RNA–Protein interactions for RNA: YLR168C

UPS2, Transcript of Mitochondrial intermembrane space protein, yeast

Gene UPS2, Length 693 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UPS2	YLR168C	KAE1	P36132	386 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UPS2	YLR168C	ATG21	Q02887	496 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UPS2	YLR168C	PLB2	Q03674	706 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UPS2	YLR168C	ADY4	Q05955	493 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UPS2	YLR168C	GRC3	Q07845	632 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UPS2	YLR168C	TRM11	Q12463	433 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UPS2	YLR168C	PGS1	P25578	521 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UPS2	YLR168C	PEX5	P35056	612 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UPS2	YLR168C	MAC1	P35192	417 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UPS2	YLR168C	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
UPS2	YLR168C	SIP4	P46954	829 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UPS2	YLR168C	POL31	P46957	487 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UPS2	YLR168C	YDL183C	P48569	320 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UPS2	YLR168C	VPS62	P53285	467 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UPS2	YLR168C	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
UPS2	YLR168C	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
UPS2	YLR168C	NRG1	Q03125	231 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UPS2	YLR168C	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
UPS2	YLR168C	TAF11	Q04226	346 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UPS2	YLR168C	PEX19	Q07418	342 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UPS2	YLR168C	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
UPS2	YLR168C	AIM41	Q12032	185 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UPS2	YLR168C	HMI1	Q12039	706 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UPS2	YLR168C	ZRT2	Q12436	422 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UPS2	YLR168C	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
UPS2	YLR168C	TPK1	P06244	397 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UPS2	YLR168C	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
UPS2	YLR168C	PEX1	P24004	1043 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UPS2	YLR168C	SWI3	P32591	825 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UPS2	YLR168C	TOA1	P32773	286 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UPS2	YLR168C	ESL2	P36168	1195 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UPS2	YLR168C	RPP1	P38786	293 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UPS2	YLR168C	SFB3	P38810	929 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UPS2	YLR168C	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	4.83	□□□□□ -1.64	not detected
UPS2	YLR168C	VFA1	P40080	203 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UPS2	YLR168C	KHA1	P40309	873 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UPS2	YLR168C	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
UPS2	YLR168C	BSC5	P53755	489 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UPS2	YLR168C	TRS31	Q03337	283 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UPS2	YLR168C	VPS64	Q03944	604 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UPS2	YLR168C	GAD1	Q04792	585 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UPS2	YLR168C	TGL5	Q12043	749 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UPS2	YLR168C	NBP2	Q12163	236 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UPS2	YLR168C	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
UPS2	YLR168C	CYC7	P00045	113 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UPS2	YLR168C	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
UPS2	YLR168C	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
UPS2	YLR168C	CDC6	P09119	513 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UPS2	YLR168C	HOM3	P10869	527 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UPS2	YLR168C	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
UPS2	YLR168C	OPI1	P21957	404 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UPS2	YLR168C	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
UPS2	YLR168C	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
UPS2	YLR168C	CTF13	P35203	478 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UPS2	YLR168C	YBR225W	P38321	900 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UPS2	YLR168C	FTR1	P40088	404 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UPS2	YLR168C	YJR061W	P40355	935 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UPS2	YLR168C	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
UPS2	YLR168C	GCV2	P49095	1034 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UPS2	YLR168C	INP52	P50942	1183 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UPS2	YLR168C	RSC1	P53236	928 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UPS2	YLR168C	YGR130C	P53278	816 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UPS2	YLR168C	FDC1	Q03034	503 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UPS2	YLR168C	FCP1	Q03254	732 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UPS2	YLR168C	ROT1	Q03691	256 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UPS2	YLR168C	DUS4	Q06063	367 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UPS2	YLR168C	YLR352W	Q06479	807 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UPS2	YLR168C	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
UPS2	YLR168C	GPB1	Q08886	897 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UPS2	YLR168C	COX17	Q12287	69 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UPS2	YLR168C	SKM1	Q12469	655 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UPS2	YLR168C	ECM3	Q99252	613 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UPS2	YLR168C	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
UPS2	YLR168C	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
UPS2	YLR168C	SEC15	P22224	910 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UPS2	YLR168C	SGF29	P25554	259 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UPS2	YLR168C	DCG1	P32460	244 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UPS2	YLR168C	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
UPS2	YLR168C	GET2	P40056	285 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UPS2	YLR168C	LYS14	P40971	790 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UPS2	YLR168C	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
UPS2	YLR168C	RMD8	P43620	662 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UPS2	YLR168C	SNO2	P53823	222 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UPS2	YLR168C	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
UPS2	YLR168C	TIM10	P87108	93 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UPS2	YLR168C	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
UPS2	YLR168C	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
UPS2	YLR168C	RCO1	Q04779	684 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UPS2	YLR168C	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
UPS2	YLR168C	THI22	Q06490	572 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UPS2	YLR168C	AIM6	Q07716	390 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UPS2	YLR168C	YOR352W	Q08816	343 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UPS2	YLR168C	NPC2	Q12408	173 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UPS2	YLR168C	PCD1	Q12524	340 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UPS2	YLR168C	SEC12	P11655	471 aa		4.8	□□□□□ -1.64
UPS2	YLR168C	SPO16	P17122	198 aa		4.8	□□□□□ -1.64
UPS2	YLR168C	EMC1	P25574	760 aa		4.8	□□□□□ -1.64
UPS2	YLR168C	PXA2	P34230	853 aa		4.8	□□□□□ -1.64
UPS2	YLR168C	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
UPS2	YLR168C	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64

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