RNA–Protein interactions for RNA: YJL178C

ATG27, Transcript of Type I membrane protein involved in autophagy and the Cvt pathway, yeast

Gene ATG27, Length 816 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG27	YJL178C	PXA1	P41909	870 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	NIT2	P47016	307 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	YGR151C	P53287	111 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	SPO1	P53541	631 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	COG6	P53959	839 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	YDL086W	Q07505	273 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	TRE2	Q08693	809 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	RMP1	Q12530	201 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATG27	YJL178C	AEP2	P22136	580 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATG27	YJL178C	KCC4	P25389	1037 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATG27	YJL178C	HXT4	P32467	576 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATG27	YJL178C	PPZ2	P33329	710 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATG27	YJL178C	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
ATG27	YJL178C	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
ATG27	YJL178C	KHA1	P40309	873 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATG27	YJL178C	NSE5	Q03718	556 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATG27	YJL178C	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.08	□□□□□ -1.76	not detected
ATG27	YJL178C	PDR12	Q02785	1511 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATG27	YJL178C	CAT8	P39113	1433 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATG27	YJL178C	SPO11	P23179	398 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATG27	YJL178C	ADY2	P25613	283 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATG27	YJL178C	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
ATG27	YJL178C	TFC4	P33339	1025 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATG27	YJL178C	APL3	P38065	1025 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATG27	YJL178C	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
ATG27	YJL178C	YEL020C	P39994	560 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATG27	YJL178C	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
ATG27	YJL178C	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
ATG27	YJL178C	TAF4	P50105	388 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATG27	YJL178C	SKY1	Q03656	742 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATG27	YJL178C	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
ATG27	YJL178C	NUP157	P40064	1391 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
ATG27	YJL178C	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
ATG27	YJL178C	TUP1	P16649	713 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATG27	YJL178C	PRE4	P30657	266 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATG27	YJL178C	DGR2	P32330	852 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATG27	YJL178C	PLC1	P32383	869 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATG27	YJL178C	PEX2	P32800	271 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATG27	YJL178C	CDS1	P38221	457 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATG27	YJL178C	PAF1	P38351	445 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATG27	YJL178C	YHR033W	P38690	423 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATG27	YJL178C	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
ATG27	YJL178C	MUP3	P38734	546 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATG27	YJL178C	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
ATG27	YJL178C	ARO10	Q06408	635 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATG27	YJL178C	NDJ1	Q12366	352 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATG27	YJL178C	MET5	P47169	1442 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATG27	YJL178C	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
ATG27	YJL178C	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATG27	YJL178C	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	4.05	□□□□□ -1.76	not detected
ATG27	YJL178C	TMN3	P40071	706 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATG27	YJL178C	MRK1	P50873	501 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATG27	YJL178C	SPC105	P53148	917 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATG27	YJL178C	NMA2	P53204	395 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATG27	YJL178C	TIM50	Q02776	476 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATG27	YJL178C	FDC1	Q03034	503 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATG27	YJL178C	HLR1	Q04429	423 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATG27	YJL178C	UFO1	Q04511	668 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATG27	YJL178C	IZH3	Q07959	543 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATG27	YJL178C	RKI1	Q12189	258 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATG27	YJL178C	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.04	□□□□□ -1.76	not detected
ATG27	YJL178C	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
ATG27	YJL178C	MRC1	P25588	1096 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATG27	YJL178C	MTC7	P32633	139 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATG27	YJL178C	FTR1	P40088	404 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATG27	YJL178C	PRM2	P40534	656 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATG27	YJL178C	PEX14	P53112	341 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATG27	YJL178C	SPC98	P53540	846 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATG27	YJL178C	SRB8	P25648	1427 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATG27	YJL178C	YSP2	Q06681	1438 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATG27	YJL178C	LAM4	P38800	1345 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATG27	YJL178C	ELF1	P36053	145 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATG27	YJL178C	PAC2	P39937	518 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATG27	YJL178C	EAF5	P39995	279 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATG27	YJL178C	IMO32	P53219	342 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATG27	YJL178C	DIP5	P53388	608 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATG27	YJL178C	SNF12	P53628	566 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATG27	YJL178C	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
ATG27	YJL178C	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATG27	YJL178C	YLR464W	P0CX17	216 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATG27	YJL178C	TOM20	P35180	183 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATG27	YJL178C	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
ATG27	YJL178C	YMC2	P38087	329 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATG27	YJL178C	EHT1	P38295	451 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATG27	YJL178C	YEL076C	P39971	216 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATG27	YJL178C	MIT1	P40002	666 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATG27	YJL178C	PEA2	P40091	420 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATG27	YJL178C	PMT6	P42934	759 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATG27	YJL178C	SLD3	P53135	668 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATG27	YJL178C	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
ATG27	YJL178C	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
ATG27	YJL178C	YDR179W-A	Q03983	463 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATG27	YJL178C	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
ATG27	YJL178C	IRC5	P43610	853 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATG27	YJL178C	YDL183C	P48569	320 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATG27	YJL178C	COQ11	Q05892	277 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATG27	YJL178C	YOR378W	Q08902	515 aa		4.01	□□□□□ -1.77

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