Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY1

Tirap, Toll/interleukin-1 receptor domain-containing adapter protein, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TirapQ99JY1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TirapQ99JY1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TirapQ99JY1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TirapQ99JY1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TirapQ99JY1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TirapQ99JY1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TirapQ99JY1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TirapQ99JY1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TirapQ99JY1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TirapQ99JY1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TirapQ99JY1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TirapQ99JY1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TirapQ99JY1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TirapQ99JY1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TirapQ99JY1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TirapQ99JY1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TirapQ99JY1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TirapQ99JY1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TirapQ99JY1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TirapQ99JY1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TirapQ99JY1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TirapQ99JY1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TirapQ99JY1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TirapQ99JY1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TirapQ99JY1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TirapQ99JY1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TirapQ99JY1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TirapQ99JY1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TirapQ99JY1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TirapQ99JY1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TirapQ99JY1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TirapQ99JY1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TirapQ99JY1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TirapQ99JY1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TirapQ99JY1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TirapQ99JY1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TirapQ99JY1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TirapQ99JY1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TirapQ99JY1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TirapQ99JY1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TirapQ99JY1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TirapQ99JY1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TirapQ99JY1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TirapQ99JY1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TirapQ99JY1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TirapQ99JY1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TirapQ99JY1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TirapQ99JY1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TirapQ99JY1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TirapQ99JY1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TirapQ99JY1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TirapQ99JY1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TirapQ99JY1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TirapQ99JY1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TirapQ99JY1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TirapQ99JY1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TirapQ99JY1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TirapQ99JY1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TirapQ99JY1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TirapQ99JY1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TirapQ99JY1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TirapQ99JY1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TirapQ99JY1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TirapQ99JY1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TirapQ99JY1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TirapQ99JY1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TirapQ99JY1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TirapQ99JY1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TirapQ99JY1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TirapQ99JY1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TirapQ99JY1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TirapQ99JY1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TirapQ99JY1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TirapQ99JY1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TirapQ99JY1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TirapQ99JY1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TirapQ99JY1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TirapQ99JY1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TirapQ99JY1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TirapQ99JY1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TirapQ99JY1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TirapQ99JY1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TirapQ99JY1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TirapQ99JY1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TirapQ99JY1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TirapQ99JY1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TirapQ99JY1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TirapQ99JY1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TirapQ99JY1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TirapQ99JY1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TirapQ99JY1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TirapQ99JY1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TirapQ99JY1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TirapQ99JY1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TirapQ99JY1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TirapQ99JY1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TirapQ99JY1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TirapQ99JY1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TirapQ99JY1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TirapQ99JY1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms