RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580814.1

TSG101-211, Transcript of tumor susceptibility 101, humanhuman

TSL 2

Gene TSG101, Length 441 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSG101-211ENST00000580814 NACAE9PAV3 2078 aa3.54□□□□□ -1.84
TSG101-211ENST00000580814 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa3.54□□□□□ -1.84
TSG101-211ENST00000580814 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa3.53□□□□□ -1.84
TSG101-211ENST00000580814 MYH13Q9UKX3 1938 aa3.53□□□□□ -1.84
TSG101-211ENST00000580814 TRAV3A0A0B4J244 114 aa3.53□□□□□ -1.84
TSG101-211ENST00000580814 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa3.53□□□□□ -1.84
TSG101-211ENST00000580814 C17orf98A8MV24 154 aa3.53□□□□□ -1.84
TSG101-211ENST00000580814 CBLN1P23435 193 aa3.53□□□□□ -1.84
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TSG101-211ENST00000580814 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
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TSG101-211ENST00000580814 SSR2P43308 183 aa3.52□□□□□ -1.85
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TSG101-211ENST00000580814 S100A7L2Q5SY68 101 aa3.52□□□□□ -1.85
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TSG101-211ENST00000580814 TIMM9Q9Y5J7 89 aa3.52□□□□□ -1.85
TSG101-211ENST00000580814 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa3.52□□□□□ -1.85
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TSG101-211ENST00000580814 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
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TSG101-211ENST00000580814 CD24P25063 80 aa3.51□□□□□ -1.85
TSG101-211ENST00000580814 FAUP35544 74 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
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TSG101-211ENST00000580814 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
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TSG101-211ENST00000580814 ZNF117Q03924 483 aa3.5□□□□□ -1.85
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TSG101-211ENST00000580814 MON2Q7Z3U7 1717 aa3.48□□□□□ -1.85
TSG101-211ENST00000580814 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa3.48□□□□□ -1.85
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TSG101-211ENST00000580814 ATOX1O00244 68 aa3.48□□□□□ -1.85
TSG101-211ENST00000580814 NUPR1O60356 82 aa3.48□□□□□ -1.85
TSG101-211ENST00000580814 CRPP02741 224 aa3.48□□□□□ -1.85
TSG101-211ENST00000580814 COL8A2P25067 703 aa3.48□□□□□ -1.85
TSG101-211ENST00000580814 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
TSG101-211ENST00000580814 FXYD2P54710 66 aa3.48□□□□□ -1.85
TSG101-211ENST00000580814 ROMO1P60602 79 aa3.48□□□□□ -1.85
TSG101-211ENST00000580814 DEFB116Q30KQ4 102 aa3.48□□□□□ -1.85
TSG101-211ENST00000580814 C1orf134Q5TEV5 83 aa3.48□□□□□ -1.85
TSG101-211ENST00000580814 Q6ZQT0 140 aa3.48□□□□□ -1.85
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