RNA–Protein interactions for RNA: YHR009C

TDA3, Transcript of Putative oxidoreductase involved in late endosome to Golgi transport, yeast

Gene TDA3, Length 1,572 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TDA3	YHR009C	YER010C	P40011	234 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TDA3	YHR009C	ESL1	P40456	1118 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TDA3	YHR009C	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TDA3	YHR009C	POL31	P46957	487 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TDA3	YHR009C	IMA1	P53051	589 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TDA3	YHR009C	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TDA3	YHR009C	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TDA3	YHR009C	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TDA3	YHR009C	PCK1	P10963	549 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TDA3	YHR009C	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TDA3	YHR009C	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TDA3	YHR009C	MRPL36	P36531	177 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TDA3	YHR009C	YIL077C	P40508	320 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TDA3	YHR009C	YIR042C	P40586	236 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TDA3	YHR009C	SAP4	P53036	818 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TDA3	YHR009C	FDC1	Q03034	503 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TDA3	YHR009C	ARA2	Q04212	335 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TDA3	YHR009C	YFT2	Q06676	274 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TDA3	YHR009C	LAS17	Q12446	633 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TDA3	YHR009C	BIK1	P11709	440 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TDA3	YHR009C	BET2	P20133	325 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TDA3	YHR009C	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TDA3	YHR009C	BCS1	P32839	456 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TDA3	YHR009C	FMO1	P38866	432 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TDA3	YHR009C	UME6	P39001	836 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TDA3	YHR009C	NUP60	P39705	539 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TDA3	YHR009C	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TDA3	YHR009C	VFA1	P40080	203 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TDA3	YHR009C	CAB2	P40506	365 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TDA3	YHR009C	SRB7	P47822	140 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TDA3	YHR009C	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TDA3	YHR009C	CBK1	P53894	756 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TDA3	YHR009C	ADY4	Q05955	493 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TDA3	YHR009C	SDH5	Q08230	162 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TDA3	YHR009C	ENB1	Q08299	606 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TDA3	YHR009C	ENT1	Q12518	454 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TDA3	YHR009C	AAC3	P18238	307 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TDA3	YHR009C	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TDA3	YHR009C	CBF2	P32504	956 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TDA3	YHR009C	PAH1	P32567	862 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TDA3	YHR009C	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TDA3	YHR009C	BST1	P43571	1029 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TDA3	YHR009C	AMA1	P50082	593 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TDA3	YHR009C	TIM50	Q02776	476 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TDA3	YHR009C	TRS31	Q03337	283 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TDA3	YHR009C	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TDA3	YHR009C	ICL2	Q12031	575 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TDA3	YHR009C	SOD2	P00447	233 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TDA3	YHR009C	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.6	□□□□□ -1.67	not detected
TDA3	YHR009C	DCG1	P32460	244 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TDA3	YHR009C	LST4	P34239	828 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TDA3	YHR009C	YBR053C	P38235	358 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TDA3	YHR009C	YEL068C	P39977	110 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TDA3	YHR009C	ECL1	P48235	211 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TDA3	YHR009C	MUP1	P50276	574 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TDA3	YHR009C	ATG21	Q02887	496 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TDA3	YHR009C	VPS64	Q03944	604 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TDA3	YHR009C	FOB1	O13329	566 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TDA3	YHR009C	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TDA3	YHR009C	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TDA3	YHR009C	YCR015C	P25616	317 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TDA3	YHR009C	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TDA3	YHR009C	RAD16	P31244	790 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TDA3	YHR009C	NFU1	P32860	256 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TDA3	YHR009C	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TDA3	YHR009C	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TDA3	YHR009C	STB5	P38699	743 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TDA3	YHR009C	TMN3	P40071	706 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TDA3	YHR009C	LRO1	P40345	661 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TDA3	YHR009C	RIC1	P40395	1056 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TDA3	YHR009C	RFX1	P48743	811 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TDA3	YHR009C	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TDA3	YHR009C	INP52	P50942	1183 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TDA3	YHR009C	SNO4	Q04902	237 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TDA3	YHR009C	ARR3	Q06598	404 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TDA3	YHR009C	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TDA3	YHR009C	HSP32	Q08992	237 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TDA3	YHR009C	ERP4	Q12450	207 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TDA3	YHR009C	PCD1	Q12524	340 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TDA3	YHR009C	SEC12	P11655	471 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TDA3	YHR009C	VPS33	P20795	691 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TDA3	YHR009C	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TDA3	YHR009C	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TDA3	YHR009C	PIG2	P40187	538 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TDA3	YHR009C	DLT1	Q04216	342 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TDA3	YHR009C	AIM6	Q07716	390 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TDA3	YHR009C	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TDA3	YHR009C	COX17	Q12287	69 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TDA3	YHR009C	SEM1	O94742	89 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TDA3	YHR009C	CTT1	P06115	562 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TDA3	YHR009C	MET3	P08536	511 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TDA3	YHR009C	CDC16	P09798	840 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TDA3	YHR009C	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TDA3	YHR009C	PRP28	P23394	588 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TDA3	YHR009C	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TDA3	YHR009C	CNS1	P33313	385 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TDA3	YHR009C	YJL193W	P39542	402 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TDA3	YHR009C	UBC11	P52492	156 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TDA3	YHR009C	TEL2	P53038	688 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TDA3	YHR009C	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68

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