RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 ZFP30Q9Y2G7 519 aa13.71□□□□□ -0.21
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ACTB-201ENST00000331789 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
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ACTB-201ENST00000331789 RNF182Q8N6D2 247 aa13.7□□□□□ -0.22
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ACTB-201ENST00000331789 HIST3H2BBQ8N257 126 aa13.68□□□□□ -0.22
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ACTB-201ENST00000331789 FAM209BQ5JX69 171 aa13.67□□□□□ -0.22
ACTB-201ENST00000331789 TMEM136Q6ZRR5 245 aa13.67□□□□□ -0.22
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ACTB-201ENST00000331789 GNB1LQ9BYB4 327 aa13.67□□□□□ -0.22
ACTB-201ENST00000331789 HIGD1CA8MV81 97 aa13.66□□□□□ -0.22
ACTB-201ENST00000331789 NPIPB6E9PJ23 425 aa13.66□□□□□ -0.22
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ACTB-201ENST00000331789 C8orf86Q6ZUL3 223 aa13.66□□□□□ -0.22
ACTB-201ENST00000331789 A8MWL6 223 aa13.66□□□□□ -0.22
ACTB-201ENST00000331789 RAB4BP61018 213 aa13.66□□□□□ -0.22
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP1-1Q07627 177 aa13.66□□□□□ -0.22
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ACTB-201ENST00000331789 CT83Q5H943 113 aa13.66□□□□□ -0.22
ACTB-201ENST00000331789 Q8TAT8 98 aa13.66□□□□□ -0.22
ACTB-201ENST00000331789 GTSF1Q8WW33 167 aa13.66□□□□□ -0.22
ACTB-201ENST00000331789 TLN2Q9Y4G6 2542 aa13.66□□□□□ -0.22
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ACTB-201ENST00000331789 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
ACTB-201ENST00000331789 GDF5OSQ5U4N7 250 aa13.64□□□□□ -0.23
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ACTB-201ENST00000331789 PGLYRP4Q96LB8 373 aa13.64□□□□□ -0.23
ACTB-201ENST00000331789 SELENOKQ9Y6D0 94 aa13.64□□□□□ -0.23
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ACTB-201ENST00000331789 C12orf57Q99622 126 aa13.62□□□□□ -0.23
ACTB-201ENST00000331789 GFRA4Q9GZZ7 299 aa13.62□□□□□ -0.23
ACTB-201ENST00000331789 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
ACTB-201ENST00000331789 CD5LO43866 347 aa13.61□□□□□ -0.23
ACTB-201ENST00000331789 FABP4P15090 132 aa13.61□□□□□ -0.23
ACTB-201ENST00000331789 MYOZ3Q8TDC0 251 aa13.61□□□□□ -0.23
ACTB-201ENST00000331789 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
ACTB-201ENST00000331789 SONP18583 2426 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
ACTB-201ENST00000331789 RBAKDNA6NC62 111 aa13.6□□□□□ -0.23
ACTB-201ENST00000331789 SH2D1AO60880 128 aa13.6□□□□□ -0.23
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