Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD7

NRN1, Neuritin, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRN1Q9NPD7 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NRN1Q9NPD7 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NRN1Q9NPD7 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NRN1Q9NPD7 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NRN1Q9NPD7 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NRN1Q9NPD7 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRN1Q9NPD7 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NRN1Q9NPD7 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NRN1Q9NPD7 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NRN1Q9NPD7 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NRN1Q9NPD7 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NRN1Q9NPD7 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NRN1Q9NPD7 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NRN1Q9NPD7 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NRN1Q9NPD7 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NRN1Q9NPD7 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NRN1Q9NPD7 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NRN1Q9NPD7 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NRN1Q9NPD7 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NRN1Q9NPD7 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NRN1Q9NPD7 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NRN1Q9NPD7 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NRN1Q9NPD7 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NRN1Q9NPD7 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NRN1Q9NPD7 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NRN1Q9NPD7 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NRN1Q9NPD7 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NRN1Q9NPD7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NRN1Q9NPD7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NRN1Q9NPD7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NRN1Q9NPD7 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NRN1Q9NPD7 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NRN1Q9NPD7 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NRN1Q9NPD7 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NRN1Q9NPD7 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NRN1Q9NPD7 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NRN1Q9NPD7 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NRN1Q9NPD7 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NRN1Q9NPD7 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NRN1Q9NPD7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NRN1Q9NPD7 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NRN1Q9NPD7 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NRN1Q9NPD7 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NRN1Q9NPD7 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NRN1Q9NPD7 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NRN1Q9NPD7 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NRN1Q9NPD7 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NRN1Q9NPD7 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NRN1Q9NPD7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NRN1Q9NPD7 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NRN1Q9NPD7 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NRN1Q9NPD7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NRN1Q9NPD7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NRN1Q9NPD7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NRN1Q9NPD7 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NRN1Q9NPD7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NRN1Q9NPD7 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NRN1Q9NPD7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NRN1Q9NPD7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NRN1Q9NPD7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NRN1Q9NPD7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NRN1Q9NPD7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NRN1Q9NPD7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NRN1Q9NPD7 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NRN1Q9NPD7 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NRN1Q9NPD7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NRN1Q9NPD7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NRN1Q9NPD7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NRN1Q9NPD7 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NRN1Q9NPD7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NRN1Q9NPD7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NRN1Q9NPD7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NRN1Q9NPD7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NRN1Q9NPD7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NRN1Q9NPD7 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NRN1Q9NPD7 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NRN1Q9NPD7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NRN1Q9NPD7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NRN1Q9NPD7 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NRN1Q9NPD7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NRN1Q9NPD7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NRN1Q9NPD7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NRN1Q9NPD7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NRN1Q9NPD7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NRN1Q9NPD7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NRN1Q9NPD7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NRN1Q9NPD7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NRN1Q9NPD7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NRN1Q9NPD7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NRN1Q9NPD7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NRN1Q9NPD7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NRN1Q9NPD7 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRN1Q9NPD7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NRN1Q9NPD7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NRN1Q9NPD7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NRN1Q9NPD7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NRN1Q9NPD7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NRN1Q9NPD7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRN1Q9NPD7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRN1Q9NPD7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms