RNA–Protein interactions for RNA: YLR407W

YLR407W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene YLR407W, Length 687 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLR407W	YLR407W	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YLR407W	YLR407W	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YLR407W	YLR407W	ECM1	P39715	212 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YLR407W	YLR407W	ARG2	P40360	574 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YLR407W	YLR407W	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YLR407W	YLR407W	SHR5	P41912	237 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YLR407W	YLR407W	HST1	P53685	503 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YLR407W	YLR407W	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YLR407W	YLR407W	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YLR407W	YLR407W	PSK2	Q08217	1101 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YLR407W	YLR407W	YOR131C	Q12486	218 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YLR407W	YLR407W	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YLR407W	YLR407W	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YLR407W	YLR407W	MATALPHA2	P0CY08	210 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YLR407W	YLR407W	HMLALPHA2	P0CY09	210 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YLR407W	YLR407W	SNF3	P10870	884 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YLR407W	YLR407W	CLC1	P17891	233 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YLR407W	YLR407W	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YLR407W	YLR407W	IMP2'	P32351	346 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YLR407W	YLR407W	GLG1	P36143	616 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YLR407W	YLR407W	VID28	P40547	921 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YLR407W	YLR407W	ARP5	P53946	755 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YLR407W	YLR407W	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YLR407W	YLR407W	TOM20	P35180	183 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YLR407W	YLR407W	RTS1	P38903	757 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YLR407W	YLR407W	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YLR407W	YLR407W	CTR1	P49573	406 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YLR407W	YLR407W	CTF18	P49956	741 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YLR407W	YLR407W	ZIP2	P53061	704 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YLR407W	YLR407W	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YLR407W	YLR407W	YDR514C	Q04408	483 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YLR407W	YLR407W	COG8	Q04632	607 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YLR407W	YLR407W	YLR407W	Q06070	228 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YLR407W	YLR407W	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YLR407W	YLR407W	YPL150W	Q12152	901 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YLR407W	YLR407W	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YLR407W	YLR407W	FLO1	P32768	1537 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YLR407W	YLR407W	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	PRX1	P34227	261 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	SHC1	P39000	512 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	CIR1	P42940	261 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	PIP2	P52960	996 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	PEX14	P53112	341 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	MYO3	P36006	1272 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	SFB3	P38810	929 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	GSM1	P42950	618 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	HUL5	P53119	910 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	DIF1	O13577	133 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	CBP3	P21560	335 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	MBR1	P23493	339 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	ANP1	P32629	500 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	MAL33	P38157	468 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	FMO1	P38866	432 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	MNN1	P39106	762 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	YGL081W	P53156	320 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	MTL1	P53214	551 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	RIM13	Q03792	727 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	TFC6	Q06339	672 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	MET7	Q08645	548 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	RAD61	Q99359	647 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	MYO1	P08964	1928 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
YLR407W	YLR407W	MAK31	P23059	88 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	RDS1	P25611	832 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	BMH2	P34730	273 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	UBS1	P38290	277 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	NUP82	P40368	713 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	RSM25	P40496	264 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	HUL4	P40985	892 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	ALG2	P43636	503 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	CRF1	Q04930	467 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	PCL8	Q08966	492 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	FLO11	P08640	1367 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	CIT1	P00890	479 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	MSM1	P22438	575 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	VPS34	P22543	875 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	RPN12	P32496	274 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	SPC29	P33419	253 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	MAL31	P38156	614 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	PAC2	P39937	518 aa		4.86	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 37 ms