Protein–RNA interactions for Protein: A0A0M3U1B0

Sycp2l, Synaptonemal complex protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC39.96■■■■□ 3.99
Sycp2lA0A0M3U1B0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Sycp2lA0A0M3U1B0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
Sycp2lA0A0M3U1B0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Sycp2lA0A0M3U1B0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
Sycp2lA0A0M3U1B0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Sycp2lA0A0M3U1B0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
Sycp2lA0A0M3U1B0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Sycp2lA0A0M3U1B0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Sycp2lA0A0M3U1B0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
Sycp2lA0A0M3U1B0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Sycp2lA0A0M3U1B0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Sycp2lA0A0M3U1B0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Sycp2lA0A0M3U1B0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Sycp2lA0A0M3U1B0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Sycp2lA0A0M3U1B0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
Sycp2lA0A0M3U1B0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Sycp2lA0A0M3U1B0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Sycp2lA0A0M3U1B0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Sycp2lA0A0M3U1B0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Sycp2lA0A0M3U1B0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Sycp2lA0A0M3U1B0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
Sycp2lA0A0M3U1B0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Sycp2lA0A0M3U1B0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Sycp2lA0A0M3U1B0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Sycp2lA0A0M3U1B0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33.2■■■□□ 2.9
Sycp2lA0A0M3U1B0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Sycp2lA0A0M3U1B0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Sycp2lA0A0M3U1B0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Sycp2lA0A0M3U1B0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Sycp2lA0A0M3U1B0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Sycp2lA0A0M3U1B0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Sycp2lA0A0M3U1B0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Sycp2lA0A0M3U1B0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
Sycp2lA0A0M3U1B0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Sycp2lA0A0M3U1B0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Sycp2lA0A0M3U1B0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Sycp2lA0A0M3U1B0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
Sycp2lA0A0M3U1B0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Sycp2lA0A0M3U1B0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Sycp2lA0A0M3U1B0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Sycp2lA0A0M3U1B0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Sycp2lA0A0M3U1B0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Sycp2lA0A0M3U1B0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Sycp2lA0A0M3U1B0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Sycp2lA0A0M3U1B0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Sycp2lA0A0M3U1B0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Sycp2lA0A0M3U1B0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Sycp2lA0A0M3U1B0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Sycp2lA0A0M3U1B0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Sycp2lA0A0M3U1B0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Sycp2lA0A0M3U1B0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Sycp2lA0A0M3U1B0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Sycp2lA0A0M3U1B0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Sycp2lA0A0M3U1B0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
Sycp2lA0A0M3U1B0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Sycp2lA0A0M3U1B0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Sycp2lA0A0M3U1B0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms