Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ47

Vmn1r44, Vomeronasal type-1 receptor 44, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r44Q9EQ47 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
Vmn1r44Q9EQ47 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Vmn1r44Q9EQ47 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Vmn1r44Q9EQ47 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Vmn1r44Q9EQ47 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Vmn1r44Q9EQ47 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Vmn1r44Q9EQ47 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Vmn1r44Q9EQ47 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Vmn1r44Q9EQ47 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Vmn1r44Q9EQ47 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Vmn1r44Q9EQ47 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Vmn1r44Q9EQ47 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Vmn1r44Q9EQ47 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Vmn1r44Q9EQ47 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Vmn1r44Q9EQ47 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Vmn1r44Q9EQ47 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Vmn1r44Q9EQ47 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Vmn1r44Q9EQ47 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Vmn1r44Q9EQ47 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Vmn1r44Q9EQ47 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vmn1r44Q9EQ47 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vmn1r44Q9EQ47 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vmn1r44Q9EQ47 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vmn1r44Q9EQ47 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vmn1r44Q9EQ47 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vmn1r44Q9EQ47 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Vmn1r44Q9EQ47 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Vmn1r44Q9EQ47 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vmn1r44Q9EQ47 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Vmn1r44Q9EQ47 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Vmn1r44Q9EQ47 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Vmn1r44Q9EQ47 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vmn1r44Q9EQ47 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vmn1r44Q9EQ47 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vmn1r44Q9EQ47 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vmn1r44Q9EQ47 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vmn1r44Q9EQ47 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vmn1r44Q9EQ47 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vmn1r44Q9EQ47 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vmn1r44Q9EQ47 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vmn1r44Q9EQ47 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vmn1r44Q9EQ47 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vmn1r44Q9EQ47 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vmn1r44Q9EQ47 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vmn1r44Q9EQ47 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vmn1r44Q9EQ47 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vmn1r44Q9EQ47 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Vmn1r44Q9EQ47 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vmn1r44Q9EQ47 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Vmn1r44Q9EQ47 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Vmn1r44Q9EQ47 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vmn1r44Q9EQ47 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vmn1r44Q9EQ47 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vmn1r44Q9EQ47 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vmn1r44Q9EQ47 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vmn1r44Q9EQ47 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vmn1r44Q9EQ47 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Vmn1r44Q9EQ47 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vmn1r44Q9EQ47 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vmn1r44Q9EQ47 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vmn1r44Q9EQ47 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vmn1r44Q9EQ47 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vmn1r44Q9EQ47 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vmn1r44Q9EQ47 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vmn1r44Q9EQ47 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vmn1r44Q9EQ47 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vmn1r44Q9EQ47 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vmn1r44Q9EQ47 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Vmn1r44Q9EQ47 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vmn1r44Q9EQ47 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vmn1r44Q9EQ47 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vmn1r44Q9EQ47 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vmn1r44Q9EQ47 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vmn1r44Q9EQ47 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Vmn1r44Q9EQ47 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vmn1r44Q9EQ47 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vmn1r44Q9EQ47 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vmn1r44Q9EQ47 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vmn1r44Q9EQ47 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vmn1r44Q9EQ47 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vmn1r44Q9EQ47 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Vmn1r44Q9EQ47 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vmn1r44Q9EQ47 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vmn1r44Q9EQ47 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vmn1r44Q9EQ47 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vmn1r44Q9EQ47 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vmn1r44Q9EQ47 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vmn1r44Q9EQ47 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vmn1r44Q9EQ47 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vmn1r44Q9EQ47 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vmn1r44Q9EQ47 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vmn1r44Q9EQ47 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vmn1r44Q9EQ47 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vmn1r44Q9EQ47 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vmn1r44Q9EQ47 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vmn1r44Q9EQ47 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Vmn1r44Q9EQ47 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
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