RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053716.7

Clrn3-201, Transcript of Clarin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clrn3, Length 3,305 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Spata22Q5SV06 358 aa5.56□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Spock1Q62288 442 aa5.56□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 MaoaQ64133 526 aa5.56□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dcaf12Q8BGZ3 453 aa5.56□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfp799Q8BHK4 648 aa5.56□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Q8BTG6 205 aa5.56□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 5930422O12RikQ8C4Y4 123 aa5.56□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr1370Q8VFG4 316 aa5.56□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr338Q8VGK6 306 aa5.56□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Scgb1b27Q91WB5 92 aa5.56□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rnf115Q9D0C1 305 aa5.56□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dusp3Q9D7X3 185 aa5.56□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Q9DAN9 164 aa5.56□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 NgbQ9ER97 151 aa5.56□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pus1Q9WU56 423 aa5.56□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Opn3Q9WUK7 400 aa5.56□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 St6galnac3Q9WUV2 305 aa5.56□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Igkv14-111A0A140T8P9 117 aa5.55□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr896-ps1A0A1L1SRZ8 308 aa5.55□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fabp4P04117 132 aa5.55□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Bcl2P10417 236 aa5.55□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hspb7P35385 169 aa5.55□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ube2g2P60605 165 aa5.55□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tpt1P63028 172 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mpc1P63030 109 aa5.55□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 C1qtnf9Q4ZJN1 333 aa5.55□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Npy6rQ61212 371 aa5.55□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 SnrpcQ62241 159 aa5.55□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tspan7Q62283 249 aa5.55□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Arl11Q6P3A9 176 aa5.55□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tbpl2Q6SJ95 350 aa5.55□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfp273Q7M6W8 501 aa5.55□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Aph1aQ8BVF7 265 aa5.55□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 D330020A13RikQ8C799 211 aa5.55□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn1r179Q8R2B4 323 aa5.55□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr355Q8VFP6 310 aa5.55□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr116Q923Q6 321 aa5.55□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cox20Q9D7J4 117 aa5.55□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Atg101Q9D8Z6 218 aa5.55□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn1r44Q9EQ47 310 aa5.55□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trav4-2A0A075B638 110 aa5.55□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr1097A2AVA9 315 aa5.55□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm9972E9Q053 102 aa5.55□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm20532G3UXR8 106 aa5.55□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr906K7N5P3 311 aa5.55□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nkx2-8O70584 235 aa5.55□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ucp1P12242 307 aa5.55□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cd81P35762 236 aa5.55□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dpagt1P42867 410 aa5.55□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hist1h1eP43274 219 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ccr8P56484 353 aa5.55□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trdv4Q5R1A3 115 aa5.55□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sf3a2Q62203 475 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Foxl1Q64731 336 aa5.55□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Abhd17bQ7M759 288 aa5.55□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Paqr8Q80ZE5 354 aa5.55□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Megf9Q8BH27 600 aa5.55□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fam78bQ8BQN5 261 aa5.55□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 RetnlgQ8K426 117 aa5.55□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr493Q8VEW5 314 aa5.55□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 TirapQ99JY1 241 aa5.55□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cds2Q99L43 444 aa5.55□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Epdr1Q99M71 224 aa5.55□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tmem147Q9CQG6 224 aa5.55□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mad2l1bpQ9DCX1 276 aa5.55□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vsig2Q9Z109 328 aa5.55□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trav18A0A075B656 109 aa5.54□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfp971A2BFG8 470 aa5.54□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr872E9PVW2 323 aa5.54□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr920E9Q413 310 aa5.54□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm14288E9Q9W0 88 aa5.54□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 CckarO08786 436 aa5.54□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 MdkP12025 140 aa5.54□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 StomP54116 284 aa5.54□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ccl7Q03366 97 aa5.54□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Reg2Q08731 173 aa5.54□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfp970Q08BU3 522 aa5.54□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr93Q6UAH1 312 aa5.54□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mob1bQ8BPB0 216 aa5.54□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Psg16Q8K0U8 395 aa5.54□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr1350Q8VF34 308 aa5.54□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr1009Q8VFK1 314 aa5.54□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr1339Q8VGB1 315 aa5.54□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr354Q8VGJ8 317 aa5.54□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pth2Q91W27 100 aa5.54□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ythdf2Q91YT7 579 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Anapc16Q9CPV2 110 aa5.54□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mlf1Q9QWV4 267 aa5.54□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ighv1-18A0A0A6YXN4 117 aa5.54□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm14412A2ARR7 526 aa5.54□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Arl16B1ATY8 173 aa5.54□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 H60bB1B212 251 aa5.54□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cpsf4lE9Q2N0 280 aa5.54□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr191L7N1Z8 309 aa5.54□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Timp1P12032 205 aa5.54□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 RelP15307 587 aa5.54□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fcer1gP20491 86 aa5.54□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pax5Q02650 391 aa5.54□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm813Q3UWK9 176 aa5.54□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Prss33Q80WM7 277 aa5.54□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 100.1 ms