RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	IGLV2-11	P01706	119 aa		14.99	□□□□□ -0.01
PPP4C-205	ENST00000563200	TNP2	Q05952	138 aa		14.99	□□□□□ -0.01
PPP4C-205	ENST00000563200	SLA	Q13239	276 aa		14.99	□□□□□ -0.01
PPP4C-205	ENST00000563200	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		14.99	□□□□□ -0.01
PPP4C-205	ENST00000563200	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		14.99	□□□□□ -0.01
PPP4C-205	ENST00000563200	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	14.98	□□□□□ -0.01
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF479	Q96JC4	524 aa		14.98	□□□□□ -0.01
PPP4C-205	ENST00000563200	C8orf49	Q96NF6	230 aa		14.98	□□□□□ -0.01
PPP4C-205	ENST00000563200	EPDR1	Q9UM22	224 aa		14.98	□□□□□ -0.01
PPP4C-205	ENST00000563200	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		14.98	□□□□□ -0.01
PPP4C-205	ENST00000563200	TYMS	P04818	313 aa		14.97	□□□□□ -0.01
PPP4C-205	ENST00000563200	SFTA3	P0C7M3	94 aa		14.97	□□□□□ -0.01
PPP4C-205	ENST00000563200	TTC32	Q5I0X7	151 aa		14.97	□□□□□ -0.01
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A1W2PPQ1	181 aa		14.96	□□□□□ -0.01
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	14.96	□□□□□ -0.01
PPP4C-205	ENST00000563200	CYTL1	Q9NRR1	136 aa		14.96	□□□□□ -0.01
PPP4C-205	ENST00000563200	PSG8	Q9UQ74	426 aa		14.96	□□□□□ -0.01
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A1W2PRE2	83 aa		14.95	□□□□□ -0.02
PPP4C-205	ENST00000563200	MED14OS	P0DP75	135 aa		14.95	□□□□□ -0.02
PPP4C-205	ENST00000563200	KCNS1	Q96KK3	526 aa		14.95	□□□□□ -0.02
PPP4C-205	ENST00000563200	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		14.95	□□□□□ -0.02
PPP4C-205	ENST00000563200	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		14.95	□□□□□ -0.02
PPP4C-205	ENST00000563200	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		14.95	□□□□□ -0.02
PPP4C-205	ENST00000563200	hCG_2014768	A0A024R1R8	64 aa		14.94	□□□□□ -0.02
PPP4C-205	ENST00000563200	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		14.94	□□□□□ -0.02
PPP4C-205	ENST00000563200		K7EQM0	130 aa		14.94	□□□□□ -0.02
PPP4C-205	ENST00000563200		M0R2P5	195 aa		14.94	□□□□□ -0.02
PPP4C-205	ENST00000563200	TAAR5	O14804	337 aa		14.94	□□□□□ -0.02
PPP4C-205	ENST00000563200	ARPC5	O15511	151 aa		14.94	□□□□□ -0.02
PPP4C-205	ENST00000563200	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		14.94	□□□□□ -0.02
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		14.94	□□□□□ -0.02
PPP4C-205	ENST00000563200	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		14.94	□□□□□ -0.02
PPP4C-205	ENST00000563200	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		14.94	□□□□□ -0.02
PPP4C-205	ENST00000563200	TRGV4	A0A0C4DH28	118 aa		14.93	□□□□□ -0.02
PPP4C-205	ENST00000563200	FLI1	Q01543	452 aa	Predicted RBP	14.93	□□□□□ -0.02
PPP4C-205	ENST00000563200	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		14.92	□□□□□ -0.02
PPP4C-205	ENST00000563200	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
PPP4C-205	ENST00000563200	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		14.92	□□□□□ -0.02
PPP4C-205	ENST00000563200	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
PPP4C-205	ENST00000563200		K7EQD1	137 aa		14.92	□□□□□ -0.02
PPP4C-205	ENST00000563200	GCG	P01275	180 aa		14.92	□□□□□ -0.02
PPP4C-205	ENST00000563200	PFN1	P07737	140 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
PPP4C-205	ENST00000563200	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
PPP4C-205	ENST00000563200	PRNT	Q86SH4	94 aa		14.92	□□□□□ -0.02
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF575	Q86XF7	245 aa		14.92	□□□□□ -0.02
PPP4C-205	ENST00000563200	HSPG2	P98160	4391 aa		14.92	□□□□□ -0.02
PPP4C-205	ENST00000563200	SMLR1	H3BR10	107 aa		14.91	□□□□□ -0.02
PPP4C-205	ENST00000563200	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		14.91	□□□□□ -0.02
PPP4C-205	ENST00000563200	LINC00479	Q96M42	142 aa		14.91	□□□□□ -0.02
PPP4C-205	ENST00000563200	SIVA1	O15304	175 aa		14.9	□□□□□ -0.02
PPP4C-205	ENST00000563200	NXPH4	O95158	308 aa		14.9	□□□□□ -0.02
PPP4C-205	ENST00000563200	SMUG1	Q53HV7	270 aa		14.9	□□□□□ -0.02
PPP4C-205	ENST00000563200	AKR1C8P	Q5T2L2	129 aa		14.9	□□□□□ -0.02
PPP4C-205	ENST00000563200	OR4C5	Q8NGB2	326 aa		14.9	□□□□□ -0.02
PPP4C-205	ENST00000563200	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	14.89	□□□□□ -0.03
PPP4C-205	ENST00000563200	SAPCD1	Q5SSQ6	148 aa		14.89	□□□□□ -0.03
PPP4C-205	ENST00000563200	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		14.88	□□□□□ -0.03
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM74A7	A6NL05	159 aa		14.88	□□□□□ -0.03
PPP4C-205	ENST00000563200	ORM1	P02763	201 aa		14.88	□□□□□ -0.03
PPP4C-205	ENST00000563200	GYPE	P15421	78 aa		14.88	□□□□□ -0.03
PPP4C-205	ENST00000563200	UBE2G2	P60604	165 aa		14.88	□□□□□ -0.03
PPP4C-205	ENST00000563200	C9orf85	Q96MD7	179 aa		14.88	□□□□□ -0.03
PPP4C-205	ENST00000563200	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	14.88	□□□□□ -0.03
PPP4C-205	ENST00000563200	SRI	P30626	198 aa		14.87	□□□□□ -0.03
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF345	Q14585	488 aa		14.87	□□□□□ -0.03
PPP4C-205	ENST00000563200	ZFP69	Q49AA0	526 aa		14.87	□□□□□ -0.03
PPP4C-205	ENST00000563200	NKX6-2	Q9C056	277 aa	Predicted RBP	14.87	□□□□□ -0.03
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF876P	Q49A33	203 aa		14.86	□□□□□ -0.03
PPP4C-205	ENST00000563200	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		14.86	□□□□□ -0.03
PPP4C-205	ENST00000563200	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		14.86	□□□□□ -0.03
PPP4C-205	ENST00000563200	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		14.86	□□□□□ -0.03
PPP4C-205	ENST00000563200	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		14.86	□□□□□ -0.03
PPP4C-205	ENST00000563200	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		14.85	□□□□□ -0.03
PPP4C-205	ENST00000563200		C9JCJ5	164 aa		14.85	□□□□□ -0.03
PPP4C-205	ENST00000563200	PEX7	O00628	323 aa		14.85	□□□□□ -0.03
PPP4C-205	ENST00000563200	IFNA7	P01567	189 aa		14.85	□□□□□ -0.03
PPP4C-205	ENST00000563200	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	14.85	□□□□□ -0.03
PPP4C-205	ENST00000563200	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	14.85	□□□□□ -0.03
PPP4C-205	ENST00000563200	LINC00315	P59091	139 aa		14.85	□□□□□ -0.03
PPP4C-205	ENST00000563200	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		14.85	□□□□□ -0.03
PPP4C-205	ENST00000563200		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	14.85	□□□□□ -0.03
PPP4C-205	ENST00000563200	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		14.85	□□□□□ -0.03
PPP4C-205	ENST00000563200	PTH2	Q96A98	100 aa		14.85	□□□□□ -0.03
PPP4C-205	ENST00000563200	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		14.85	□□□□□ -0.03
PPP4C-205	ENST00000563200	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	14.84	□□□□□ -0.03
PPP4C-205	ENST00000563200	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		14.83	□□□□□ -0.03
PPP4C-205	ENST00000563200	LOC100131303	A0A0U1RQF7	123 aa		14.83	□□□□□ -0.03
PPP4C-205	ENST00000563200	HMSD	A8MTL9	139 aa		14.83	□□□□□ -0.03
PPP4C-205	ENST00000563200	RS1	O15537	224 aa		14.83	□□□□□ -0.03
PPP4C-205	ENST00000563200	FHIT	P49789	147 aa		14.83	□□□□□ -0.03
PPP4C-205	ENST00000563200	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		14.83	□□□□□ -0.03
PPP4C-205	ENST00000563200		Q86TA4	180 aa		14.83	□□□□□ -0.03
PPP4C-205	ENST00000563200	PPT1	P50897	306 aa		14.83	□□□□□ -0.04
PPP4C-205	ENST00000563200	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		14.83	□□□□□ -0.04
PPP4C-205	ENST00000563200	TXNDC17	Q9BRA2	123 aa		14.83	□□□□□ -0.04
PPP4C-205	ENST00000563200	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		14.82	□□□□□ -0.04
PPP4C-205	ENST00000563200	C16orf90	A8MZG2	172 aa		14.82	□□□□□ -0.04
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		14.82	□□□□□ -0.04
PPP4C-205	ENST00000563200	ABCA13	Q86UQ4	5058 aa		14.82	□□□□□ -0.04
PPP4C-205	ENST00000563200	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		14.81	□□□□□ -0.04

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