RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540665.5

TTC28-AS1-221, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTC28-AS1, Length 802 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FAM213BQ8TBF2 198 aa11.31□□□□□ -0.6
TTC28-AS1-221ENST00000540665 C8orf49Q96NF6 230 aa11.31□□□□□ -0.6
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SDF2L1Q9HCN8 221 aa11.31□□□□□ -0.6
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MDFICQ9P1T7 246 aa11.31□□□□□ -0.6
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NAGKQ9UJ70 344 aa11.31□□□□□ -0.6
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MUC4Q99102 2169 aa11.31□□□□□ -0.6
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa11.3□□□□□ -0.6
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GCGP01275 180 aa11.3□□□□□ -0.6
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PFN1P07737 140 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
TTC28-AS1-221ENST00000540665 OR5I1Q13606 314 aa11.3□□□□□ -0.6
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PRNTQ86SH4 94 aa11.3□□□□□ -0.6
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
TTC28-AS1-221ENST00000540665 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa11.29□□□□□ -0.6
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NUDT3O95989 172 aa11.29□□□□□ -0.6
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TYMSP04818 313 aa11.29□□□□□ -0.6
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
TTC28-AS1-221ENST00000540665 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
TTC28-AS1-221ENST00000540665 Q86TA4 180 aa11.29□□□□□ -0.6
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SFT2D1Q8WV19 159 aa11.29□□□□□ -0.6
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RASL10AQ92737 203 aa11.29□□□□□ -0.6
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FRAS1Q86XX4 4008 aa11.29□□□□□ -0.6
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RAB5CP51148 216 aa11.28□□□□□ -0.6
TTC28-AS1-221ENST00000540665 AKAP14Q86UN6 197 aa11.28□□□□□ -0.6
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FMC1Q96HJ9 113 aa11.28□□□□□ -0.6
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LINC00479Q96M42 142 aa11.28□□□□□ -0.6
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa11.27□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 H2AFB1P0C5Y9 115 aa11.27□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CCL18P55774 89 aa11.27□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 COX8CQ7Z4L0 72 aa11.27□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TRAV34A0A0B4J273 112 aa11.26□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 A0A0J9YY99 117 aa11.26□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 M0R2P5 195 aa11.26□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GNRH2O43555 120 aa11.26□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SLAQ13239 276 aa11.26□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CST9LP1Q5W188 147 aa11.26□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 VSIG2Q96IQ7 327 aa11.26□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 C11orf21Q9P2W6 132 aa11.26□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZFP30Q9Y2G7 519 aa11.26□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PAGE4O60829 102 aa11.25□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 UBE2G1P62253 170 aa11.25□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SLC51BQ86UW2 128 aa11.25□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PRO0255Q9UI72 69 aa11.25□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DNAH2Q9P225 4427 aa11.25□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa11.24□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TRAV4A0A0B4J268 109 aa11.24□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 AKR1C3P42330 323 aa11.24□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FHL2Q14192 279 aa11.24□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 C9orf85Q96MD7 179 aa11.24□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LINC00588Q9Y4M8 146 aa11.24□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa11.23□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 A0A096LPF7 62 aa11.23□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FABP5P3A8MUU1 101 aa11.23□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LTAP01374 205 aa11.23□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SULT1A2P50226 295 aa11.23□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CRYBA4P53673 196 aa11.23□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 Q6ZR54 194 aa11.23□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZNRF2Q8NHG8 242 aa11.23□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MANBALQ9NQG1 85 aa11.23□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 BIRC6Q9NR09 4857 aa11.22□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 A0A1B0GV50 99 aa11.22□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TEX46H3BTG2 121 aa11.22□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 IGHV3-53P01767 116 aa11.22□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 S100A9P06702 114 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 C9orf62Q8N4C0 152 aa11.22□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PTH2Q96A98 100 aa11.22□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 UPK3BQ9BT76 320 aa11.22□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 HHLA3Q9XRX5 114 aa11.22□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ICOSQ9Y6W8 199 aa11.22□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa11.21□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa11.21□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa11.21□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PAX4O43316 350 aa11.21□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LINC00336Q6ZUF6 198 aa11.21□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa11.21□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZNF479Q96JC4 524 aa11.21□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DNAH17Q9UFH2 4485 aa11.21□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa11.2□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 M0R2N4 97 aa11.2□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CIDEAO60543 219 aa11.2□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SFTA3P0C7M3 94 aa11.2□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DNLZQ5SXM8 178 aa11.2□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 OR4C5Q8NGB2 326 aa11.2□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TXNDC17Q9BRA2 123 aa11.2□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SCO2A0A1W2PP80 73 aa11.19□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CRIP1P50238 77 aa11.19□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ESRGQ1W209 222 aa11.19□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZNF674Q2M3X9 581 aa11.19□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZNF876PQ49A33 203 aa11.19□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa11.19□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FAM162BQ5T6X4 162 aa11.19□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 B4DEV8 164 aa11.18□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SH2D1AO60880 128 aa11.18□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ORM1P02763 201 aa11.18□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ASIPP42127 132 aa11.18□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 C11orf52Q96A22 123 aa11.18□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 IL36BQ9NZH7 164 aa11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 117.5 ms