RNA–Protein interactions for RNA: YMR134W

ERG29, Transcript of Protein of unknown function involved in ergosterol biosynthesis, yeast

Gene ERG29, Length 714 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ERG29	YMR134W	OAF3	P36023	863 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERG29	YMR134W	EHT1	P38295	451 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERG29	YMR134W	EXO1	P39875	702 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERG29	YMR134W	SAP4	P53036	818 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERG29	YMR134W	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ERG29	YMR134W	YCG1	Q06680	1035 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERG29	YMR134W	TGS1	Q12052	315 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERG29	YMR134W	MTC7	P32633	139 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERG29	YMR134W	YHR033W	P38690	423 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERG29	YMR134W	IRC8	P47046	822 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERG29	YMR134W	YHM2	Q04013	314 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERG29	YMR134W	GSY2	P27472	705 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ERG29	YMR134W	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ERG29	YMR134W	EUG1	P32474	517 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ERG29	YMR134W	BRN1	P38170	754 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ERG29	YMR134W	FAT1	P38225	669 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ERG29	YMR134W	VID28	P40547	921 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ERG29	YMR134W	ARR3	Q06598	404 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ERG29	YMR134W	BSP1	Q06604	576 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ERG29	YMR134W	HFI1	Q12060	488 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ERG29	YMR134W	CDC26	P14724	124 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ERG29	YMR134W	PPG1	P32838	368 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ERG29	YMR134W	LRO1	P40345	661 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ERG29	YMR134W	MEP2	P41948	499 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ERG29	YMR134W	YDL183C	P48569	320 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ERG29	YMR134W	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ERG29	YMR134W	ADR1	P07248	1323 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ERG29	YMR134W	HMG2	P12684	1045 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ERG29	YMR134W	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
ERG29	YMR134W	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ERG29	YMR134W	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ERG29	YMR134W	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ERG29	YMR134W	CCL1	P37366	393 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ERG29	YMR134W	YPT10	P38146	199 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ERG29	YMR134W	MNT3	P40549	630 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ERG29	YMR134W	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ERG29	YMR134W	HLJ1	P48353	224 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ERG29	YMR134W	RNH70	P53331	553 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ERG29	YMR134W	USA1	Q03714	838 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ERG29	YMR134W	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ERG29	YMR134W	THI73	Q07904	523 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ERG29	YMR134W	YLR111W	Q12528	110 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ERG29	YMR134W	APM4	Q99186	491 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ERG29	YMR134W	MNN1	P39106	762 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ERG29	YMR134W	OPT1	P40897	799 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ERG29	YMR134W	TDA10	P42938	290 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ERG29	YMR134W	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ERG29	YMR134W	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ERG29	YMR134W	WAR1	Q03631	944 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ERG29	YMR134W	PCL8	Q08966	492 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ERG29	YMR134W	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ERG29	YMR134W	PCI8	P40512	444 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ERG29	YMR134W	DNM1	P54861	757 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ERG29	YMR134W	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ERG29	YMR134W	CRC1	Q12289	327 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ERG29	YMR134W	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ERG29	YMR134W	ASK1	P35734	292 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ERG29	YMR134W	SPC97	P38863	823 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ERG29	YMR134W	JHD1	P40034	492 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ERG29	YMR134W	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ERG29	YMR134W	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ERG29	YMR134W	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.84	□□□□□ -1.63	not detected
ERG29	YMR134W	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ERG29	YMR134W	YJL193W	P39542	402 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ERG29	YMR134W	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ERG29	YMR134W	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ERG29	YMR134W	VPS33	P20795	691 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ERG29	YMR134W	DID4	P36108	232 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ERG29	YMR134W	SAE2	P46946	345 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ERG29	YMR134W	YMR085W	P0CF18	432 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ERG29	YMR134W	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ERG29	YMR134W	AAC1	P04710	309 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ERG29	YMR134W	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ERG29	YMR134W	DGR2	P32330	852 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ERG29	YMR134W	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ERG29	YMR134W	TPO3	Q06451	622 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ERG29	YMR134W	HXT4	P32467	576 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ERG29	YMR134W	RGT1	P32862	1170 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ERG29	YMR134W	PXL1	P36166	706 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ERG29	YMR134W	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ERG29	YMR134W	YPL071C	Q02864	156 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ERG29	YMR134W	UME1	Q03010	460 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ERG29	YMR134W	UTP14	Q04500	899 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ERG29	YMR134W	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ERG29	YMR134W	NUP145	P49687	1317 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ERG29	YMR134W	YIL092W	P40497	633 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ERG29	YMR134W	HRD3	Q05787	833 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ERG29	YMR134W	YPR089W	O13585	888 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ERG29	YMR134W	PCK1	P10963	549 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ERG29	YMR134W	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ERG29	YMR134W	DSS4	P32601	143 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ERG29	YMR134W	YIL024C	P40543	189 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ERG29	YMR134W	PMT3	P47190	753 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ERG29	YMR134W	HER1	Q12276	1246 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ERG29	YMR134W	BI2	P03873	423 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ERG29	YMR134W	GPG1	P53130	126 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ERG29	YMR134W	PEF1	P53238	335 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ERG29	YMR134W	CYK3	Q07533	885 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ERG29	YMR134W	BET2	P20133	325 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ERG29	YMR134W	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 7.6 ms