Protein–RNA interactions for Protein: Q62283

Tspan7, Tetraspanin-7, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan7Q62283 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
Tspan7Q62283 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Tspan7Q62283 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Tspan7Q62283 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
Tspan7Q62283 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
Tspan7Q62283 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
Tspan7Q62283 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Tspan7Q62283 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Tspan7Q62283 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Tspan7Q62283 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Tspan7Q62283 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
Tspan7Q62283 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Tspan7Q62283 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Tspan7Q62283 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Tspan7Q62283 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Tspan7Q62283 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Tspan7Q62283 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Tspan7Q62283 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Tspan7Q62283 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Tspan7Q62283 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tspan7Q62283 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Tspan7Q62283 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Tspan7Q62283 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Tspan7Q62283 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tspan7Q62283 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tspan7Q62283 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tspan7Q62283 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tspan7Q62283 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tspan7Q62283 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tspan7Q62283 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Tspan7Q62283 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Tspan7Q62283 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tspan7Q62283 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Tspan7Q62283 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tspan7Q62283 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tspan7Q62283 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tspan7Q62283 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tspan7Q62283 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tspan7Q62283 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tspan7Q62283 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tspan7Q62283 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Tspan7Q62283 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tspan7Q62283 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tspan7Q62283 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tspan7Q62283 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Tspan7Q62283 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tspan7Q62283 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Tspan7Q62283 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tspan7Q62283 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tspan7Q62283 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tspan7Q62283 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tspan7Q62283 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tspan7Q62283 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Tspan7Q62283 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tspan7Q62283 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Tspan7Q62283 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Tspan7Q62283 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Tspan7Q62283 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Tspan7Q62283 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tspan7Q62283 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tspan7Q62283 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tspan7Q62283 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tspan7Q62283 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tspan7Q62283 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tspan7Q62283 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tspan7Q62283 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Tspan7Q62283 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tspan7Q62283 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tspan7Q62283 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tspan7Q62283 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tspan7Q62283 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tspan7Q62283 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tspan7Q62283 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tspan7Q62283 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tspan7Q62283 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tspan7Q62283 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tspan7Q62283 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tspan7Q62283 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Tspan7Q62283 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Tspan7Q62283 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tspan7Q62283 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tspan7Q62283 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tspan7Q62283 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tspan7Q62283 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tspan7Q62283 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tspan7Q62283 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tspan7Q62283 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tspan7Q62283 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tspan7Q62283 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tspan7Q62283 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tspan7Q62283 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tspan7Q62283 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tspan7Q62283 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Tspan7Q62283 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tspan7Q62283 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tspan7Q62283 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tspan7Q62283 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tspan7Q62283 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tspan7Q62283 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Tspan7Q62283 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms