RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608453.1

PRKCQ-AS1-208, PRKCQ antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PRKCQ-AS1, Length 587 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 SLAMF6Q96DU3 332 aa0.33□□□□□ -2.36
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 C2orf50Q96LR7 162 aa0.33□□□□□ -2.36
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 GPER1Q99527 375 aa0.33□□□□□ -2.36
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 MDN1Q9NU22 5596 aa0.33□□□□□ -2.36
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 CACNA1EQ15878 2313 aa0.33□□□□□ -2.36
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa0.32□□□□□ -2.36
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa0.32□□□□□ -2.36
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa0.32□□□□□ -2.36
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 A8MT66 165 aa0.32□□□□□ -2.36
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 J3QRK9 145 aa0.32□□□□□ -2.36
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 SERPINE1P05121 402 aa0.32□□□□□ -2.36
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 FAM236CP0DP71 79 aa0.32□□□□□ -2.36
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 KDELR1P24390 212 aa0.32□□□□□ -2.36
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 LINC00575Q6W349 94 aa0.32□□□□□ -2.36
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 GDPD1Q8N9F7 314 aa0.32□□□□□ -2.36
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 WFDC5Q8TCV5 224 aa0.32□□□□□ -2.36
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 CT55Q8WUE5 264 aa0.32□□□□□ -2.36
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 BORCS7Q96B45 105 aa0.32□□□□□ -2.36
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa0.31□□□□□ -2.36
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 PPIBP23284 216 aaKnown RBP0.31□□□□□ -2.36
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP0.31□□□□□ -2.36
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP0.31□□□□□ -2.36
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP0.31□□□□□ -2.36
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 TP53RKQ96S44 253 aa0.31□□□□□ -2.36
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 PRADC1Q9BSG0 188 aa0.31□□□□□ -2.36
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 MED29Q9NX70 200 aa0.31□□□□□ -2.36
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 CLDN24A6NM45 220 aa0.3□□□□□ -2.36
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 NUPR1O60356 82 aa0.3□□□□□ -2.36
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 TIMM17BO60830 172 aa0.3□□□□□ -2.36
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 CD2P06729 351 aa0.3□□□□□ -2.36
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 OMPP47874 163 aa0.3□□□□□ -2.36
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 TEN1Q86WV5 123 aa0.3□□□□□ -2.36
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 CLDN22Q8N7P3 220 aa0.3□□□□□ -2.36
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 TSKUQ8WUA8 353 aa0.3□□□□□ -2.36
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP0.3□□□□□ -2.36
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 HECW1Q76N89 1606 aa0.3□□□□□ -2.36
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 H3BRM9 83 aa0.29□□□□□ -2.36
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 M0R378 163 aa0.29□□□□□ -2.36
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP0.29□□□□□ -2.36
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 CNIH1O95406 144 aa0.29□□□□□ -2.36
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 ZNF682O95780 498 aa0.29□□□□□ -2.36
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 SRP14P37108 136 aaKnown RBP0.29□□□□□ -2.36
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 DYNLT1P63172 113 aa0.29□□□□□ -2.36
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 HIST1H3AP68431 136 aa0.29□□□□□ -2.36
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 H3F3AP84243 136 aa0.29□□□□□ -2.36
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 LYRM7Q5U5X0 104 aa0.29□□□□□ -2.36
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa0.29□□□□□ -2.36
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 SLC25A40Q8TBP6 338 aa0.29□□□□□ -2.36
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 PRRT1Q99946 306 aa0.29□□□□□ -2.36
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 PSTPIP2Q9H939 334 aa0.29□□□□□ -2.36
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 TMEM138Q9NPI0 162 aa0.29□□□□□ -2.36
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 PLAC8Q9NZF1 115 aa0.29□□□□□ -2.36
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP0.29□□□□□ -2.36
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 NEO1Q92859 1461 aa0.29□□□□□ -2.36
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa0.28□□□□□ -2.36
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 HECW2Q9P2P5 1572 aa0.28□□□□□ -2.36
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 SMIM9A6NGZ8 99 aa0.28□□□□□ -2.36
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 F8W1H4 67 aa0.28□□□□□ -2.36
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 SPINK7P58062 85 aa0.28□□□□□ -2.36
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 DEFA3P59666 94 aa0.28□□□□□ -2.36
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 EDDM3AQ14507 147 aa0.28□□□□□ -2.36
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 RGS21Q2M5E4 152 aa0.28□□□□□ -2.36
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 C12orf74Q32Q52 190 aa0.28□□□□□ -2.36
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP0.28□□□□□ -2.36
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 PSMF1Q92530 271 aa0.28□□□□□ -2.36
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 ARL5BQ96KC2 179 aa0.28□□□□□ -2.36
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 TVP23BQ9NYZ1 205 aa0.28□□□□□ -2.36
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 ROBO3Q96MS0 1386 aa0.28□□□□□ -2.36
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP0.28□□□□□ -2.37
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 TNS3Q68CZ2 1445 aa0.28□□□□□ -2.37
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 A0A087WUJ7 227 aa0.27□□□□□ -2.37
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 hADV38S2A0JD32 116 aa0.27□□□□□ -2.37
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 NIPSNAP2O75323 286 aa0.27□□□□□ -2.37
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 Q6Q795 121 aa0.27□□□□□ -2.37
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 C4orf22Q6V702 233 aa0.27□□□□□ -2.37
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa0.27□□□□□ -2.37
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa0.27□□□□□ -2.37
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP0.27□□□□□ -2.37
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 CANT1Q8WVQ1 401 aa0.27□□□□□ -2.37
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP0.27□□□□□ -2.37
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 CCDC42Q96M95 316 aa0.27□□□□□ -2.37
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 LINC00052Q96N35 136 aa0.27□□□□□ -2.37
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 LINC00467Q9BRT7 94 aa0.27□□□□□ -2.37
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 TRIM4Q9C037 500 aa0.27□□□□□ -2.37
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 TMEM133Q9H2Q1 129 aa0.27□□□□□ -2.37
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 PARVBQ9HBI1 364 aa0.27□□□□□ -2.37
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP0.27□□□□□ -2.37
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP0.27□□□□□ -2.37
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 SBF1O95248 1867 aa0.27□□□□□ -2.37
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 ALPK3Q96L96 1907 aa0.26□□□□□ -2.37
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 MUC5ACP98088 5654 aa0.26□□□□□ -2.37
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 C8GP07360 202 aa0.26□□□□□ -2.37
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 CEBPGP53567 150 aa0.26□□□□□ -2.37
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 OR5D14Q8NGL3 314 aa0.26□□□□□ -2.37
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 UQCC1Q9NVA1 299 aa0.26□□□□□ -2.37
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa0.26□□□□□ -2.37
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 ADCY9O60503 1353 aa0.26□□□□□ -2.37
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP0.26□□□□□ -2.37
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 KCPQ6ZWJ8 1503 aa0.25□□□□□ -2.37
PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 FRAS1Q86XX4 4008 aa0.25□□□□□ -2.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.5 ms