Protein–RNA interactions for Protein: Q08731

Reg2, Lithostathine-2, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reg2Q08731 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
Reg2Q08731 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Reg2Q08731 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Reg2Q08731 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Reg2Q08731 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Reg2Q08731 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Reg2Q08731 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Reg2Q08731 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Reg2Q08731 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Reg2Q08731 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Reg2Q08731 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Reg2Q08731 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Reg2Q08731 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Reg2Q08731 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Reg2Q08731 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Reg2Q08731 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Reg2Q08731 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Reg2Q08731 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Reg2Q08731 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Reg2Q08731 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Reg2Q08731 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Reg2Q08731 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Reg2Q08731 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Reg2Q08731 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Reg2Q08731 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Reg2Q08731 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Reg2Q08731 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Reg2Q08731 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Reg2Q08731 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Reg2Q08731 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Reg2Q08731 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Reg2Q08731 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Reg2Q08731 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Reg2Q08731 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Reg2Q08731 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Reg2Q08731 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Reg2Q08731 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Reg2Q08731 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Reg2Q08731 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Reg2Q08731 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Reg2Q08731 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Reg2Q08731 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Reg2Q08731 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Reg2Q08731 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Reg2Q08731 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Reg2Q08731 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Reg2Q08731 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Reg2Q08731 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Reg2Q08731 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Reg2Q08731 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Reg2Q08731 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Reg2Q08731 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Reg2Q08731 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Reg2Q08731 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Reg2Q08731 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Reg2Q08731 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Reg2Q08731 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Reg2Q08731 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Reg2Q08731 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Reg2Q08731 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Reg2Q08731 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Reg2Q08731 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Reg2Q08731 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Reg2Q08731 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Reg2Q08731 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Reg2Q08731 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Reg2Q08731 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Reg2Q08731 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Reg2Q08731 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Reg2Q08731 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Reg2Q08731 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Reg2Q08731 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Reg2Q08731 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Reg2Q08731 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Reg2Q08731 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Reg2Q08731 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Reg2Q08731 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Reg2Q08731 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Reg2Q08731 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Reg2Q08731 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Reg2Q08731 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Reg2Q08731 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Reg2Q08731 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Reg2Q08731 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Reg2Q08731 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Reg2Q08731 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Reg2Q08731 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Reg2Q08731 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Reg2Q08731 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Reg2Q08731 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Reg2Q08731 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Reg2Q08731 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Reg2Q08731 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Reg2Q08731 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Reg2Q08731 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Reg2Q08731 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Reg2Q08731 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Reg2Q08731 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Reg2Q08731 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Reg2Q08731 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 251.3 ms