RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000214095.1

Ubp1-204, Transcript of Upstream-binding protein 1, mousemouse

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ubp1, Length 2,320 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Speer4dL7N216 212 aa26.05■■□□□ 1.76
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Ubp1-204ENSMUST00000214095 Lama4P97927 1816 aa26.05■■□□□ 1.76
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Myh2G3UW82 1942 aa26.05■■□□□ 1.76
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Sycp2lA0A0M3U1B0 842 aa26.04■■□□□ 1.76
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Ubp1-204ENSMUST00000214095 Fbxo2Q80UW2 297 aa26.04■■□□□ 1.76
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Ubp1-204ENSMUST00000214095 Trim34aQ99PP6 485 aa25.97■■□□□ 1.75
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Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ddx54Q8K4L0 874 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tnnt2P50752 301 aa25.95■■□□□ 1.74
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ddx27Q921N6 760 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
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Ubp1-204ENSMUST00000214095 Zbtb7aO88939 569 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Vps33aQ9D2N9 598 aa25.94■■□□□ 1.74
Ubp1-204ENSMUST00000214095 CoblQ5NBX1 1337 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ccdc121E9Q6D3 323 aa25.94■■□□□ 1.74
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