RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 APCSP02743 223 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 CT45A10P0DMU9 189 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 LINC00310P59036 64 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 S100A12P80511 92 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP1-1Q07627 177 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 SLAQ13239 276 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 OR10J3Q5JRS4 329 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 FAM209BQ5JX69 171 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 DNLZQ5SXM8 178 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 GDF5OSQ5U4N7 250 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 Q6YL49 198 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 PRR25Q96S07 402 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 VPREB3Q9UKI3 123 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 PRSS47A8MTI9 375 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 IGHV3-11P01762 117 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 HBBP68871 147 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 KIAA1644Q3SXP7 199 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 OR4X2Q8NGF9 303 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 GLMPQ8WWB7 406 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 FN1P02751 2386 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 JMJD1CQ15652 2540 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa6.27□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 RBAKDNA6NC62 111 aa6.27□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 PSMB8P28062 276 aa6.27□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 SRIP30626 198 aa6.27□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM95Q3KNT9 176 aa6.27□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 C8orf86Q6ZUL3 223 aa6.27□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 PGLYRP4Q96LB8 373 aa6.27□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 VGLL1Q99990 258 aa6.27□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 PRDM13Q9H4Q3 707 aa6.27□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 YAE1D1Q9NRH1 226 aa6.27□□□□□ -1.4
PDE4D-208ENST00000502484 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM89A2RUT3 159 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 A8MWP6 167 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 SERF1AO75920 110 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 GZMBP10144 247 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 CAMPP49913 170 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 LCNL1Q6ZST4 164 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 BAGE3Q86Y29 109 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 F2Z2F3 143 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 PAFAH1B2P68402 229 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 FAM162BQ5T6X4 162 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 Q6AWC8 147 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 CDPF1Q6NVV7 123 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 RNF182Q8N6D2 247 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 Q8TAT8 98 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 CLEC5AQ9NY25 188 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 A0A1W2PS18 150 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 PRAC2D3DTV9 90 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 SH2D1AO60880 128 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 NF1P21359 2839 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 BMI1P35226 326 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 C18orf32Q8TCD1 76 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 NDFIP1Q9BT67 221 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 A0A1B0GUT8 65 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM189A5PLL7 270 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 ERCC8Q13216 396 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 GPHB5Q86YW7 130 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 GATD1Q8NB37 220 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 RCHY1Q96PM5 261 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 C10orf99Q6UWK7 81 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 IL17RELQ6ZVW7 336 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 KCNS1Q96KK3 526 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 C16orf92Q96LL3 132 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF702PQ9H963 129 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 A0A1B0GW15 77 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 INAFM1C9JVW0 142 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 K7EMT4 169 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 SOCS3O14543 225 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 ARMS2P0C7Q2 107 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 RPS20P60866 119 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 RIGQ13278 110 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 LURAP1LQ8IV03 231 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 MYOZ3Q8TDC0 251 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 FAM106AQ4KMX7 169 aa6.23□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM78Q5T7P6 136 aa6.23□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 FABP5P3A8MUU1 101 aa6.23□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 GPX1P07203 203 aa6.23□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 ELANEP08246 267 aa6.23□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF138P52744 262 aa6.23□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 FOXE3Q13461 319 aa6.23□□□□□ -1.41
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