RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218348.7

USP11-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 11, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP11, Length 3,338 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11-201ENST00000218348 C2CD3Q4AC94 2353 aa7.58□□□□□ -1.2
USP11-201ENST00000218348 FN1P02751 2386 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
USP11-201ENST00000218348 APOMO95445 188 aa7.58□□□□□ -1.2
USP11-201ENST00000218348 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
USP11-201ENST00000218348 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
USP11-201ENST00000218348 CT83Q5H943 113 aa7.57□□□□□ -1.2
USP11-201ENST00000218348 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
USP11-201ENST00000218348 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa7.57□□□□□ -1.2
USP11-201ENST00000218348 MS4A6AQ9H2W1 248 aa7.57□□□□□ -1.2
USP11-201ENST00000218348 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa7.57□□□□□ -1.2
USP11-201ENST00000218348 C2orf70A6NJV1 201 aa7.57□□□□□ -1.2
USP11-201ENST00000218348 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
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USP11-201ENST00000218348 TMEM70Q9BUB7 260 aa7.57□□□□□ -1.2
USP11-201ENST00000218348 HAX1O00165 279 aa7.57□□□□□ -1.2
USP11-201ENST00000218348 WIPF1O43516 503 aa7.57□□□□□ -1.2
USP11-201ENST00000218348 PRR9Q5T870 116 aa7.57□□□□□ -1.2
USP11-201ENST00000218348 EDA2RQ9HAV5 297 aa7.57□□□□□ -1.2
USP11-201ENST00000218348 ANK2Q01484 3957 aa7.57□□□□□ -1.2
USP11-201ENST00000218348 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa7.56□□□□□ -1.2
USP11-201ENST00000218348 FAM223BA6NKX1 122 aa7.56□□□□□ -1.2
USP11-201ENST00000218348 RASL11AQ6T310 242 aa7.56□□□□□ -1.2
USP11-201ENST00000218348 FAM223AQ8IWN6 122 aa7.56□□□□□ -1.2
USP11-201ENST00000218348 GFRA4Q9GZZ7 299 aa7.56□□□□□ -1.2
USP11-201ENST00000218348 LEPROTL1O95214 131 aa7.56□□□□□ -1.2
USP11-201ENST00000218348 CKS2P33552 79 aa7.56□□□□□ -1.2
USP11-201ENST00000218348 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
USP11-201ENST00000218348 C18orf65Q6ZTR6 163 aa7.56□□□□□ -1.2
USP11-201ENST00000218348 H3BVH4 76 aa7.55□□□□□ -1.2
USP11-201ENST00000218348 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.55□□□□□ -1.2
USP11-201ENST00000218348 TTC32Q5I0X7 151 aa7.55□□□□□ -1.2
USP11-201ENST00000218348 OR8A1Q8NGG7 326 aa7.55□□□□□ -1.2
USP11-201ENST00000218348 HIVEP2P31629 2446 aa7.55□□□□□ -1.2
USP11-201ENST00000218348 NACAE9PAV3 2078 aa7.55□□□□□ -1.2
USP11-201ENST00000218348 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa7.55□□□□□ -1.2
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USP11-201ENST00000218348 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
USP11-201ENST00000218348 SYNJ2BPP57105 145 aa7.55□□□□□ -1.2
USP11-201ENST00000218348 M0R381 172 aa7.55□□□□□ -1.2
USP11-201ENST00000218348 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
USP11-201ENST00000218348 C19orf54Q5BKX5 351 aa7.55□□□□□ -1.2
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USP11-201ENST00000218348 SLC50A1Q9BRV3 221 aa7.55□□□□□ -1.2
USP11-201ENST00000218348 F8WDY8 70 aa7.54□□□□□ -1.2
USP11-201ENST00000218348 NPYP01303 97 aa7.54□□□□□ -1.2
USP11-201ENST00000218348 GCSHP23434 173 aa7.54□□□□□ -1.2
USP11-201ENST00000218348 AP5S1Q9NUS5 200 aa7.54□□□□□ -1.2
USP11-201ENST00000218348 CMYA5Q8N3K9 4069 aa7.54□□□□□ -1.2
USP11-201ENST00000218348 HTN1P15515 57 aa7.53□□□□□ -1.2
USP11-201ENST00000218348 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
USP11-201ENST00000218348 F8W1H4 67 aa7.53□□□□□ -1.2
USP11-201ENST00000218348 EMP1P54849 157 aa7.53□□□□□ -1.2
USP11-201ENST00000218348 SEC61GP60059 68 aa7.53□□□□□ -1.2
USP11-201ENST00000218348 GAGE13Q4V321 117 aa7.53□□□□□ -1.2
USP11-201ENST00000218348 ZNF575Q86XF7 245 aa7.53□□□□□ -1.2
USP11-201ENST00000218348 NDUFA4O00483 81 aa7.53□□□□□ -1.2
USP11-201ENST00000218348 S100A4P26447 101 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
USP11-201ENST00000218348 FOXI1Q12951 378 aa7.53□□□□□ -1.2
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USP11-201ENST00000218348 USMG5Q96IX5 58 aa7.52□□□□□ -1.21
USP11-201ENST00000218348 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa7.52□□□□□ -1.21
USP11-201ENST00000218348 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa7.52□□□□□ -1.21
USP11-201ENST00000218348 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa7.52□□□□□ -1.21
USP11-201ENST00000218348 A0A1W2PRX2 142 aa7.52□□□□□ -1.21
USP11-201ENST00000218348 GNRH2O43555 120 aa7.52□□□□□ -1.21
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USP11-201ENST00000218348 GAGE2BQ13066 116 aa7.52□□□□□ -1.21
USP11-201ENST00000218348 GAGE2EQ4V326 116 aa7.52□□□□□ -1.21
USP11-201ENST00000218348 NFE4Q86UQ8 179 aa7.52□□□□□ -1.21
USP11-201ENST00000218348 TMEM191AQ9H0A3 160 aa7.52□□□□□ -1.21
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USP11-201ENST00000218348 GAGE2DQ9UEU5 116 aa7.52□□□□□ -1.21
USP11-201ENST00000218348 MAST4O15021 2626 aa7.52□□□□□ -1.21
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USP11-201ENST00000218348 ORMDL3Q8N138 153 aa7.52□□□□□ -1.21
USP11-201ENST00000218348 TMEM190Q8WZ59 177 aa7.52□□□□□ -1.21
USP11-201ENST00000218348 U3KQE9 123 aa7.52□□□□□ -1.21
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USP11-201ENST00000218348 TMEM160Q9NX00 188 aa7.51□□□□□ -1.21
USP11-201ENST00000218348 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa7.5□□□□□ -1.21
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USP11-201ENST00000218348 OR5AL1P0C617 328 aa7.5□□□□□ -1.21
USP11-201ENST00000218348 COX8AP10176 69 aa7.5□□□□□ -1.21
USP11-201ENST00000218348 C9orf139Q6ZV77 190 aa7.5□□□□□ -1.21
USP11-201ENST00000218348 SMR3AQ99954 134 aa7.5□□□□□ -1.21
USP11-201ENST00000218348 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
USP11-201ENST00000218348 TRAV4A0A0B4J268 109 aa7.5□□□□□ -1.21
USP11-201ENST00000218348 IGLC6P0CF74 106 aa7.5□□□□□ -1.21
USP11-201ENST00000218348 IFITM1P13164 125 aa7.5□□□□□ -1.21
USP11-201ENST00000218348 SLURP1P55000 103 aa7.5□□□□□ -1.21
USP11-201ENST00000218348 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa7.5□□□□□ -1.21
USP11-201ENST00000218348 PSMB8P28062 276 aa7.5□□□□□ -1.21
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