RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 MYH7P12883 1935 aa2.48□□□□□ -2.01
RABGGTB-209ENST00000473406 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP2.48□□□□□ -2.01
RABGGTB-209ENST00000473406 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa2.47□□□□□ -2.01
RABGGTB-209ENST00000473406 FOCADQ5VW36 1801 aa2.47□□□□□ -2.01
RABGGTB-209ENST00000473406 EML5Q05BV3 1969 aa2.47□□□□□ -2.01
RABGGTB-209ENST00000473406 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP2.47□□□□□ -2.01
RABGGTB-209ENST00000473406 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa2.47□□□□□ -2.01
RABGGTB-209ENST00000473406 TRAV2A0A0B4J234 112 aa2.47□□□□□ -2.01
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa2.47□□□□□ -2.01
RABGGTB-209ENST00000473406 IL7P13232 177 aa2.47□□□□□ -2.01
RABGGTB-209ENST00000473406 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
RABGGTB-209ENST00000473406 PDCD10Q9BUL8 212 aa2.47□□□□□ -2.01
RABGGTB-209ENST00000473406 LAMA3Q16787 3333 aa2.47□□□□□ -2.01
RABGGTB-209ENST00000473406 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
RABGGTB-209ENST00000473406 ERBINQ96RT1 1412 aa2.47□□□□□ -2.01
RABGGTB-209ENST00000473406 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP2.47□□□□□ -2.01
RABGGTB-209ENST00000473406 KDM5DQ9BY66 1539 aa2.47□□□□□ -2.01
RABGGTB-209ENST00000473406 RICTORQ6R327 1708 aa2.46□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 ADGRB1O14514 1584 aa2.46□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP2.46□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 TRAV17A0A0B4J275 112 aa2.46□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa2.46□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP2.46□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 IGKCP01834 107 aa2.46□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 GNG8Q9UK08 70 aa2.46□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 EFCAB6Q5THR3 1501 aa2.46□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 USP24Q9UPU5 2620 aa2.46□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 BPTFQ12830 3046 aa2.46□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 MYO18BQ8IUG5 2567 aa2.46□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 MYO3AQ8NEV4 1616 aa2.46□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 KALRNO60229 2985 aa2.46□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 ACACBO00763 2458 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 NAIPQ13075 1403 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 J3QKU1 62 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 IGLV3-1P01715 115 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 FGF7P21781 194 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 S100A1P23297 94 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 LYPD5Q6UWN5 251 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 KIF14Q15058 1648 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 CEP250Q9BV73 2442 aa2.44□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 IQGAP1P46940 1657 aa2.44□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 HECTD1Q9ULT8 2610 aa2.44□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 NOTCH2Q04721 2471 aa2.44□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa2.44□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 IGHV3-30P01768 117 aa2.44□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 GYPBP06028 91 aa2.44□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa2.44□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 PPDPFLQ8WWR9 84 aa2.44□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa2.44□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 NUP188Q5SRE5 1749 aa2.44□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 MAGI2Q86UL8 1455 aa2.44□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 TET3O43151 1660 aa2.44□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 MCM3APO60318 1980 aa2.43□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 UACAQ9BZF9 1416 aa2.43□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 CNTLNQ9NXG0 1405 aa2.43□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM135AQ9P2D6 1515 aa2.43□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 NALCNQ8IZF0 1738 aa2.43□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 REV3LO60673 3130 aa2.43□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 SPEF2Q9C093 1822 aa2.43□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 PTPRDP23468 1912 aa2.43□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 AKAIN1P0CW23 69 aa2.43□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP2.43□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 S100PP25815 95 aa2.43□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 KRTAP12-3P60328 96 aa2.43□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 OCIAD2Q56VL3 154 aa2.43□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 COPS9Q8WXC6 57 aa2.43□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 LINC00526Q96FQ7 95 aa2.43□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 SEC11CQ9BY50 192 aa2.43□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa2.43□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 MBD5Q9P267 1494 aa2.43□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 ADAMTS12P58397 1594 aa2.43□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 RREB1Q92766 1687 aa2.43□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 CASZ1Q86V15 1759 aa2.43□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 HIVEP2P31629 2446 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 ATP10BO94823 1461 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 NUPR2A6NF83 97 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 F6UZH7 168 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 IL9P15248 144 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 PDE6GP18545 87 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 IQCJQ1A5X6 159 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 SPATA45Q537H7 98 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 OR2T2Q6IF00 324 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 PP6455Q8WZ26 134 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 SCN3BQ9NY72 215 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 USP34Q70CQ2 3546 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 HTTP42858 3142 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 WDFY4Q6ZS81 3184 aa2.41□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.2 ms