RNA–Protein interactions for RNA: YPL110C

GDE1, Transcript of Glycerophosphocholine (GroPCho) phosphodiesterase, yeast

Gene GDE1, Length 3,672 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GDE1	YPL110C	YPD1	Q07688	167 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GDE1	YPL110C	NCR1	Q12200	1170 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GDE1	YPL110C	ATP6	P00854	259 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GDE1	YPL110C	CTT1	P06115	562 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GDE1	YPL110C	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GDE1	YPL110C	SRB4	P32569	687 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GDE1	YPL110C	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GDE1	YPL110C	CCC2	P38995	1004 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GDE1	YPL110C	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GDE1	YPL110C	IVY1	Q04934	453 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GDE1	YPL110C	YPR084W	Q06821	456 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GDE1	YPL110C	YEH2	Q07950	538 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GDE1	YPL110C	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GDE1	YPL110C	AEP3	Q12089	606 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GDE1	YPL110C	GET4	Q12125	312 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GDE1	YPL110C	NYV1	Q12255	253 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GDE1	YPL110C	BI4	P03879	638 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GDE1	YPL110C	PHO8	P11491	566 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GDE1	YPL110C	HAP4	P14064	554 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GDE1	YPL110C	SEC62	P21825	274 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GDE1	YPL110C	YJU3	P28321	313 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GDE1	YPL110C	ZIP1	P31111	875 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GDE1	YPL110C	BMT2	P38278	337 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GDE1	YPL110C	COS111	P38308	924 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GDE1	YPL110C	STS1	P38637	319 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GDE1	YPL110C	YIL077C	P40508	320 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GDE1	YPL110C	HUL4	P40985	892 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GDE1	YPL110C	THI12	P42883	340 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GDE1	YPL110C	THI5	P43534	340 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GDE1	YPL110C	ROG3	P43602	733 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GDE1	YPL110C	STR2	P47164	639 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GDE1	YPL110C	THI11	P47183	340 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GDE1	YPL110C	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GDE1	YPL110C	NUT1	P53114	1132 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GDE1	YPL110C	MRM2	P53123	320 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GDE1	YPL110C	TOS4	Q06266	489 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GDE1	YPL110C	ARO10	Q06408	635 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GDE1	YPL110C	THI13	Q07748	340 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GDE1	YPL110C	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GDE1	YPL110C	TIP41	Q12199	356 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GDE1	YPL110C	CHS1	P08004	1131 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GDE1	YPL110C	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
GDE1	YPL110C	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
GDE1	YPL110C	KIP1	P28742	1111 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GDE1	YPL110C	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
GDE1	YPL110C	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
GDE1	YPL110C	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
GDE1	YPL110C	UBX7	P38349	436 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GDE1	YPL110C	AST2	P39945	430 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
GDE1	YPL110C	IRC24	P40580	263 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GDE1	YPL110C	CIN5	P40917	295 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GDE1	YPL110C	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
GDE1	YPL110C	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
GDE1	YPL110C	ATG20	Q07528	640 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GDE1	YPL110C	SDH5	Q08230	162 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GDE1	YPL110C	YBL029C-A	Q3E756	94 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GDE1	YPL110C	BCK1	Q01389	1478 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GDE1	YPL110C	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
GDE1	YPL110C	RGP1	P16664	663 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GDE1	YPL110C	AEP2	P22136	580 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GDE1	YPL110C	SCJ1	P25303	377 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GDE1	YPL110C	DMC1	P25453	334 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GDE1	YPL110C	CPR3	P25719	182 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GDE1	YPL110C	MYO3	P36006	1272 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GDE1	YPL110C	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
GDE1	YPL110C	PKP1	P40530	394 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GDE1	YPL110C	RTS2	P40962	232 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GDE1	YPL110C	TRS85	P46944	698 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GDE1	YPL110C	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
GDE1	YPL110C	APP1	P53933	587 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GDE1	YPL110C	UBX4	P54730	416 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GDE1	YPL110C	ISU1	Q03020	165 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GDE1	YPL110C	GRS2	Q06817	618 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GDE1	YPL110C	YDL114W	Q07530	308 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GDE1	YPL110C	DDC1	Q08949	612 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GDE1	YPL110C	TAH18	Q12181	623 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GDE1	YPL110C	RPP2B	P02400	110 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
GDE1	YPL110C	YPK2	P18961	677 aa		4.59	□□□□□ -1.68
GDE1	YPL110C	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
GDE1	YPL110C	SUV3	P32580	737 aa		4.59	□□□□□ -1.68
GDE1	YPL110C	SBE22	P38814	852 aa		4.59	□□□□□ -1.68
GDE1	YPL110C	QDR1	P40475	563 aa		4.59	□□□□□ -1.68
GDE1	YPL110C	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.68
GDE1	YPL110C	INA22	P40576	216 aa		4.59	□□□□□ -1.68
GDE1	YPL110C	PIP2	P52960	996 aa		4.59	□□□□□ -1.68
GDE1	YPL110C	NSE5	Q03718	556 aa		4.59	□□□□□ -1.68
GDE1	YPL110C	PHO92	Q06390	306 aa		4.59	□□□□□ -1.68
GDE1	YPL110C	NSE1	Q07913	336 aa		4.59	□□□□□ -1.68
GDE1	YPL110C	TRE1	Q08919	783 aa		4.59	□□□□□ -1.68
GDE1	YPL110C	YPR022C	Q12139	1133 aa		4.59	□□□□□ -1.68
GDE1	YPL110C	MCM16	Q12262	181 aa		4.59	□□□□□ -1.68
GDE1	YPL110C	AVL9	Q12500	764 aa		4.59	□□□□□ -1.68
GDE1	YPL110C	YLR278C	Q05854	1341 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GDE1	YPL110C	ERR1	P0CX10	437 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GDE1	YPL110C	ERR2	P0CX11	437 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GDE1	YPL110C	SDS22	P36047	338 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GDE1	YPL110C	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GDE1	YPL110C	ECM31	P38122	312 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GDE1	YPL110C	GIP1	P38229	639 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GDE1	YPL110C	PEX32	P38292	413 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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