RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 UBE2CO00762 179 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF90Q03938 601 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 PSG3Q16557 428 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 GPHB5Q86YW7 130 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF439Q8NDP4 499 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 MUC7Q8TAX7 377 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM190Q8WZ59 177 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 SCRT1Q9BWW7 348 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 MS4A6AQ9H2W1 248 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 C15orf62A8K5M9 175 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 EVI2AP22794 236 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 HAGHQ16775 308 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 KHDC3LQ587J8 217 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 LY6G6FQ5SQ64 297 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 LINC00469Q8N7U9 141 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 CITED1Q99966 193 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 CHEK1O14757 476 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 ATP5G1P05496 136 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 ATP5G3P48201 142 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 NHLH2Q02577 135 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP1-1Q07627 177 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 ASB13Q8WXK3 278 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 FRZBQ92765 325 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 HSPB7Q9UBY9 170 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 A0A087X0M5 115 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 A0A1B0GX30 115 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 ISLRO14498 428 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 PAX4O43316 350 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 IGLV2-14P01704 120 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 RAB5AP20339 215 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 CTAG1AP78358 180 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 BLOC1S1P78537 153 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 BAGE2Q86Y30 109 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 TMED6Q8WW62 240 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 SDF2L1Q9HCN8 221 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 F6UB75 175 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 PROP1O75360 226 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 SRIP30626 198 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 RUNX1Q01196 453 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 C2orf83Q53S99 150 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 PQLC2Q6ZP29 291 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 LRTM2Q8N967 370 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 OR11H4Q8NGC9 324 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 A0A0J9YWU9 116 aa3.4□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 MBPP02686 304 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 S100PP25815 95 aa3.4□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa3.4□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 C5orf30Q96GV9 206 aa3.4□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 LINC00574Q9H8X3 128 aa3.4□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 BIN3Q9NQY0 253 aa3.4□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa3.4□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 KLK9Q9UKQ9 250 aa3.4□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa3.4□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 LRBAP50851 2863 aa3.4□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 TRGV11A0A075B6L2 103 aa3.4□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 A0A0G2JRQ6 117 aa3.4□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 PCP4L1A6NKN8 68 aa3.4□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 NPIPB6E9PJ23 425 aa3.4□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 GCGP01275 180 aa3.4□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 IGKV1-5P01602 117 aa3.4□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 FCER1GP30273 86 aa3.4□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 SMIM8Q96KF7 97 aa3.4□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 KCNS1Q96KK3 526 aa3.4□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 OR5AC2Q9NZP5 309 aa3.4□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 TANC2Q9HCD6 1990 aa3.4□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 A0A0D9SG52 128 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-201ENST00000348564 NDUFA3O95167 84 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-201ENST00000348564 IGKV1-39P01597 117 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-201ENST00000348564 IGKV1D-39P04432 117 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-201ENST00000348564 PSMB8P28062 276 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-201ENST00000348564 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM88Q6PEY1 159 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-201ENST00000348564 TMUB2Q71RG4 321 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-201ENST00000348564 ODF3L1Q8IXM7 274 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-201ENST00000348564 C11orf42Q8N5U0 333 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-201ENST00000348564 RNF182Q8N6D2 247 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-201ENST00000348564 OR2D3Q8NGH3 330 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-201ENST00000348564 C2CD4CQ8TF44 421 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-201ENST00000348564 SMCO4Q9NRQ5 59 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-201ENST00000348564 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-201ENST00000348564 GRIFINA4D1Z8 144 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-201ENST00000348564 NUPR2A6NF83 97 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-201ENST00000348564 M6PRP20645 277 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-201ENST00000348564 ASIPP42127 132 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-201ENST00000348564 PAX2Q02962 417 aa3.4□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.4 ms