RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa3.07□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 LINC00336Q6ZUF6 198 aa3.07□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM231DQ6ZW35 169 aa3.07□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa3.07□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 TTC9CQ8N5M4 171 aa3.07□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 Q8N6K4 173 aa3.07□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 C5orf17Q8NAS9 161 aa3.07□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 OR10D4PQ8NGN7 298 aa3.07□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 BLNKQ8WV28 456 aa3.07□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 FMC1Q96HJ9 113 aa3.07□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 CCL19Q99731 98 aa3.07□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 BPESC1Q9GZL8 116 aa3.07□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 Q9H3A6 140 aa3.07□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 NIT2Q9NQR4 276 aa3.07□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 EPDR1Q9UM22 224 aa3.07□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 MOB4Q9Y3A3 225 aa3.07□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 V9GYV3 84 aa3.07□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 LRBAP50851 2863 aa3.07□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa3.07□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 PLXNB1O43157 2135 aa3.07□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa3.06□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A0G2JLM5 398 aa3.06□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 IZUMO1RA6ND01 250 aa3.06□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC17A3O00476 420 aa3.06□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 NPFFO15130 113 aa3.06□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 IGLV2-8P01709 118 aa3.06□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 HLA-DRB1P01911 266 aa3.06□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 IL4P05112 153 aa3.06□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 CD24P25063 80 aa3.06□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 MYCNOSP40205 109 aa3.06□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 RANP62826 216 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 GNG5P63218 68 aa3.06□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa3.06□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 Q56UQ5 140 aa3.06□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 GFI1BQ5VTD9 330 aa3.06□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 RASL11AQ6T310 242 aa3.06□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 BAGE2Q86Y30 109 aa3.06□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 OR8I2Q8N0Y5 310 aa3.06□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 DYNAPQ8N1N2 210 aa3.06□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 CMTM2Q8TAZ6 248 aa3.06□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 HIST1H2BLQ99880 126 aa3.06□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa3.06□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 GNB1LQ9BYB4 327 aa3.06□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.06□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 OTORQ9NRC9 128 aa3.06□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 C21orf62Q9NYP8 219 aa3.06□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF580Q9UK33 172 aa3.06□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 MGAQ8IWI9 3026 aa3.06□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 ZFHX3Q15911 3703 aa3.05□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa3.05□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa3.05□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa3.05□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 LYRM9A8MSI8 78 aa3.05□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 F6UB75 175 aa3.05□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 SMKR1H3BMG3 65 aa3.05□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 IGKV1-17P01599 117 aa3.05□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 HLA-DQA1P01909 254 aa3.05□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 TCRAP04437 139 aa3.05□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 CRISP2P16562 243 aa3.05□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 CBLN1P23435 193 aa3.05□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 NDPQ00604 133 aa3.05□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 PDE6HQ13956 83 aa3.05□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 VAMP3Q15836 100 aa3.05□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 PYY3Q5JQD4 70 aa3.05□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa3.05□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 Q86TA4 180 aa3.05□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 LYPD1Q8N2G4 141 aa3.05□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 NKAPP1Q8N9T2 125 aa3.05□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 Q8N9W7 124 aa3.05□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM75Q8N9X5 138 aa3.05□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 OR4B1Q8NGF8 309 aa3.05□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 GTSF1Q8WW33 167 aa3.05□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 BAALCQ8WXS3 180 aa3.05□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa3.05□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 GPR82Q96P67 336 aa3.05□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 FOXC2Q99958 501 aa3.05□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa3.05□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF586Q9NXT0 402 aa3.05□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF492Q9P255 531 aa3.05□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 XCL2Q9UBD3 114 aa3.05□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 NAT8BQ9UHF3 227 aa3.05□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 NBASA2RRP1 2371 aa3.05□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 F8P00451 2351 aa3.05□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 ABCA4P78363 2273 aa3.05□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa3.04□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 TRBV19A0A075B6N1 114 aa3.04□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 TRAV40A0A0B4J280 105 aa3.04□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa3.04□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 A8MWL6 223 aa3.04□□□□□ -1.92
CAPNS1-210ENST00000590211 TSTD3H0UI37 97 aa3.04□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 86.8 ms