RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423112.2

RFX3-AS1-201, RFX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RFX3-AS1, Length 552 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3-AS1-201ENST00000423112 A0A087WWL8 130 aa10.35□□□□□ -0.75
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 PQLC2Q6ZP29 291 aa10.35□□□□□ -0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CHCHD5Q9BSY4 110 aa10.35□□□□□ -0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PSG8Q9UQ74 426 aa10.35□□□□□ -0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LPAP08519 4548 aa10.35□□□□□ -0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa10.34□□□□□ -0.75
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 TCRAP04437 139 aa10.33□□□□□ -0.76
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa10.33□□□□□ -0.76
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LINC00269Q8N2A0 174 aa10.33□□□□□ -0.76
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C5orf17Q8NAS9 161 aa10.33□□□□□ -0.76
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR11H4Q8NGC9 324 aa10.33□□□□□ -0.76
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR10G8Q8NGN5 311 aa10.33□□□□□ -0.76
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 CLPSL2Q6UWE3 100 aa10.32□□□□□ -0.76
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLPIP03973 132 aa10.31□□□□□ -0.76
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMEM97Q5BJF2 176 aa10.31□□□□□ -0.76
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 A0A1W2PPV4 95 aa10.3□□□□□ -0.76
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FABP5P3A8MUU1 101 aa10.3□□□□□ -0.76
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RBX1P62877 108 aa10.3□□□□□ -0.76
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP10.3□□□□□ -0.76
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MAJINQ3KP22 176 aa10.3□□□□□ -0.76
RFX3-AS1-201ENST00000423112 VAX2Q9UIW0 290 aa10.3□□□□□ -0.76
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 B4DEV8 164 aa10.29□□□□□ -0.76
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP10.29□□□□□ -0.76
RFX3-AS1-201ENST00000423112 P01737 135 aa10.29□□□□□ -0.76
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ARMS2P0C7Q2 107 aa10.29□□□□□ -0.76
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GZMBP10144 247 aa10.29□□□□□ -0.76
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 DNLZQ5SXM8 178 aa10.29□□□□□ -0.76
RFX3-AS1-201ENST00000423112 STPG4Q8N801 248 aa10.29□□□□□ -0.76
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SEC22CQ9BRL7 303 aa10.29□□□□□ -0.76
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa10.29□□□□□ -0.76
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa10.28□□□□□ -0.76
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM231BA6NCW3 169 aa10.28□□□□□ -0.76
RFX3-AS1-201ENST00000423112 REG3AQ06141 175 aa10.28□□□□□ -0.76
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LYPD6BQ8NI32 183 aa10.28□□□□□ -0.76
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAT4Q6V0I7 4981 aa10.28□□□□□ -0.76
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 SCGB1C1Q8TD33 95 aa10.27□□□□□ -0.77
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa10.26□□□□□ -0.77
RFX3-AS1-201ENST00000423112 M0R381 172 aa10.26□□□□□ -0.77
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IFNA7P01567 189 aa10.26□□□□□ -0.77
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TPT1P13693 172 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RAB4BP61018 213 aa10.26□□□□□ -0.77
RFX3-AS1-201ENST00000423112 Q6ZRP5 223 aa10.26□□□□□ -0.77
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa10.26□□□□□ -0.77
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RPS10P46783 165 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GAGE6Q13070 117 aa10.25□□□□□ -0.77
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZFP82Q8N141 532 aa10.25□□□□□ -0.77
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EPDR1Q9UM22 224 aa10.25□□□□□ -0.77
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa10.24□□□□□ -0.77
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRAV6A0A075B6T7 132 aa10.24□□□□□ -0.77
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRBOX1C9JBD0 128 aa10.24□□□□□ -0.77
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CFAP161Q6P656 301 aa10.24□□□□□ -0.77
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa10.24□□□□□ -0.77
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa10.24□□□□□ -0.77
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LINC00474Q9P2X8 69 aa10.24□□□□□ -0.77
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa10.23□□□□□ -0.77
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ARL14EPLP0DKL9 152 aa10.23□□□□□ -0.77
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRR27Q6MZM9 219 aa10.23□□□□□ -0.77
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF664Q8N3J9 261 aa10.23□□□□□ -0.77
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NUDT15Q9NV35 164 aa10.23□□□□□ -0.77
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GRIFINA4D1Z8 144 aa10.22□□□□□ -0.77
RFX3-AS1-201ENST00000423112 M0R036 132 aa10.22□□□□□ -0.77
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF56Q15929 161 aa10.22□□□□□ -0.77
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DERL1Q9BUN8 251 aa10.22□□□□□ -0.77
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa10.22□□□□□ -0.77
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa10.22□□□□□ -0.77
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa10.21□□□□□ -0.77
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IL7P13232 177 aa10.21□□□□□ -0.77
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa10.21□□□□□ -0.77
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SUN5Q8TC36 379 aa10.21□□□□□ -0.77
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa10.2□□□□□ -0.78
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LYRM1O43325 122 aa10.2□□□□□ -0.78
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RAB2AP61019 212 aa10.2□□□□□ -0.78
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IQCJQ1A5X6 159 aa10.2□□□□□ -0.78
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PKIGQ9Y2B9 76 aa10.2□□□□□ -0.78
RFX3-AS1-201ENST00000423112 H0YIZ8 118 aa10.19□□□□□ -0.78
RFX3-AS1-201ENST00000423112 STAG3L2P0CL84 134 aa10.19□□□□□ -0.78
RFX3-AS1-201ENST00000423112 STAG3L3P0CL85 134 aa10.19□□□□□ -0.78
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RAB5CP51148 216 aa10.19□□□□□ -0.78
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HSPB11Q9Y547 144 aa10.19□□□□□ -0.78
RFX3-AS1-201ENST00000423112 A0A096LNI7 61 aa10.18□□□□□ -0.78
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