Protein–RNA interactions for Protein: Q62288

Spock1, Testican-1, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spock1Q62288 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
Spock1Q62288 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Spock1Q62288 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Spock1Q62288 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Spock1Q62288 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Spock1Q62288 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Spock1Q62288 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Spock1Q62288 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Spock1Q62288 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Spock1Q62288 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Spock1Q62288 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Spock1Q62288 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Spock1Q62288 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Spock1Q62288 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Spock1Q62288 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Spock1Q62288 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Spock1Q62288 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Spock1Q62288 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Spock1Q62288 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Spock1Q62288 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Spock1Q62288 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Spock1Q62288 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Spock1Q62288 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Spock1Q62288 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Spock1Q62288 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Spock1Q62288 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Spock1Q62288 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Spock1Q62288 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Spock1Q62288 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Spock1Q62288 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Spock1Q62288 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Spock1Q62288 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Spock1Q62288 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Spock1Q62288 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Spock1Q62288 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Spock1Q62288 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Spock1Q62288 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Spock1Q62288 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Spock1Q62288 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Spock1Q62288 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Spock1Q62288 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Spock1Q62288 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Spock1Q62288 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Spock1Q62288 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Spock1Q62288 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Spock1Q62288 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Spock1Q62288 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Spock1Q62288 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Spock1Q62288 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Spock1Q62288 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Spock1Q62288 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Spock1Q62288 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Spock1Q62288 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Spock1Q62288 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Spock1Q62288 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Spock1Q62288 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Spock1Q62288 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Spock1Q62288 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Spock1Q62288 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Spock1Q62288 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Spock1Q62288 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Spock1Q62288 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Spock1Q62288 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Spock1Q62288 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Spock1Q62288 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Spock1Q62288 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Spock1Q62288 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Spock1Q62288 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Spock1Q62288 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Spock1Q62288 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Spock1Q62288 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Spock1Q62288 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Spock1Q62288 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Spock1Q62288 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Spock1Q62288 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Spock1Q62288 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Spock1Q62288 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Spock1Q62288 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Spock1Q62288 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Spock1Q62288 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Spock1Q62288 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Spock1Q62288 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Spock1Q62288 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Spock1Q62288 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Spock1Q62288 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Spock1Q62288 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Spock1Q62288 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Spock1Q62288 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Spock1Q62288 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spock1Q62288 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Spock1Q62288 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Spock1Q62288 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Spock1Q62288 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Spock1Q62288 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Spock1Q62288 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Spock1Q62288 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Spock1Q62288 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Spock1Q62288 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Spock1Q62288 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Spock1Q62288 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms