700 aa8.74□□□□□ -1.01
HDAC1-210ENST00000490081 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa8.74□□□□□ -1.01
HDAC1-210ENST00000490081 C7orf77A4D0Y5 90 aa8.74□□□□□ -1.01
HDAC1-210ENST00000490081 SNAPINO95295 136 aa8.74□□□□□ -1.01
HDAC1-210ENST00000490081 IGHV3-53P01767 116 aa8.74□□□□□ -1.01
HDAC1-210ENST00000490081 CRYBA4P53673 196 aa8.74□□□□□ -1.01
HDAC1-210ENST00000490081 LINC00315P59091 139 aa8.74□□□□□ -1.01
HDAC1-210ENST00000490081 RAB4BP61018 213 aa8.74□□□□□ -1.01
HDAC1-210ENST00000490081 RIGQ13278 110 aa8.74□□□□□ -1.01
HDAC1-210ENST00000490081 PGLYRP4Q96LB8 373 aa8.74□□□□□ -1.01
HDAC1-210ENST00000490081 AP1S3Q96PC3 154 aa8.74□□□□□ -1.01
HDAC1-210ENST00000490081 TPPP3Q9BW30 176 aa8.74□□□□□ -1.01
HDAC1-210ENST00000490081 JPT2Q9H910 190 aa8.74□□□□□ -1.01
HDAC1-210ENST00000490081 MSRB1Q9NZV6 116 aa8.74□□□□□ -1.01
HDAC1-210ENST00000490081 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa8.73□□□□□ -1.01
HDAC1-210ENST00000490081 APOC3P02656 99 aa8.73□□□□□ -1.01
HDAC1-210ENST00000490081 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa8.73□□□□□ -1.01
HDAC1-210ENST00000490081 VSIG2Q96IQ7 327 aa8.73□□□□□ -1.01
HDAC1-210ENST00000490081 SAMD10Q9BYL1 202 aa8.73□□□□□ -1.01
HDAC1-210ENST00000490081 SMIM17P0DL12 118 aa8.72□□□□□ -1.01
HDAC1-210ENST00000490081 HTN3P15516 51 aa8.72□□□□□ -1.01
HDAC1-210ENST00000490081 TWIST1Q15672 202 aa8.72□□□□□ -1.01
HDAC1-210ENST00000490081 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
HDAC1-210ENST00000490081 GATD1Q8NB37 220 aa8.72□□□□□ -1.01
HDAC1-210ENST00000490081 TMEM191AQ9H0A3 160 aa8.72□□□□□ -1.01
HDAC1-210ENST00000490081 DPH3P1Q9H4G8 78 aa8.72□□□□□ -1.01
HDAC1-210ENST00000490081 APLNQ9ULZ1 77 aa8.72□□□□□ -1.01
HDAC1-210ENST00000490081 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa8.71□□□□□ -1.02
HDAC1-210ENST00000490081 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa8.71□□□□□ -1.02
HDAC1-210ENST00000490081 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa8.71□□□□□ -1.02
HDAC1-210ENST00000490081 MUC21A0A140T8X8 626 aa8.71□□□□□ -1.02
HDAC1-210ENST00000490081 IGLL5B9A064 214 aa8.71□□□□□ -1.02
HDAC1-210ENST00000490081 PAX4O43316 350 aa8.71□□□□□ -1.02
HDAC1-210ENST00000490081 S100A8P05109 93 aa8.71□□□□□ -1.02
HDAC1-210ENST00000490081 EVI2AP22794 236 aa8.71□□□□□ -1.02
HDAC1-210ENST00000490081 RHOHQ15669 191 aa8.71□□□□□ -1.02
HDAC1-210ENST00000490081 ZFAND6Q6FIF0 208 aa8.71□□□□□ -1.02
HDAC1-210ENST00000490081 TMEM88Q6PEY1 159 aa8.71□□□□□ -1.02
HDAC1-210ENST00000490081 SMIM15Q7Z3B0 74 aa8.71□□□□□ -1.02
HDAC1-210ENST00000490081 SH2D6Q7Z4S9 175 aa8.71□□□□□ -1.02
HDAC1-210ENST00000490081 SLC25A29Q8N8R3 303 aa8.71□□□□□ -1.02
HDAC1-210ENST00000490081 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
HDAC1-210ENST00000490081 SACSQ9NZJ4 4579 aa8.7□□□□□ -1.02
HDAC1-210ENST00000490081 A0A087WWL8 130 aa8.7□□□□□ -1.02
HDAC1-210ENST00000490081 A0A1B0GXF2 115 aa8.7□□□□□ -1.02
HDAC1-210ENST00000490081 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
HDAC1-210ENST00000490081 RASL11AQ6T310 242 aa8.7□□□□□ -1.02
HDAC1-210ENST00000490081 Q6ZSN1 163 aa8.7□□□□□ -1.02
HDAC1-210ENST00000490081 BTF3L4Q96K17 158 aa8.7□□□□□ -1.02
HDAC1-210ENST00000490081 PRADC1Q9BSG0 188 aa8.7□□□□□ -1.02
HDAC1-210ENST00000490081 FAM74A4Q5TZK3 123 aa8.69□□□□□ -1.02
HDAC1-210ENST00000490081 KCNIP4Q6PIL6 250 aa8.69□□□□□ -1.02
HDAC1-210ENST00000490081 RPS10P5Q9NQ39 176 aa8.69□□□□□ -1.02
HDAC1-210ENST00000490081 A0A096LPF7 62 aa8.68□□□□□ -1.02
HDAC1-210ENST00000490081 H7C1H1 209 aa8.68□□□□□ -1.02
HDAC1-210ENST00000490081 K7EQD1 137 aa8.68□□□□□ -1.02
HDAC1-210ENST00000490081 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
HDAC1-210ENST00000490081 TIRAPP58753 221 aa8.68□□□□□ -1.02
HDAC1-210ENST00000490081 SSTP61278 116 aa8.68□□□□□ -1.02
HDAC1-210ENST00000490081 HBBP68871 147 aa8.68□□□□□ -1.02
HDAC1-210ENST00000490081 ICOSQ9Y6W8 199 aa8.68□□□□□ -1.02
HDAC1-210ENST00000490081 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa8.67□□□□□ -1.02
HDAC1-210ENST00000490081 A0A0J9YY99 117 aa8.67□□□□□ -1.02
HDAC1-210ENST00000490081 LCE6AA0A183 80 aa8.67□□□□□ -1.02
HDAC1-210ENST00000490081 M0QY20 66 aa8.67□□□□□ -1.02
HDAC1-210ENST00000490081 LINC00694P0DN24 101 aa8.67□□□□□ -1.02
HDAC1-210ENST00000490081 GYPEP15421 78 aa8.67□□□□□ -1.02
HDAC1-210ENST00000490081 S100PP25815 95 aa8.67□□□□□ -1.02
HDAC1-210ENST00000490081 DNAJC30Q96LL9 226 aa8.67□□□□□ -1.02
HDAC1-210ENST00000490081 DNAH1Q9P2D7 4330 aa8.66□□□□□ -1.02
HDAC1-210ENST00000490081 F5H697 171 aa8.66□□□□□ -1.02
HDAC1-210ENST00000490081 RAB4AP20338 218 aa8.66□□□□□ -1.02
HDAC1-210ENST00000490081 ZNF56Q15929 161 aa8.66□□□□□ -1.02
HDAC1-210ENST00000490081 COX19Q49B96 90 aa8.66□□□□□ -1.02
HDAC1-210ENST00000490081 FAM104BQ5XKR9 115 aa8.66□□□□□ -1.02
HDAC1-210ENST00000490081 LGALS9CQ6DKI2 356 aa8.66□□□□□ -1.02
HDAC1-210ENST00000490081 NEGR1Q7Z3B1 354 aa8.66□□□□□ -1.02
HDAC1-210ENST00000490081 LYSTQ99698 3801 aa8.66□□□□□ -1.02
HDAC1-210ENST00000490081 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa8.65□□□□□ -1.02
HDAC1-210ENST00000490081 P0DMU3 169 aa8.65□□□□□ -1.02
HDAC1-210ENST00000490081 FAM231AP0DMU4 169 aa8.65□□□□□ -1.02
HDAC1-210ENST00000490081 FAM231CP0DMU5 169 aa8.65□□□□□ -1.02
HDAC1-210ENST00000490081 MRAP2Q96G30 205 aa8.65□□□□□ -1.02
HDAC1-210ENST00000490081 RNF185Q96GF1 192 aa8.65□□□□□ -1.02
HDAC1-210ENST00000490081 NIT2Q9NQR4 276 aa8.65□□□□□ -1.02
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