RNA–Protein interactions for RNA: YNL207W

RIO2, Essential serine kinase involved in the processing of 20S pre-rRNA, yeast

Gene RIO2, Length 1,278 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RIO2	YNL207W	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
RIO2	YNL207W	BUD17	P53727	317 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RIO2	YNL207W	YCG1	Q06680	1035 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RIO2	YNL207W	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.38	□□□□□ -1.87	not detected
RIO2	YNL207W	ZPS1	Q12512	249 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RIO2	YNL207W	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RIO2	YNL207W	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RIO2	YNL207W	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RIO2	YNL207W	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RIO2	YNL207W	THI6	P41835	540 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RIO2	YNL207W	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RIO2	YNL207W	MFM1	Q02783	413 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RIO2	YNL207W	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RIO2	YNL207W	USA1	Q03714	838 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RIO2	YNL207W	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RIO2	YNL207W	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RIO2	YNL207W	YPT10	P38146	199 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RIO2	YNL207W	EMP65	P40085	556 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RIO2	YNL207W	PEA2	P40091	420 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RIO2	YNL207W	SPC105	P53148	917 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RIO2	YNL207W	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RIO2	YNL207W	TMA17	Q12513	150 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RIO2	YNL207W	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RIO2	YNL207W	KAR1	P11927	433 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RIO2	YNL207W	NUP1	P20676	1076 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RIO2	YNL207W	APN1	P22936	367 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RIO2	YNL207W	TOM20	P35180	183 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RIO2	YNL207W	PAF1	P38351	445 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RIO2	YNL207W	RIM4	P38741	713 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RIO2	YNL207W	PIH1	P38768	344 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RIO2	YNL207W	YEL025C	P39991	1188 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RIO2	YNL207W	LTP1	P40347	161 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RIO2	YNL207W	IRC5	P43610	853 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RIO2	YNL207W	SAP4	P53036	818 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RIO2	YNL207W	SLD3	P53135	668 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RIO2	YNL207W	COQ6	P53318	479 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RIO2	YNL207W	SKY1	Q03656	742 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RIO2	YNL207W	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.35	□□□□□ -1.87	not detected
RIO2	YNL207W	AIM41	Q12032	185 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RIO2	YNL207W	YPR027C	Q12079	277 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RIO2	YNL207W	FRE7	Q12333	620 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RIO2	YNL207W	AQY1	P0CD91	305 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RIO2	YNL207W	WHI2	P12611	486 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RIO2	YNL207W	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
RIO2	YNL207W	DGR2	P32330	852 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RIO2	YNL207W	EUG1	P32474	517 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RIO2	YNL207W	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
RIO2	YNL207W	YFL015C	P43578	164 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RIO2	YNL207W	NIT2	P47016	307 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RIO2	YNL207W	SCS3	P53012	380 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RIO2	YNL207W	PEF1	P53238	335 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RIO2	YNL207W	YDL073W	Q07454	984 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RIO2	YNL207W	YPL216W	Q08964	1102 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RIO2	YNL207W	VPS33	P20795	691 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RIO2	YNL207W	CCL1	P37366	393 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RIO2	YNL207W	YBR071W	P38243	211 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RIO2	YNL207W	XBP1	P40489	647 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RIO2	YNL207W	PEX14	P53112	341 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RIO2	YNL207W	HOL1	P53389	586 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RIO2	YNL207W	FOL1	P53848	824 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RIO2	YNL207W	PCL8	Q08966	492 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RIO2	YNL207W	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
RIO2	YNL207W	GRX7	P38068	203 aa		3.32	□□□□□ -1.88
RIO2	YNL207W	YJL193W	P39542	402 aa		3.32	□□□□□ -1.88
RIO2	YNL207W	BST1	P43571	1029 aa		3.32	□□□□□ -1.88
RIO2	YNL207W	MNT2	P53059	558 aa		3.32	□□□□□ -1.88
RIO2	YNL207W	YOR378W	Q08902	515 aa		3.32	□□□□□ -1.88
RIO2	YNL207W	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
RIO2	YNL207W	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	3.31	□□□□□ -1.88
RIO2	YNL207W	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		3.31	□□□□□ -1.88
RIO2	YNL207W	YLR464W	P0CX17	216 aa		3.31	□□□□□ -1.88
RIO2	YNL207W	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
RIO2	YNL207W	LOT5	P34234	306 aa		3.31	□□□□□ -1.88
RIO2	YNL207W	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
RIO2	YNL207W	EXO1	P39875	702 aa		3.31	□□□□□ -1.88
RIO2	YNL207W	YEL076C	P39971	216 aa		3.31	□□□□□ -1.88
RIO2	YNL207W	EAF5	P39995	279 aa		3.31	□□□□□ -1.88
RIO2	YNL207W	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
RIO2	YNL207W	YNL092W	P53934	400 aa		3.31	□□□□□ -1.88
RIO2	YNL207W	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
RIO2	YNL207W	PEX15	Q08215	383 aa		3.31	□□□□□ -1.88
RIO2	YNL207W	VPS5	Q92331	675 aa		3.31	□□□□□ -1.88
RIO2	YNL207W	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
RIO2	YNL207W	GSY2	P27472	705 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RIO2	YNL207W	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	3.3	□□□□□ -1.88
RIO2	YNL207W	RPC34	P32910	317 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RIO2	YNL207W	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
RIO2	YNL207W	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	3.3	□□□□□ -1.88
RIO2	YNL207W	TDA10	P42938	290 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RIO2	YNL207W	ATG36	P46983	293 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RIO2	YNL207W	NET1	P47035	1189 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RIO2	YNL207W	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	3.3	□□□□□ -1.88
RIO2	YNL207W	TGS1	Q12052	315 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RIO2	YNL207W	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
RIO2	YNL207W	YMR084W	A2P2R3	262 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RIO2	YNL207W	PCK1	P10963	549 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RIO2	YNL207W	ARG1	P22768	420 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RIO2	YNL207W	PTP1	P25044	335 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RIO2	YNL207W	CWH43	P25618	953 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RIO2	YNL207W	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 73 ms