RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498268.1

USP34-222, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, human

TSL 3

Gene USP34, Length 497 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP34-222	ENST00000498268	CROCCP2	Q86T23	111 aa		0.19	□□□□□ -2.38
USP34-222	ENST00000498268	PLAC4	Q8WY50	150 aa		0.19	□□□□□ -2.38
USP34-222	ENST00000498268	LIMD2	Q9BT23	127 aa		0.19	□□□□□ -2.38
USP34-222	ENST00000498268	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	0.19	□□□□□ -2.38
USP34-222	ENST00000498268	LYRM2	Q9NU23	88 aa	Predicted RBP	0.19	□□□□□ -2.38
USP34-222	ENST00000498268	ASB4	Q9Y574	426 aa		0.19	□□□□□ -2.38
USP34-222	ENST00000498268	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		0.19	□□□□□ -2.38
USP34-222	ENST00000498268	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		0.18	□□□□□ -2.38
USP34-222	ENST00000498268	GPR31	O00270	319 aa		0.18	□□□□□ -2.38
USP34-222	ENST00000498268	MT-ND6	P03923	174 aa		0.18	□□□□□ -2.38
USP34-222	ENST00000498268	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		0.18	□□□□□ -2.38
USP34-222	ENST00000498268	CCL4	P13236	92 aa		0.18	□□□□□ -2.38
USP34-222	ENST00000498268	HBB	P68871	147 aa		0.18	□□□□□ -2.38
USP34-222	ENST00000498268	C1orf140	Q5VVS0	124 aa		0.18	□□□□□ -2.38
USP34-222	ENST00000498268	LINC00299	Q6ZSB3	139 aa		0.18	□□□□□ -2.38
USP34-222	ENST00000498268	FAM216B	Q8N7L0	139 aa		0.18	□□□□□ -2.38
USP34-222	ENST00000498268	OR13C6P	Q8NH95	151 aa		0.18	□□□□□ -2.38
USP34-222	ENST00000498268	MALSU1	Q96EH3	234 aa		0.18	□□□□□ -2.38
USP34-222	ENST00000498268	CCL19	Q99731	98 aa		0.18	□□□□□ -2.38
USP34-222	ENST00000498268	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		0.18	□□□□□ -2.38
USP34-222	ENST00000498268	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		0.18	□□□□□ -2.38
USP34-222	ENST00000498268	CST11	Q9H112	138 aa		0.18	□□□□□ -2.38
USP34-222	ENST00000498268	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		0.18	□□□□□ -2.38
USP34-222	ENST00000498268	MAST4	O15021	2626 aa		0.18	□□□□□ -2.38
USP34-222	ENST00000498268	PTPRD	P23468	1912 aa		0.18	□□□□□ -2.38
USP34-222	ENST00000498268	TNC	P24821	2201 aa		0.17	□□□□□ -2.38
USP34-222	ENST00000498268	CST7	O76096	145 aa		0.17	□□□□□ -2.38
USP34-222	ENST00000498268	IFNA1	P01562	189 aa		0.17	□□□□□ -2.38
USP34-222	ENST00000498268	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
USP34-222	ENST00000498268	QRFP	P83859	136 aa		0.17	□□□□□ -2.38
USP34-222	ENST00000498268	CASC2	Q6XLA1	102 aa		0.17	□□□□□ -2.38
USP34-222	ENST00000498268	NEK7	Q8TDX7	302 aa		0.17	□□□□□ -2.38
USP34-222	ENST00000498268	RMND5B	Q96G75	393 aa	Predicted RBP	0.17	□□□□□ -2.38
USP34-222	ENST00000498268	TPRKB	Q9Y3C4	175 aa		0.17	□□□□□ -2.38
USP34-222	ENST00000498268	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		0.17	□□□□□ -2.38
USP34-222	ENST00000498268	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		0.16	□□□□□ -2.38
USP34-222	ENST00000498268	IGHV3-33	P01772	117 aa		0.16	□□□□□ -2.38
USP34-222	ENST00000498268	RPL35	P42766	123 aa	Known RBP	0.16	□□□□□ -2.38
USP34-222	ENST00000498268	ARF6	P62330	175 aa		0.16	□□□□□ -2.38
USP34-222	ENST00000498268	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	0.16	□□□□□ -2.38
USP34-222	ENST00000498268	RPL19	P84098	196 aa	Known RBP	0.16	□□□□□ -2.38
USP34-222	ENST00000498268	NEDD8	Q15843	81 aa		0.16	□□□□□ -2.38
USP34-222	ENST00000498268	RTL8B	Q17RB0	113 aa		0.16	□□□□□ -2.38
USP34-222	ENST00000498268	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		0.16	□□□□□ -2.38
USP34-222	ENST00000498268	GINS3	Q9BRX5	216 aa		0.16	□□□□□ -2.38
USP34-222	ENST00000498268	RTL8A	Q9BWD3	113 aa		0.16	□□□□□ -2.38
USP34-222	ENST00000498268	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		0.16	□□□□□ -2.38
USP34-222	ENST00000498268	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		0.16	□□□□□ -2.38
USP34-222	ENST00000498268	NCAPD3	P42695	1498 aa		0.16	□□□□□ -2.38
USP34-222	ENST00000498268	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		0.16	□□□□□ -2.38
USP34-222	ENST00000498268	KNTC1	P50748	2209 aa		0.15	□□□□□ -2.38
USP34-222	ENST00000498268	PIAS1	O75925	651 aa		0.15	□□□□□ -2.39
USP34-222	ENST00000498268	CSN2	P05814	226 aa		0.15	□□□□□ -2.39
USP34-222	ENST00000498268	PDE6G	P18545	87 aa		0.15	□□□□□ -2.39
USP34-222	ENST00000498268	ZCCHC23	Q6ZST2	131 aa		0.15	□□□□□ -2.39
USP34-222	ENST00000498268	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.39
USP34-222	ENST00000498268	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		0.15	□□□□□ -2.39
USP34-222	ENST00000498268	NUP35	Q8NFH5	326 aa		0.15	□□□□□ -2.39
USP34-222	ENST00000498268	OR4C12	Q96R67	309 aa		0.15	□□□□□ -2.39
USP34-222	ENST00000498268	EFCAB11	Q9BUY7	163 aa		0.15	□□□□□ -2.39
USP34-222	ENST00000498268	OR2H1	Q9GZK4	316 aa		0.15	□□□□□ -2.39
USP34-222	ENST00000498268	STOML2	Q9UJZ1	356 aa		0.15	□□□□□ -2.39
USP34-222	ENST00000498268	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.39
USP34-222	ENST00000498268	CD109	Q6YHK3	1445 aa		0.14	□□□□□ -2.39
USP34-222	ENST00000498268		A0A0J9YY99	117 aa		0.14	□□□□□ -2.39
USP34-222	ENST00000498268	C5orf58	C9J3I9	102 aa		0.14	□□□□□ -2.39
USP34-222	ENST00000498268		H3BQV1	296 aa		0.14	□□□□□ -2.39
USP34-222	ENST00000498268	MFSD11	O43934	449 aa		0.14	□□□□□ -2.39
USP34-222	ENST00000498268	SULT1C4	O75897	302 aa		0.14	□□□□□ -2.39
USP34-222	ENST00000498268	GNG3	P63215	75 aa		0.14	□□□□□ -2.39
USP34-222	ENST00000498268	BASP1	P80723	227 aa	Known RBP	0.14	□□□□□ -2.39
USP34-222	ENST00000498268	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	0.14	□□□□□ -2.39
USP34-222	ENST00000498268	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		0.14	□□□□□ -2.39
USP34-222	ENST00000498268	C10orf111	Q8N326	155 aa		0.14	□□□□□ -2.39
USP34-222	ENST00000498268	SMIM20	Q8N5G0	67 aa		0.14	□□□□□ -2.39
USP34-222	ENST00000498268	GRPEL2	Q8TAA5	225 aa		0.14	□□□□□ -2.39
USP34-222	ENST00000498268	MED11	Q9P086	117 aa		0.14	□□□□□ -2.39
USP34-222	ENST00000498268	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		0.13	□□□□□ -2.39
USP34-222	ENST00000498268	C3orf85	A0A1B0GTC6	90 aa		0.13	□□□□□ -2.39
USP34-222	ENST00000498268	FABP2	P12104	132 aa		0.13	□□□□□ -2.39
USP34-222	ENST00000498268	FABP4	P15090	132 aa		0.13	□□□□□ -2.39
USP34-222	ENST00000498268	GLRX	P35754	106 aa		0.13	□□□□□ -2.39
USP34-222	ENST00000498268	CAV3	P56539	151 aa		0.13	□□□□□ -2.39
USP34-222	ENST00000498268	TAS2R41	P59536	307 aa		0.13	□□□□□ -2.39
USP34-222	ENST00000498268	POU6F1	Q14863	301 aa		0.13	□□□□□ -2.39
USP34-222	ENST00000498268	LTC4S	Q16873	150 aa		0.13	□□□□□ -2.39
USP34-222	ENST00000498268	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		0.13	□□□□□ -2.39
USP34-222	ENST00000498268	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		0.13	□□□□□ -2.39
USP34-222	ENST00000498268	DYDC1	Q8WWB3	177 aa		0.13	□□□□□ -2.39
USP34-222	ENST00000498268	AP3S1	Q92572	193 aa		0.13	□□□□□ -2.39
USP34-222	ENST00000498268	BORCS8	Q96FH0	119 aa		0.13	□□□□□ -2.39
USP34-222	ENST00000498268	AP1S3	Q96PC3	154 aa		0.13	□□□□□ -2.39
USP34-222	ENST00000498268	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		0.13	□□□□□ -2.39
USP34-222	ENST00000498268	BDP1	A6H8Y1	2624 aa		0.13	□□□□□ -2.39
USP34-222	ENST00000498268	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		0.13	□□□□□ -2.39
USP34-222	ENST00000498268	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		0.13	□□□□□ -2.39
USP34-222	ENST00000498268	SYNE2	Q8WXH0	6885 aa	Known RBP	0.12	□□□□□ -2.39
USP34-222	ENST00000498268	RTL9	Q8NET4	1388 aa		0.12	□□□□□ -2.39
USP34-222	ENST00000498268	PRORSD1P	A6NEY8	169 aa		0.12	□□□□□ -2.39
USP34-222	ENST00000498268	KPNA4	O00629	521 aa	Predicted RBP	0.12	□□□□□ -2.39

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