RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa11.25□□□□□ -0.61
TOP3B-206ENST00000436282 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP11.24□□□□□ -0.618e-9■■□□□ 14.5
TOP3B-206ENST00000436282 IGHV4-39P01824 125 aa11.24□□□□□ -0.61
TOP3B-206ENST00000436282 CFC1BP0CG36 223 aa11.24□□□□□ -0.61
TOP3B-206ENST00000436282 CFC1P0CG37 223 aa11.24□□□□□ -0.61
TOP3B-206ENST00000436282 C10orf126Q8N4M7 172 aa11.24□□□□□ -0.61
TOP3B-206ENST00000436282 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa11.24□□□□□ -0.61
TOP3B-206ENST00000436282 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
TOP3B-206ENST00000436282 EMP1P54849 157 aa11.24□□□□□ -0.61
TOP3B-206ENST00000436282 SLC25A29Q8N8R3 303 aa11.24□□□□□ -0.61
TOP3B-206ENST00000436282 FAM19A4Q96LR4 140 aa11.24□□□□□ -0.61
TOP3B-206ENST00000436282 SOCS3O14543 225 aa11.23□□□□□ -0.61
TOP3B-206ENST00000436282 GNRH2O43555 120 aa11.23□□□□□ -0.61
TOP3B-206ENST00000436282 NXPH4O95158 308 aa11.23□□□□□ -0.61
TOP3B-206ENST00000436282 Q6ZS46 218 aa11.23□□□□□ -0.61
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM141Q96I45 108 aa11.23□□□□□ -0.61
TOP3B-206ENST00000436282 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa11.23□□□□□ -0.61
TOP3B-206ENST00000436282 A0A087WW49 117 aa11.23□□□□□ -0.61
TOP3B-206ENST00000436282 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
TOP3B-206ENST00000436282 APRG1Q8IVJ8 170 aa11.23□□□□□ -0.61
TOP3B-206ENST00000436282 ZFHX3Q15911 3703 aa11.23□□□□□ -0.61
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF688P0C7X2 276 aa11.22□□□□□ -0.61
TOP3B-206ENST00000436282 TSPEAR-AS2P59090 65 aa11.22□□□□□ -0.61
TOP3B-206ENST00000436282 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa11.22□□□□□ -0.61
TOP3B-206ENST00000436282 LINC00315P59091 139 aa11.22□□□□□ -0.61
TOP3B-206ENST00000436282 TIMM17AQ99595 171 aa11.22□□□□□ -0.61
TOP3B-206ENST00000436282 PRO1854Q9UHT4 67 aa11.22□□□□□ -0.61
TOP3B-206ENST00000436282 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
TOP3B-206ENST00000436282 DEFB1P60022 68 aa11.22□□□□□ -0.61
TOP3B-206ENST00000436282 VPS13CQ709C8 3753 aa11.21□□□□□ -0.61
TOP3B-206ENST00000436282 FAM223BA6NKX1 122 aa11.21□□□□□ -0.61
TOP3B-206ENST00000436282 ARL3P36405 182 aa11.21□□□□□ -0.61
TOP3B-206ENST00000436282 FAM223AQ8IWN6 122 aa11.21□□□□□ -0.61
TOP3B-206ENST00000436282 ANKRD29Q8N6D5 301 aa11.21□□□□□ -0.61
TOP3B-206ENST00000436282 C5orf56Q8N8D9 126 aa11.21□□□□□ -0.61
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM170BQ5T4T1 132 aa11.21□□□□□ -0.62
TOP3B-206ENST00000436282 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa11.2□□□□□ -0.62
TOP3B-206ENST00000436282 SCGB1C2P0DMR2 95 aa11.2□□□□□ -0.62
TOP3B-206ENST00000436282 RPL39P62891 51 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
TOP3B-206ENST00000436282 LY6EQ16553 131 aa11.2□□□□□ -0.62
TOP3B-206ENST00000436282 AMELXQ99217 191 aa11.2□□□□□ -0.62
TOP3B-206ENST00000436282 ERG28Q9UKR5 140 aa11.2□□□□□ -0.62
TOP3B-206ENST00000436282 ABCA2Q9BZC7 2435 aa11.2□□□□□ -0.62
TOP3B-206ENST00000436282 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa11.2□□□□□ -0.62
TOP3B-206ENST00000436282 VCYO14598 125 aa11.2□□□□□ -0.62
TOP3B-206ENST00000436282 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa11.2□□□□□ -0.62
TOP3B-206ENST00000436282 KIR2DL4Q99706 377 aa11.2□□□□□ -0.62
TOP3B-206ENST00000436282 TRAV41A0A0B4J266 112 aa11.19□□□□□ -0.62
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM262E9PQX1 116 aa11.19□□□□□ -0.62
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF876PQ49A33 203 aa11.19□□□□□ -0.62
TOP3B-206ENST00000436282 ZNRF2Q8NHG8 242 aa11.19□□□□□ -0.62
TOP3B-206ENST00000436282 MUC4Q99102 2169 aa11.19□□□□□ -0.62
TOP3B-206ENST00000436282 J3QQQ9 107 aa11.19□□□□□ -0.62
TOP3B-206ENST00000436282 TGFAP01135 160 aa11.19□□□□□ -0.62
TOP3B-206ENST00000436282 SUMO4Q6EEV6 95 aa11.19□□□□□ -0.62
TOP3B-206ENST00000436282 CSPG4Q6UVK1 2322 aa11.19□□□□□ -0.62
TOP3B-206ENST00000436282 NDUFA4O00483 81 aa11.18□□□□□ -0.62
TOP3B-206ENST00000436282 C19orf54Q5BKX5 351 aa11.18□□□□□ -0.62
TOP3B-206ENST00000436282 CACNA1AO00555 2505 aa11.18□□□□□ -0.62
TOP3B-206ENST00000436282 F6UB75 175 aa11.18□□□□□ -0.62
TOP3B-206ENST00000436282 M0QXV9 152 aa11.18□□□□□ -0.62
TOP3B-206ENST00000436282 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
TOP3B-206ENST00000436282 CFAP46Q8IYW2 2715 aa11.18□□□□□ -0.62
TOP3B-206ENST00000436282 CCL19Q99731 98 aa11.18□□□□□ -0.62
TOP3B-206ENST00000436282 SLC25A20O43772 301 aa11.17□□□□□ -0.62
TOP3B-206ENST00000436282 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa11.17□□□□□ -0.62
TOP3B-206ENST00000436282 MOB4Q9Y3A3 225 aa11.17□□□□□ -0.62
TOP3B-206ENST00000436282 TRBV12-3P01733 135 aa11.17□□□□□ -0.62
TOP3B-206ENST00000436282 IGHV1-69P01742 117 aa11.17□□□□□ -0.62
TOP3B-206ENST00000436282 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa11.17□□□□□ -0.62
TOP3B-206ENST00000436282 RNF183Q96D59 192 aa11.17□□□□□ -0.62
TOP3B-206ENST00000436282 PIMREGQ9BSJ6 248 aa11.17□□□□□ -0.62
TOP3B-206ENST00000436282 SDHAF1A6NFY7 115 aa11.16□□□□□ -0.62
TOP3B-206ENST00000436282 JPT2Q9H910 190 aa11.16□□□□□ -0.62
TOP3B-206ENST00000436282 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa11.16□□□□□ -0.62
TOP3B-206ENST00000436282 A4D1N5 150 aa11.16□□□□□ -0.62
TOP3B-206ENST00000436282 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
TOP3B-206ENST00000436282 ATP5J2P56134 94 aa11.16□□□□□ -0.62
TOP3B-206ENST00000436282 RPL11P62913 178 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
TOP3B-206ENST00000436282 ACACBO00763 2458 aa11.16□□□□□ -0.62
TOP3B-206ENST00000436282 IGHV3-33P01772 117 aa11.15□□□□□ -0.62
TOP3B-206ENST00000436282 ZFAND6Q6FIF0 208 aa11.15□□□□□ -0.62
TOP3B-206ENST00000436282 FLNCQ14315 2725 aa11.15□□□□□ -0.62
TOP3B-206ENST00000436282 C9JAW5 83 aa11.15□□□□□ -0.62
TOP3B-206ENST00000436282 ANAPC13Q9BS18 74 aa11.15□□□□□ -0.62
TOP3B-206ENST00000436282 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.63
TOP3B-206ENST00000436282 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa11.14□□□□□ -0.63
TOP3B-206ENST00000436282 KLLNB2CW77 178 aa11.14□□□□□ -0.63
TOP3B-206ENST00000436282 F5H697 171 aa11.14□□□□□ -0.63
TOP3B-206ENST00000436282 LEPROTO15243 131 aa11.14□□□□□ -0.63
TOP3B-206ENST00000436282 IGHV3-11P01762 117 aa11.14□□□□□ -0.63
TOP3B-206ENST00000436282 FAM159AQ6UWV7 190 aa11.14□□□□□ -0.63
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
TOP3B-206ENST00000436282 RAX2Q96IS3 184 aa11.14□□□□□ -0.63
TOP3B-206ENST00000436282 A0A087WWL8 130 aa11.14□□□□□ -0.63
TOP3B-206ENST00000436282 A0A0B4J2C4 111 aa11.14□□□□□ -0.63
TOP3B-206ENST00000436282 TEX29Q8N6K0 151 aa11.14□□□□□ -0.63
TOP3B-206ENST00000436282 CITED1Q99966 193 aa11.14□□□□□ -0.63
TOP3B-206ENST00000436282 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa11.14□□□□□ -0.63
TOP3B-206ENST00000436282 LGALS9O00182 355 aa11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.5 ms