RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515295.5

POLK-217, Transcript of DNA polymerase kappa, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene POLK, Length 1,438 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLK-217ENST00000515295 CCL13Q99616 98 aa2.59□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 PMCHL2Q9BQD1 86 aa2.59□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP2.59□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 SLC39A9Q9NUM3 307 aa2.59□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 TMEM242Q9NWH2 141 aa2.59□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 XCL2Q9UBD3 114 aa2.59□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 DOCK4Q8N1I0 1966 aa2.58□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 MYOM1P52179 1685 aa2.58□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 PREX1Q8TCU6 1659 aa2.58□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa2.58□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 HCFC1P51610 2035 aa2.58□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 MIA3Q5JRA6 1907 aa2.58□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa2.58□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa2.58□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa2.58□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa2.58□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 A0A0J9YWU9 116 aa2.58□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa2.58□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 ZFP92A6NM28 416 aa2.58□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 A8MUN3 132 aa2.58□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 H3BT86 120 aa2.58□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 M0R129 80 aa2.58□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 PLA2G10O15496 165 aa2.58□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 SSSCA1O60232 199 aa2.58□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 IGHV4-59P01825 116 aa2.58□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 GYPBP06028 91 aa2.58□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 TPT1P13693 172 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 COX7CP15954 63 aa2.58□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 FCGR2CP31995 323 aa2.58□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 BTCP35070 178 aa2.58□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 TAS2R19P59542 299 aa2.58□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 NPC2P61916 151 aa2.58□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 RFLNAQ6ZTI6 216 aa2.58□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 LCA10Q71F78 164 aa2.58□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 TEN1Q86WV5 123 aa2.58□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 C6orf223Q8N319 242 aa2.58□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 APCDD1LQ8NCL9 501 aa2.58□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 ZNRF1Q8ND25 227 aa2.58□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa2.58□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 WFDC11Q8NEX6 87 aa2.58□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 ZNF721Q8TF20 911 aa2.58□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 PPDPFLQ8WWR9 84 aa2.58□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 TMEM158Q8WZ71 300 aa2.58□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 AIG1Q9NVV5 245 aa2.58□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 MICAL3Q7RTP6 2002 aa2.57□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 IQGAP1P46940 1657 aa2.57□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 PLCH1Q4KWH8 1693 aa2.57□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 TRPM2O94759 1503 aa2.57□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP2.57□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 ERCC6L2Q5T890 1561 aa2.57□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa2.57□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 USP32Q8NFA0 1604 aa2.57□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 A0A087WW49 117 aa2.57□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa2.57□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa2.57□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 A0A0G2JRQ6 117 aa2.57□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa2.57□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 C4orf51C9J302 202 aa2.57□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 M0R378 163 aa2.57□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 COX7A2LO14548 114 aa2.57□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 SYNGR2O43760 224 aa2.57□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 FSTL3O95633 263 aa2.57□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 IGHV3-9P01782 118 aa2.57□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 HLA-DMBP28068 263 aa2.57□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP2.57□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 GNB2P62879 340 aa2.57□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 RPS21P63220 83 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 C6orf99Q4VX62 202 aa2.57□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 TMEM91Q6ZNR0 172 aa2.57□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 H2AFVQ71UI9 128 aa2.57□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 MYOZ3Q8TDC0 251 aa2.57□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 DCANP1Q8TF63 244 aa2.57□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 VGLL1Q99990 258 aa2.57□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 C20orf78Q9BR46 151 aa2.57□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 RNF126Q9BV68 326 aa2.57□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 SLC35B3Q9H1N7 401 aa2.57□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 SLC25A22Q9H936 323 aa2.57□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 MOB4Q9Y3A3 225 aa2.57□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 MAST1Q9Y2H9 1570 aa2.56□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 ALKQ9UM73 1620 aa2.56□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 TSPOAP1O95153 1857 aa2.56□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 GCC2Q8IWJ2 1684 aa2.56□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa2.56□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa2.56□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa2.56□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 GRIFINA4D1Z8 144 aa2.56□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 RBAKDNA6NC62 111 aa2.56□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 C17orf112F2Z3M2 114 aa2.56□□□□□ -2
POLK-217ENST00000515295 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa2.56□□□□□ -2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms