Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YXN4

Ighv1-18, Immunoglobulin heavy variable V1-18 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ighv1-18A0A0A6YXN4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ighv1-18A0A0A6YXN4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ighv1-18A0A0A6YXN4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ighv1-18A0A0A6YXN4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
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