RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574322.5

CTDNEP1-210, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-210ENST00000574322 A8MWP6 167 aa21.6■■□□□ 1.05
CTDNEP1-210ENST00000574322 HOXA5P20719 270 aa21.6■■□□□ 1.05
CTDNEP1-210ENST00000574322 CRIP1P50238 77 aa21.6■■□□□ 1.05
CTDNEP1-210ENST00000574322 NUP35Q8NFH5 326 aa21.6■■□□□ 1.05
CTDNEP1-210ENST00000574322 NEU1Q99519 415 aa21.6■■□□□ 1.05
CTDNEP1-210ENST00000574322 CUBNO60494 3623 aa21.6■■□□□ 1.05
CTDNEP1-210ENST00000574322 PRAC2D3DTV9 90 aa21.6■■□□□ 1.05
CTDNEP1-210ENST00000574322 NDUFA6P56556 154 aa21.6■■□□□ 1.05
CTDNEP1-210ENST00000574322 WDR73Q6P4I2 378 aa21.6■■□□□ 1.05
CTDNEP1-210ENST00000574322 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
CTDNEP1-210ENST00000574322 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
CTDNEP1-210ENST00000574322 HILS1P60008 231 aa21.59■■□□□ 1.05
CTDNEP1-210ENST00000574322 C16orf92Q96LL3 132 aa21.59■■□□□ 1.05
CTDNEP1-210ENST00000574322 C8orf49Q96NF6 230 aa21.59■■□□□ 1.05
CTDNEP1-210ENST00000574322 NRN1Q9NPD7 142 aa21.59■■□□□ 1.05
CTDNEP1-210ENST00000574322 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa21.59■■□□□ 1.05
CTDNEP1-210ENST00000574322 MT-ND6P03923 174 aa21.58■■□□□ 1.05
CTDNEP1-210ENST00000574322 CT45A10P0DMU9 189 aa21.58■■□□□ 1.05
CTDNEP1-210ENST00000574322 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
CTDNEP1-210ENST00000574322 BMI1P35226 326 aa21.58■■□□□ 1.05
CTDNEP1-210ENST00000574322 JMJD8Q96S16 334 aa21.58■■□□□ 1.05
CTDNEP1-210ENST00000574322 HIGD1CA8MV81 97 aa21.58■■□□□ 1.04
CTDNEP1-210ENST00000574322 TCF21O43680 179 aa21.58■■□□□ 1.04
CTDNEP1-210ENST00000574322 TMEM213A2RRL7 107 aa21.57■■□□□ 1.04
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CTDNEP1-210ENST00000574322 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
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CTDNEP1-210ENST00000574322 A0A087WW49 117 aa21.56■■□□□ 1.04
CTDNEP1-210ENST00000574322 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa21.56■■□□□ 1.04
CTDNEP1-210ENST00000574322 CBLN1P23435 193 aa21.56■■□□□ 1.04
CTDNEP1-210ENST00000574322 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
CTDNEP1-210ENST00000574322 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa21.56■■□□□ 1.04
CTDNEP1-210ENST00000574322 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa21.56■■□□□ 1.04
CTDNEP1-210ENST00000574322 ASCL2Q99929 193 aa21.56■■□□□ 1.04
CTDNEP1-210ENST00000574322 TMEM136Q6ZRR5 245 aa21.55■■□□□ 1.04
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR2D3Q8NGH3 330 aa21.55■■□□□ 1.04
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CTDNEP1-210ENST00000574322 WFDC12Q8WWY7 111 aa21.55■■□□□ 1.04
CTDNEP1-210ENST00000574322 NDFIP1Q9BT67 221 aa21.55■■□□□ 1.04
CTDNEP1-210ENST00000574322 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa21.55■■□□□ 1.04
CTDNEP1-210ENST00000574322 SAMD13Q5VXD3 122 aa21.55■■□□□ 1.04
CTDNEP1-210ENST00000574322 FAM162BQ5T6X4 162 aa21.54■■□□□ 1.04
CTDNEP1-210ENST00000574322 Q8TAT8 98 aa21.54■■□□□ 1.04
CTDNEP1-210ENST00000574322 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
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CTDNEP1-210ENST00000574322 SPINK4O60575 86 aa21.53■■□□□ 1.04
CTDNEP1-210ENST00000574322 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
CTDNEP1-210ENST00000574322 C4orf3Q8WVX3 66 aa21.53■■□□□ 1.04
CTDNEP1-210ENST00000574322 C20orf173Q96LM9 149 aa21.53■■□□□ 1.04
CTDNEP1-210ENST00000574322 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa21.53■■□□□ 1.04
CTDNEP1-210ENST00000574322 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
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CTDNEP1-210ENST00000574322 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
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CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF138P52744 262 aa21.5■■□□□ 1.03
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CTDNEP1-210ENST00000574322 RPL11P62913 178 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
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CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
CTDNEP1-210ENST00000574322 Q6AWC8 147 aa21.48■■□□□ 1.03
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CTDNEP1-210ENST00000574322 HIST3H2BBQ8N257 126 aa21.47■■□□□ 1.03
CTDNEP1-210ENST00000574322 DCANP1Q8TF63 244 aa21.47■■□□□ 1.03
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CTDNEP1-210ENST00000574322 AKR1D1P51857 326 aa21.46■■□□□ 1.03
CTDNEP1-210ENST00000574322 C18orf65Q6ZTR6 163 aa21.46■■□□□ 1.03
CTDNEP1-210ENST00000574322 LINC00477Q96M19 166 aa21.46■■□□□ 1.03
CTDNEP1-210ENST00000574322 IFITM10A6NMD0 228 aa21.46■■□□□ 1.03
CTDNEP1-210ENST00000574322 S100A8P05109 93 aa21.46■■□□□ 1.03
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CTDNEP1-210ENST00000574322 C2orf70A6NJV1 201 aa21.45■■□□□ 1.02
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CTDNEP1-210ENST00000574322 GZMBP10144 247 aa21.44■■□□□ 1.02
CTDNEP1-210ENST00000574322 ID1P41134 155 aa21.44■■□□□ 1.02
CTDNEP1-210ENST00000574322 RPS20P60866 119 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
CTDNEP1-210ENST00000574322 HBBP68871 147 aa21.44■■□□□ 1.02
CTDNEP1-210ENST00000574322 GDF5OSQ5U4N7 250 aa21.44■■□□□ 1.02
CTDNEP1-210ENST00000574322 GFI1BQ5VTD9 330 aa21.44■■□□□ 1.02
CTDNEP1-210ENST00000574322 PRIMA1Q86XR5 153 aa21.44■■□□□ 1.02
CTDNEP1-210ENST00000574322 RAB4BP61018 213 aa21.43■■□□□ 1.02
CTDNEP1-210ENST00000574322 HAX1O00165 279 aa21.43■■□□□ 1.02
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR1N2Q8NGR9 330 aa21.43■■□□□ 1.02
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR11H1Q8NG94 326 aa21.42■■□□□ 1.02
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR10J6PQ8NGY7 276 aa21.42■■□□□ 1.02
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