Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Opn3Q9WUK7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Opn3Q9WUK7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Opn3Q9WUK7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Opn3Q9WUK7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Opn3Q9WUK7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Opn3Q9WUK7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Opn3Q9WUK7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Opn3Q9WUK7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Opn3Q9WUK7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Opn3Q9WUK7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Opn3Q9WUK7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Opn3Q9WUK7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Opn3Q9WUK7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Opn3Q9WUK7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Opn3Q9WUK7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Opn3Q9WUK7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Opn3Q9WUK7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Opn3Q9WUK7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Opn3Q9WUK7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Opn3Q9WUK7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Opn3Q9WUK7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Opn3Q9WUK7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Opn3Q9WUK7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Opn3Q9WUK7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Opn3Q9WUK7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Opn3Q9WUK7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Opn3Q9WUK7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Opn3Q9WUK7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Opn3Q9WUK7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Opn3Q9WUK7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Opn3Q9WUK7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Opn3Q9WUK7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Opn3Q9WUK7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Opn3Q9WUK7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Opn3Q9WUK7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Opn3Q9WUK7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Opn3Q9WUK7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Opn3Q9WUK7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Opn3Q9WUK7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Opn3Q9WUK7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Opn3Q9WUK7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Opn3Q9WUK7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Opn3Q9WUK7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Opn3Q9WUK7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Opn3Q9WUK7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Opn3Q9WUK7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Opn3Q9WUK7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Opn3Q9WUK7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Opn3Q9WUK7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Opn3Q9WUK7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Opn3Q9WUK7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Opn3Q9WUK7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Opn3Q9WUK7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Opn3Q9WUK7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Opn3Q9WUK7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Opn3Q9WUK7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Opn3Q9WUK7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Opn3Q9WUK7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Opn3Q9WUK7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Opn3Q9WUK7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Opn3Q9WUK7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Opn3Q9WUK7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Opn3Q9WUK7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Opn3Q9WUK7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Opn3Q9WUK7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Opn3Q9WUK7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Opn3Q9WUK7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Opn3Q9WUK7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Opn3Q9WUK7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Opn3Q9WUK7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Opn3Q9WUK7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Opn3Q9WUK7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Opn3Q9WUK7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Opn3Q9WUK7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Opn3Q9WUK7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Opn3Q9WUK7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Opn3Q9WUK7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Opn3Q9WUK7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Opn3Q9WUK7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Opn3Q9WUK7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Opn3Q9WUK7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Opn3Q9WUK7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Opn3Q9WUK7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Opn3Q9WUK7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Opn3Q9WUK7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Opn3Q9WUK7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Opn3Q9WUK7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Opn3Q9WUK7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Opn3Q9WUK7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Opn3Q9WUK7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Opn3Q9WUK7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Opn3Q9WUK7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Opn3Q9WUK7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Opn3Q9WUK7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Opn3Q9WUK7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Opn3Q9WUK7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Opn3Q9WUK7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Opn3Q9WUK7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Opn3Q9WUK7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms