RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427778.1

LINC00963-204, long intergenic non-protein coding RNA 963, human

TSL 2

Gene LINC00963, Length 382 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINC00963-204	ENST00000427778		A0A0J9YY99	117 aa		6.11	□□□□□ -1.43
LINC00963-204	ENST00000427778	PFDN1	O60925	122 aa		6.11	□□□□□ -1.43
LINC00963-204	ENST00000427778	C1QB	P02746	253 aa		6.11	□□□□□ -1.43
LINC00963-204	ENST00000427778	RAB5C	P51148	216 aa		6.11	□□□□□ -1.43
LINC00963-204	ENST00000427778	FHL2	Q14192	279 aa		6.11	□□□□□ -1.43
LINC00963-204	ENST00000427778	PRNT	Q86SH4	94 aa		6.11	□□□□□ -1.43
LINC00963-204	ENST00000427778	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		6.11	□□□□□ -1.43
LINC00963-204	ENST00000427778	SFT2D1	Q8WV19	159 aa		6.11	□□□□□ -1.43
LINC00963-204	ENST00000427778	FMC1	Q96HJ9	113 aa		6.11	□□□□□ -1.43
LINC00963-204	ENST00000427778	LINC00479	Q96M42	142 aa		6.11	□□□□□ -1.43
LINC00963-204	ENST00000427778	C9orf85	Q96MD7	179 aa		6.11	□□□□□ -1.43
LINC00963-204	ENST00000427778	NAGK	Q9UJ70	344 aa		6.11	□□□□□ -1.43
LINC00963-204	ENST00000427778	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		6.11	□□□□□ -1.43
LINC00963-204	ENST00000427778		A0A096LPF7	62 aa		6.1	□□□□□ -1.43
LINC00963-204	ENST00000427778	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		6.1	□□□□□ -1.43
LINC00963-204	ENST00000427778	RTL8C	O15255	209 aa		6.1	□□□□□ -1.43
LINC00963-204	ENST00000427778	GNRH2	O43555	120 aa		6.1	□□□□□ -1.43
LINC00963-204	ENST00000427778	CRYBA4	P53673	196 aa		6.1	□□□□□ -1.43
LINC00963-204	ENST00000427778	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		6.1	□□□□□ -1.43
LINC00963-204	ENST00000427778	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	6.1	□□□□□ -1.43
LINC00963-204	ENST00000427778	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		6.1	□□□□□ -1.43
LINC00963-204	ENST00000427778	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	6.1	□□□□□ -1.43
LINC00963-204	ENST00000427778	IGLV2-18	A0A075B6J9	118 aa		6.09	□□□□□ -1.43
LINC00963-204	ENST00000427778	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		6.09	□□□□□ -1.43
LINC00963-204	ENST00000427778	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		6.09	□□□□□ -1.43
LINC00963-204	ENST00000427778	CIDEA	O60543	219 aa		6.09	□□□□□ -1.43
LINC00963-204	ENST00000427778	PAGE4	O60829	102 aa		6.09	□□□□□ -1.43
LINC00963-204	ENST00000427778	LTA	P01374	205 aa		6.09	□□□□□ -1.43
LINC00963-204	ENST00000427778	S100A9	P06702	114 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
LINC00963-204	ENST00000427778	ESRG	Q1W209	222 aa		6.09	□□□□□ -1.43
LINC00963-204	ENST00000427778	SOHLH1	Q5JUK2	328 aa		6.09	□□□□□ -1.43
LINC00963-204	ENST00000427778	DNLZ	Q5SXM8	178 aa		6.09	□□□□□ -1.43
LINC00963-204	ENST00000427778	ZNF479	Q96JC4	524 aa		6.09	□□□□□ -1.43
LINC00963-204	ENST00000427778	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		6.09	□□□□□ -1.43
LINC00963-204	ENST00000427778	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		6.08	□□□□□ -1.44
LINC00963-204	ENST00000427778	TRGV4	A0A0C4DH28	118 aa		6.08	□□□□□ -1.44
LINC00963-204	ENST00000427778		A0A1W2PPQ1	181 aa		6.08	□□□□□ -1.44
LINC00963-204	ENST00000427778		M0R2N4	97 aa		6.08	□□□□□ -1.44
LINC00963-204	ENST00000427778	IGHV3-53	P01767	116 aa		6.08	□□□□□ -1.44
LINC00963-204	ENST00000427778	ORM1	P02763	201 aa		6.08	□□□□□ -1.44
LINC00963-204	ENST00000427778	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
LINC00963-204	ENST00000427778	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
LINC00963-204	ENST00000427778	UBE2G1	P62253	170 aa		6.08	□□□□□ -1.44
LINC00963-204	ENST00000427778	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
LINC00963-204	ENST00000427778	ZNF674	Q2M3X9	581 aa		6.08	□□□□□ -1.44
LINC00963-204	ENST00000427778	ZNF876P	Q49A33	203 aa		6.08	□□□□□ -1.44
LINC00963-204	ENST00000427778	TTC32	Q5I0X7	151 aa		6.08	□□□□□ -1.44
LINC00963-204	ENST00000427778	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		6.08	□□□□□ -1.44
LINC00963-204	ENST00000427778	CST9LP1	Q5W188	147 aa		6.08	□□□□□ -1.44
LINC00963-204	ENST00000427778	AKAP14	Q86UN6	197 aa		6.08	□□□□□ -1.44
LINC00963-204	ENST00000427778	SLC51B	Q86UW2	128 aa		6.08	□□□□□ -1.44
LINC00963-204	ENST00000427778	OR4C5	Q8NGB2	326 aa		6.08	□□□□□ -1.44
LINC00963-204	ENST00000427778	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		6.08	□□□□□ -1.44
LINC00963-204	ENST00000427778	IL36B	Q9NZH7	164 aa		6.08	□□□□□ -1.44
LINC00963-204	ENST00000427778		C9JCJ5	164 aa		6.07	□□□□□ -1.44
LINC00963-204	ENST00000427778	RS1	O15537	224 aa		6.07	□□□□□ -1.44
LINC00963-204	ENST00000427778	SFTA3	P0C7M3	94 aa		6.07	□□□□□ -1.44
LINC00963-204	ENST00000427778	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
LINC00963-204	ENST00000427778	SULT1A2	P50226	295 aa		6.07	□□□□□ -1.44
LINC00963-204	ENST00000427778	CRIP1	P50238	77 aa		6.07	□□□□□ -1.44
LINC00963-204	ENST00000427778	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		6.07	□□□□□ -1.44
LINC00963-204	ENST00000427778	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		6.07	□□□□□ -1.44
LINC00963-204	ENST00000427778	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		6.07	□□□□□ -1.44
LINC00963-204	ENST00000427778	C11orf52	Q96A22	123 aa		6.07	□□□□□ -1.44
LINC00963-204	ENST00000427778	TXNDC17	Q9BRA2	123 aa		6.07	□□□□□ -1.44
LINC00963-204	ENST00000427778	MLST8	Q9BVC4	326 aa		6.07	□□□□□ -1.44
LINC00963-204	ENST00000427778		Q9H8V8	135 aa		6.07	□□□□□ -1.44
LINC00963-204	ENST00000427778	MANBAL	Q9NQG1	85 aa		6.07	□□□□□ -1.44
LINC00963-204	ENST00000427778	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		6.06	□□□□□ -1.44
LINC00963-204	ENST00000427778		B4DEV8	164 aa		6.06	□□□□□ -1.44
LINC00963-204	ENST00000427778	KRBOX1	C9JBD0	128 aa		6.06	□□□□□ -1.44
LINC00963-204	ENST00000427778	TEX46	H3BTG2	121 aa		6.06	□□□□□ -1.44
LINC00963-204	ENST00000427778		K7EQD1	137 aa		6.06	□□□□□ -1.44
LINC00963-204	ENST00000427778	SH2D1A	O60880	128 aa		6.06	□□□□□ -1.44
LINC00963-204	ENST00000427778	ASIP	P42127	132 aa		6.06	□□□□□ -1.44
LINC00963-204	ENST00000427778	AKR1C3	P42330	323 aa		6.06	□□□□□ -1.44
LINC00963-204	ENST00000427778	TIRAP	P58753	221 aa		6.06	□□□□□ -1.44
LINC00963-204	ENST00000427778	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		6.06	□□□□□ -1.44
LINC00963-204	ENST00000427778	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		6.06	□□□□□ -1.44
LINC00963-204	ENST00000427778	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		6.06	□□□□□ -1.44
LINC00963-204	ENST00000427778	ZNF575	Q86XF7	245 aa		6.06	□□□□□ -1.44
LINC00963-204	ENST00000427778	C9orf62	Q8N4C0	152 aa		6.06	□□□□□ -1.44
LINC00963-204	ENST00000427778	KRTAP9-3	Q9BYQ3	159 aa		6.06	□□□□□ -1.44
LINC00963-204	ENST00000427778	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		6.06	□□□□□ -1.44
LINC00963-204	ENST00000427778	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
LINC00963-204	ENST00000427778	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		6.05	□□□□□ -1.44
LINC00963-204	ENST00000427778	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		6.05	□□□□□ -1.44
LINC00963-204	ENST00000427778		A8MWV9	139 aa		6.05	□□□□□ -1.44
LINC00963-204	ENST00000427778		K7EP13	123 aa		6.05	□□□□□ -1.44
LINC00963-204	ENST00000427778	CXCL1	P09341	107 aa		6.05	□□□□□ -1.44
LINC00963-204	ENST00000427778	GYPE	P15421	78 aa		6.05	□□□□□ -1.44
LINC00963-204	ENST00000427778	SRI	P30626	198 aa		6.05	□□□□□ -1.44
LINC00963-204	ENST00000427778	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		6.05	□□□□□ -1.44
LINC00963-204	ENST00000427778	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		6.05	□□□□□ -1.44
LINC00963-204	ENST00000427778	C6orf223	Q8N319	242 aa		6.05	□□□□□ -1.44
LINC00963-204	ENST00000427778	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		6.05	□□□□□ -1.44
LINC00963-204	ENST00000427778	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
LINC00963-204	ENST00000427778	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		6.05	□□□□□ -1.44
LINC00963-204	ENST00000427778	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		6.04	□□□□□ -1.44
LINC00963-204	ENST00000427778		A0A1B0GV50	99 aa		6.04	□□□□□ -1.44

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